src/uk/ac/ebi/www/WSWUBlastSoapBindingStub.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
   3  * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package uk.ac.ebi.www;
  22
  23 public class WSWUBlastSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
  24         implements uk.ac.ebi.www.WSWUBlast
  25 {
  26   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  27
  28   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  29
  30   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  31
  32   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  33
  34   public WSWUBlastSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
  35   {
  36     this(null);
  37   }
  38
  39   public WSWUBlastSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
  40           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
  41   {
  42     this(service);
  43     super.cachedEndpoint = endpointURL;
  44   }
  45
  46   public WSWUBlastSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
  47           throws org.apache.axis.AxisFault
  48   {
  49     if (service == null)
  50     {
  51       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
  52     }
  53     else
  54     {
  55       super.service = service;
  56     }
  57     java.lang.Class cls;
  58     javax.xml.namespace.QName qName;
  59     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
  60     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
  61     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
  62     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
  63     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
  64     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
  65     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
  66     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
  67     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast",
  68             "inputParams");
  69     cachedSerQNames.add(qName);
  70     cls = uk.ac.ebi.www.InputParams.class;
  71     cachedSerClasses.add(cls);
  72     cachedSerFactories.add(beansf);
  73     cachedDeserFactories.add(beandf);
  74
  75     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast",
  76             "WSArrayofFile");
  77     cachedSerQNames.add(qName);
  78     cls = uk.ac.ebi.www.WSFile[].class;
  79     cachedSerClasses.add(cls);
  80     cachedSerFactories.add(arraysf);
  81     cachedDeserFactories.add(arraydf);
  82
  83     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast",
  84             "WSArrayofData");
  85     cachedSerQNames.add(qName);
  86     cls = uk.ac.ebi.www.Data[].class;
  87     cachedSerClasses.add(cls);
  88     cachedSerFactories.add(arraysf);
  89     cachedDeserFactories.add(arraydf);
  90
  91     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast",
  92             "data");
  93     cachedSerQNames.add(qName);
  94     cls = uk.ac.ebi.www.Data.class;
  95     cachedSerClasses.add(cls);
  96     cachedSerFactories.add(beansf);
  97     cachedDeserFactories.add(beandf);
  98
  99     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast",
 100             "WSFile");
 101     cachedSerQNames.add(qName);
 102     cls = uk.ac.ebi.www.WSFile.class;
 103     cachedSerClasses.add(cls);
 104     cachedSerFactories.add(beansf);
 105     cachedDeserFactories.add(beandf);
 106
 107   }
 108
 109   private org.apache.axis.client.Call createCall()
 110           throws java.rmi.RemoteException
 111   {
 112     try
 113     {
 114       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 115               .createCall();
 116       if (super.maintainSessionSet)
 117       {
 118         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 119       }
 120       if (super.cachedUsername != null)
 121       {
 122         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 123       }
 124       if (super.cachedPassword != null)
 125       {
 126         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 127       }
 128       if (super.cachedEndpoint != null)
 129       {
 130         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 131       }
 132       if (super.cachedTimeout != null)
 133       {
 134         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 135       }
 136       if (super.cachedPortName != null)
 137       {
 138         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 139       }
 140       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 141       while (keys.hasMoreElements())
 142       {
 143         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 144         if (_call.isPropertySupported(key))
 145         {
 146           _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 147         }
 148         // else
 149         // _call.setScopedProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 150       }
 151       // All the type mapping information is registered
 152       // when the first call is made.
