changed vamsasDocument and vamsas types namespaces.
[vamsas.git] / src / uk / ac / vamsas / objects / core / AlignmentSequenceAnnotationDescriptor.java
1 /*\r
2  * This class was automatically generated with \r
3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.9M2</a>, using an XML\r
4  * Schema.\r
5  * $Id$\r
6  */\r
7 \r
8 package uk.ac.vamsas.objects.core;\r
9 \r
10   //---------------------------------/\r
11  //- Imported classes and packages -/\r
12 //---------------------------------/\r
13 \r
14 import org.exolab.castor.mapping.AccessMode;\r
15 import org.exolab.castor.xml.TypeValidator;\r
16 import org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor;\r
17 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
18 \r
19 /**\r
20  * Class AlignmentSequenceAnnotationDescriptor.\r
21  * \r
22  * @version $Revision$ $Date$\r
23  */\r
24 public class AlignmentSequenceAnnotationDescriptor extends uk.ac.vamsas.objects.core.RangeAnnotationDescriptor {\r
25 \r
26 \r
27       //--------------------------/\r
28      //- Class/Member Variables -/\r
29     //--------------------------/\r
30 \r
31     /**\r
32      * Field nsPrefix\r
33      */\r
34     private java.lang.String nsPrefix;\r
35 \r
36     /**\r
37      * Field nsURI\r
38      */\r
39     private java.lang.String nsURI;\r
40 \r
41     /**\r
42      * Field xmlName\r
43      */\r
44     private java.lang.String xmlName;\r
45 \r
46     /**\r
47      * Field identity\r
48      */\r
49     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
50 \r
51 \r
52       //----------------/\r
53      //- Constructors -/\r
54     //----------------/\r
55 \r
56     public AlignmentSequenceAnnotationDescriptor() \r
57      {\r
58         super();\r
59         setExtendsWithoutFlatten(new uk.ac.vamsas.objects.core.RangeAnnotationDescriptor());\r
60         nsURI = "http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes";\r
61         xmlName = "AlignmentSequenceAnnotation";\r
62         \r
63         //-- set grouping compositor\r
64         setCompositorAsSequence();\r
65         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
66         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
67         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
68         //-- initialize attribute descriptors\r
69         \r
70         //-- _graph\r
71         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_graph", "graph", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
72         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
73             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
74                 throws IllegalStateException\r
75             {\r
76                 AlignmentSequenceAnnotation target = (AlignmentSequenceAnnotation) object;\r
77                 if(!target.hasGraph())\r
78                     return null;\r
79                 return (target.getGraph() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
80             }\r
81             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
82                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
83             {\r
84                 try {\r
85                     AlignmentSequenceAnnotation target = (AlignmentSequenceAnnotation) object;\r
86                     // ignore null values for non optional primitives\r
87                     if (value == null) return;\r
88                     \r
89                     target.setGraph( ((java.lang.Boolean)value).booleanValue());\r
90                 }\r
91                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
92                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
93                 }\r
94             }\r
95             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
96                 return null;\r
97             }\r
98         };\r
99         desc.setHandler(handler);\r
100         desc.setRequired(true);\r
101         desc.setMultivalued(false);\r
102         addFieldDescriptor(desc);\r
103         \r
104         //-- validation code for: _graph\r
105         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
106         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
107         { //-- local scope\r
108             BooleanValidator typeValidator = new BooleanValidator();\r
109             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
110         }\r
111         desc.setValidator(fieldValidator);\r
112         //-- initialize element descriptors\r
113         \r
114         //-- _provenance\r
115         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance.class, "_provenance", "Provenance", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
116         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
117             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
118                 throws IllegalStateException\r
119             {\r
120                 AlignmentSequenceAnnotation target = (AlignmentSequenceAnnotation) object;\r
121                 return target.getProvenance();\r
122             }\r
123             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
124                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
125             {\r
126                 try {\r
127                     AlignmentSequenceAnnotation target = (AlignmentSequenceAnnotation) object;\r
128                     target.setProvenance( (uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance) value);\r
129                 }\r
130                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
131                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
132                 }\r
133             }\r
134             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
135                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance();\r
136             }\r
137         };\r
138         desc.setHandler(handler);\r
139         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
140         desc.setRequired(true);\r
141         desc.setMultivalued(false);\r
142         addFieldDescriptor(desc);\r
143         \r
144         //-- validation code for: _provenance\r
145         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
146         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
147         { //-- local scope\r
148         }\r
149         desc.setValidator(fieldValidator);\r
150     } //-- uk.ac.vamsas.objects.core.AlignmentSequenceAnnotationDescriptor()\r
151 \r
152 \r
153       //-----------/\r
154      //- Methods -/\r
155     //-----------/\r
156 \r
157     /**\r
158      * Method getAccessMode\r
159      * \r
160      * \r
161      * \r
162      * @return AccessMode\r
163      */\r
164     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
165     {\r
166         return null;\r
167     } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode() \r
168 \r
169     /**\r
170      * Method getExtends\r
171      * \r
172      * \r
173      * \r
174      * @return ClassDescriptor\r
175      */\r
176     public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
177     {\r
178         return super.getExtends();\r
179     } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends() \r
180 \r
181     /**\r
182      * Method getIdentity\r
183      * \r
184      * \r
185      * \r
186      * @return FieldDescriptor\r
187      */\r
188     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
189     {\r
190         if (identity == null)\r
191             return super.getIdentity();\r
192         return identity;\r
193     } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity() \r
194 \r
195     /**\r
196      * Method getJavaClass\r
197      * \r
198      * \r
199      * \r
200      * @return Class\r
201      */\r
202     public java.lang.Class getJavaClass()\r
203     {\r
204         return uk.ac.vamsas.objects.core.AlignmentSequenceAnnotation.class;\r
205     } //-- java.lang.Class getJavaClass() \r
206 \r
207     /**\r
208      * Method getNameSpacePrefix\r
209      * \r
210      * \r
211      * \r
212      * @return String\r
213      */\r
214     public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
215     {\r
216         return nsPrefix;\r
217     } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix() \r
218 \r
219     /**\r
220      * Method getNameSpaceURI\r
221      * \r
222      * \r
223      * \r
224      * @return String\r
225      */\r
226     public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
227     {\r
228         return nsURI;\r
229     } //-- java.lang.String getNameSpaceURI() \r
230 \r
231     /**\r
232      * Method getValidator\r
233      * \r
234      * \r
235      * \r
236      * @return TypeValidator\r
237      */\r
238     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
239     {\r
240         return this;\r
241     } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator() \r
242 \r
243     /**\r
244      * Method getXMLName\r
245      * \r
246      * \r
247      * \r
248      * @return String\r
249      */\r
250     public java.lang.String getXMLName()\r
251     {\r
252         return xmlName;\r
253     } //-- java.lang.String getXMLName() \r
254 \r
255 }\r