runner/compbio/runner/psiblast/PsiBlast.java

   1 /* Copyright (c) 2009 Peter Troshin\r
   2  *  \r
   3  *  JAva Bioinformatics Analysis Web Services (JABAWS) @version: 1.0\r
   4  * \r
   5  *  This library is free software; you can redistribute it and/or modify it under the terms of the\r
   6  *  Apache License version 2 as published by the Apache Software Foundation\r
   7  * \r
   8  *  This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without\r
   9  *  even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the Apache \r
  10  *  License for more details.\r
  11  * \r
  12  *  A copy of the license is in apache_license.txt. It is also available here:\r
  13  * @see: http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0.txt\r
  14  * \r
  15  * Any republication or derived work distributed in source code form\r
  16  * must include this copyright and license notice.\r
  17  */\r
  18 \r
  19 package compbio.runner.psiblast;\r
  20 \r
  21 import compbio.engine.client.Executable;\r
  22 import compbio.engine.client.SkeletalExecutable;\r
  23 import compbio.metadata.ResultNotAvailableException;\r
  24 \r
  25 public class PsiBlast extends SkeletalExecutable<PsiBlast> {\r
  26 \r
  27         public PsiBlast() {\r
  28 \r
  29         }\r
  30 \r
  31         void getSupportedDatabases() {\r
  32 \r
  33         }\r
  34 \r
  35         @Override\r
  36         public <V> V getResults(String directory)\r
  37                         throws ResultNotAvailableException {\r
  38                 // TODO Auto-generated method stub\r
  39                 return null;\r
  40         }\r
  41 \r
  42         @Override\r
  43         public Class<Executable<PsiBlast>> getType() {\r
  44                 // TODO Auto-generated method stub\r
  45                 return null;\r
  46         }\r
  47 \r
  48 }\r