 153       // The type mapping information is actually registered in
 154       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 155       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 156       synchronized (this)
 157       {
 158         if (firstCall())
 159         {
 160           // must set encoding style before registering serializers
 161           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 162           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 163           {
 164             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 165             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 166                     .get(i);
 167             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 168                     .get(i);
 169             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 170                     .get(i);
 171             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 172           }
 173         }
 174       }
 175       return _call;
 176     } catch (java.lang.Throwable t)
 177     {
 178       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 179               "Failure trying to get the Call object", t);
 180     }
 181   }
 182
 183   public byte[] poll(java.lang.String jobid, java.lang.String type)
 184           throws java.rmi.RemoteException
 185   {
 186     if (super.cachedEndpoint == null)
 187     {
 188       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 189     }
 190     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 191     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobid"),
 192             new javax.xml.namespace.QName(
 193                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 194             java.lang.String.class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 195     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "type"),
 196             new javax.xml.namespace.QName(
 197                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 198             java.lang.String.class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 199     _call.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 200             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "base64Binary"),
 201             byte[].class);
 202     _call.setUseSOAPAction(true);
 203     _call.setSOAPActionURI("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast#poll");
 204     _call.setOperationStyle("rpc");
 205     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 206             "http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast", "poll"));
 207
 208     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { jobid,
 209         type });
 210
 211     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 212     {
 213       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 214     }
 215     else
 216     {
 217       try
 218       {
 219         return (byte[]) _resp;
 220       } catch (java.lang.Exception _exception)
 221       {
 222         return (byte[]) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(_resp,
 223                 byte[].class);
 224       }
 225     }
 226   }
 227
 228   public java.lang.String runWUBlast(uk.ac.ebi.www.InputParams params,
 229           uk.ac.ebi.www.Data[] content) throws java.rmi.RemoteException
 230   {
 231     if (super.cachedEndpoint == null)
 232     {
 233       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 234     }
 235     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 236     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "params"),
 237             new javax.xml.namespace.QName("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast",
 238                     "inputParams"), uk.ac.ebi.www.InputParams.class,
 239             javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 240     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "content"),
 241             new javax.xml.namespace.QName("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast",
 242                     "WSArrayofData"), uk.ac.ebi.www.Data[].class,
 243             javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 244     _call.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 245             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 246             java.lang.String.class);
 247     _call.setUseSOAPAction(true);
 248     _call.setSOAPActionURI("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast#runWUBlast");
 249     _call.setOperationStyle("rpc");
 250     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 251             "http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast", "runWUBlast"));
 252
 253     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { params,
 254         content });
 255
 256     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 257     {
 258       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 259     }
 260     else
 261     {
 262       try
 263       {
 264         return (java.lang.String) _resp;
 265       } catch (java.lang.Exception _exception)
 266       {
 267         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 268                 _resp, java.lang.String.class);
 269       }
 270     }
 271   }
 272
 273   public byte[] test(java.lang.String jobid, java.lang.String type)
 274           throws java.rmi.RemoteException
 275   {
 276     if (super.cachedEndpoint == null)
 277     {
 278       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 279     }
 280     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 281     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobid"),
 282             new javax.xml.namespace.QName(
 283                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 284             java.lang.String.class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 285     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "type"),
 286             new javax.xml.namespace.QName(
 287                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 288             java.lang.String.class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 289     _call.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 290             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "base64Binary"),
 291             byte[].class);
 292     _call.setUseSOAPAction(true);
 293     _call.setSOAPActionURI("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast#test");
 294     _call.setOperationStyle("rpc");
 295     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 296             "http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast", "test"));
 297
 298     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { jobid,
 299         type });
 300
 301     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 302     {
 303       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 304     }
 305     else
 306     {
 307       try
 308       {
 309         return (byte[]) _resp;
 310       } catch (java.lang.Exception _exception)
 311       {
 312         return (byte[]) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(_resp,
 313                 byte[].class);
 314       }
 315     }
 316   }
 317
 318   public java.lang.String checkStatus(java.lang.String jobid)
