help/html/features/jalarchive.html

   1 <html>\r
   2 <head>\r
   3 <title>Jalview Archives</title>\r
   4 </head>\r
   5 <body>\r
   6 \r
   7 <p><strong>Jalview Project Archives</strong>\r
   8 </p>\r
   9 \r
  10 <p>These are java archives of an XML file containing alignments, trees and Jalview \r
  11   display information. A data exchange standard is currently being developed, \r
  12   so there is no stable schema yet, but Jalview web services will soon make use \r
  13   of the same interchange format.</p>\r
  14 <p>For those who want to know...<br>\r
  15   Jalview uses java classes automatically created using <a href="http://www.castor.org">Castor</a>. \r
  16   Jalview 2.08 uses descriptor classes which significantly increase the speed \r
  17   of marshalling / unmarshalling java objects into XML. Files created prior to \r
  18   Jalview 2.08 can still be read in, but they will be saved in the new format. \r
  19 </p>\r
  20 </body>\r
  21 </html>\r