 319           throws java.rmi.RemoteException
 320   {
 321     if (super.cachedEndpoint == null)
 322     {
 323       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 324     }
 325     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 326     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobid"),
 327             new javax.xml.namespace.QName(
 328                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 329             java.lang.String.class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 330     _call.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 331             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 332             java.lang.String.class);
 333     _call.setUseSOAPAction(true);
 334     _call.setSOAPActionURI("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast#checkStatus");
 335     _call.setOperationStyle("rpc");
 336     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 337             "http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast", "checkStatus"));
 338
 339     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { jobid });
 340
 341     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 342     {
 343       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 344     }
 345     else
 346     {
 347       try
 348       {
 349         return (java.lang.String) _resp;
 350       } catch (java.lang.Exception _exception)
 351       {
 352         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 353                 _resp, java.lang.String.class);
 354       }
 355     }
 356   }
 357
 358   public uk.ac.ebi.www.WSFile[] getResults(java.lang.String jobid)
 359           throws java.rmi.RemoteException
 360   {
 361     if (super.cachedEndpoint == null)
 362     {
 363       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 364     }
 365     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 366     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobid"),
 367             new javax.xml.namespace.QName(
 368                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 369             java.lang.String.class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 370     _call.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 371             "http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast", "WSArrayofFile"),
 372             uk.ac.ebi.www.WSFile[].class);
 373     _call.setUseSOAPAction(true);
 374     _call.setSOAPActionURI("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast#getResults");
 375     _call.setOperationStyle("rpc");
 376     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 377             "http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast", "getResults"));
 378
 379     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { jobid });
 380
 381     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 382     {
 383       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 384     }
 385     else
 386     {
 387       try
 388       {
 389         return (uk.ac.ebi.www.WSFile[]) _resp;
 390       } catch (java.lang.Exception _exception)
 391       {
 392         return (uk.ac.ebi.www.WSFile[]) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 393                 .convert(_resp, uk.ac.ebi.www.WSFile[].class);
 394       }
 395     }
 396   }
 397
 398   public byte[] polljob(java.lang.String jobid, java.lang.String outformat)
 399           throws java.rmi.RemoteException
 400   {
 401     if (super.cachedEndpoint == null)
 402     {
 403       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 404     }
 405     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 406     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobid"),
 407             new javax.xml.namespace.QName(
 408                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 409             java.lang.String.class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 410     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "outformat"),
 411             new javax.xml.namespace.QName(
 412                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 413             java.lang.String.class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 414     _call.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 415             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "base64Binary"),
 416             byte[].class);
 417     _call.setUseSOAPAction(true);
 418     _call.setSOAPActionURI("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast#polljob");
 419     _call.setOperationStyle("rpc");
 420     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 421             "http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast", "polljob"));
 422
 423     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { jobid,
 424         outformat });
 425
 426     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 427     {
 428       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 429     }
 430     else
 431     {
 432       try
 433       {
 434         return (byte[]) _resp;
 435       } catch (java.lang.Exception _exception)
 436       {
 437         return (byte[]) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(_resp,
 438                 byte[].class);
 439       }
 440     }
 441   }
 442
 443   public byte[] doWUBlast(uk.ac.ebi.www.InputParams params, byte[] content)
 444           throws java.rmi.RemoteException
 445   {
 446     if (super.cachedEndpoint == null)
 447     {
 448       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 449     }
 450     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 451     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "params"),
 452             new javax.xml.namespace.QName("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast",
 453                     "inputParams"), uk.ac.ebi.www.InputParams.class,
 454             javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 455     _call.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "content"),
 456             new javax.xml.namespace.QName(
 457                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "base64Binary"),
 458             byte[].class, javax.xml.rpc.ParameterMode.IN);
 459     _call.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 460             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "base64Binary"),
 461             byte[].class);
 462     _call.setUseSOAPAction(true);
 463     _call.setSOAPActionURI("http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast#doWUBlast");
 464     _call.setOperationStyle("rpc");
 465     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 466             "http://www.ebi.ac.uk/WSWUBlast", "doWUBlast"));
 467
 468     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { params,
 469         content });
 470
 471     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 472     {
 473       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 474     }
 475     else
 476     {
 477       try
 478       {
 479         return (byte[]) _resp;
 480       } catch (java.lang.Exception _exception)
 481       {
 482         return (byte[]) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(_resp,
 483                 byte[].class);
 484       }
 485     }
 486   }
 487
 488 }