f1d89d870d7373b1bfb5fdc5d939c41463da1cf4
[vamsas.git] / src / uk / ac / vamsas / objects / core / descriptors / AlignmentAnnotationDescriptor.java
1 /*\r
2  * This class was automatically generated with \r
3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
4  * Schema.\r
5  * $Id$\r
6  */\r
7 \r
8 package uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors;\r
9 \r
10   //---------------------------------/\r
11  //- Imported classes and packages -/\r
12 //---------------------------------/\r
13 \r
14 import uk.ac.vamsas.objects.core.AlignmentAnnotation;\r
15 \r
16 /**\r
17  * Class AlignmentAnnotationDescriptor.\r
18  * \r
19  * @version $Revision$ $Date$\r
20  */\r
21 public class AlignmentAnnotationDescriptor extends uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors.RangeAnnotationDescriptor {\r
22 \r
23 \r
24       //--------------------------/\r
25      //- Class/Member Variables -/\r
26     //--------------------------/\r
27 \r
28     /**\r
29      * Field _elementDefinition.\r
30      */\r
31     private boolean _elementDefinition;\r
32 \r
33     /**\r
34      * Field _nsPrefix.\r
35      */\r
36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
37 \r
38     /**\r
39      * Field _nsURI.\r
40      */\r
41     private java.lang.String _nsURI;\r
42 \r
43     /**\r
44      * Field _xmlName.\r
45      */\r
46     private java.lang.String _xmlName;\r
47 \r
48     /**\r
49      * Field _identity.\r
50      */\r
51     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor _identity;\r
52 \r
53 \r
54       //----------------/\r
55      //- Constructors -/\r
56     //----------------/\r
57 \r
58     public AlignmentAnnotationDescriptor() {\r
59         super();\r
60         setExtendsWithoutFlatten(new uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors.RangeAnnotationDescriptor());\r
61         _nsURI = "http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes";\r
62         _xmlName = "AlignmentAnnotation";\r
63         _elementDefinition = true;\r
64         \r
65         //-- set grouping compositor\r
66         setCompositorAsSequence();\r
67         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
68         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
69         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
70         //-- initialize attribute descriptors\r
71         \r
72         //-- _graph\r
73         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_graph", "graph", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
74         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
75             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
76                 throws IllegalStateException\r
77             {\r
78                 AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
79                 if (!target.hasGraph()) { return null; }\r
80                 return (target.getGraph() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
81             }\r
82             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
83                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
84             {\r
85                 try {\r
86                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
87                     // ignore null values for non optional primitives\r
88                     if (value == null) { return; }\r
89                     \r
90                     target.setGraph( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
91                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
92                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
93                 }\r
94             }\r
95             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
96                 return null;\r
97             }\r
98         };\r
99         desc.setHandler(handler);\r
100         desc.setRequired(true);\r
101         desc.setMultivalued(false);\r
102         addFieldDescriptor(desc);\r
103         \r
104         //-- validation code for: _graph\r
105         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
106         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
107         { //-- local scope\r
108             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
109             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
110             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
111         }\r
112         desc.setValidator(fieldValidator);\r
113         //-- initialize element descriptors\r
114         \r
115         //-- _provenance\r
116         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance.class, "_provenance", "Provenance", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
117         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
118             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
119                 throws IllegalStateException\r
120             {\r
121                 AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
122                 return target.getProvenance();\r
123             }\r
124             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
125                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
126             {\r
127                 try {\r
128                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
129                     target.setProvenance( (uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance) value);\r
130                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
131                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
132                 }\r
133             }\r
134             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
135                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance();\r
136             }\r
137         };\r
138         desc.setHandler(handler);\r
139         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
140         desc.setRequired(true);\r
141         desc.setMultivalued(false);\r
142         addFieldDescriptor(desc);\r
143         \r
144         //-- validation code for: _provenance\r
145         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
146         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
147         { //-- local scope\r
148         }\r
149         desc.setValidator(fieldValidator);\r
150     }\r
151 \r
152 \r
153       //-----------/\r
154      //- Methods -/\r
155     //-----------/\r
156 \r
157     /**\r
158      * Method getAccessMode.\r
159      * \r
160      * @return the access mode specified for this class.\r
161      */\r
162     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
163     ) {\r
164         return null;\r
165     }\r
166 \r
167     /**\r
168      * Method getIdentity.\r
169      * \r
170      * @return the identity field, null if this class has no\r
171      * identity.\r
172      */\r
173     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
174     ) {\r
175         if (_identity == null) {\r
176             return super.getIdentity();\r
177         }\r
178         return _identity;\r
179     }\r
180 \r
181     /**\r
182      * Method getJavaClass.\r
183      * \r
184      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
185      */\r
186     public java.lang.Class getJavaClass(\r
187     ) {\r
188         return uk.ac.vamsas.objects.core.AlignmentAnnotation.class;\r
189     }\r
190 \r
191     /**\r
192      * Method getNameSpacePrefix.\r
193      * \r
194      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
195      */\r
196     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
197     ) {\r
198         return _nsPrefix;\r
199     }\r
200 \r
201     /**\r
202      * Method getNameSpaceURI.\r
203      * \r
204      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
205      * unmarshaling as XML.\r
206      */\r
207     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
208     ) {\r
209         return _nsURI;\r
210     }\r
211 \r
212     /**\r
213      * Method getValidator.\r
214      * \r
215      * @return a specific validator for the class described by this\r
216      * ClassDescriptor.\r
217      */\r
218     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
219     ) {\r
220         return this;\r
221     }\r
222 \r
223     /**\r
224      * Method getXMLName.\r
225      * \r
226      * @return the XML Name for the Class being described.\r
227      */\r
228     public java.lang.String getXMLName(\r
229     ) {\r
230         return _xmlName;\r
231     }\r
232 \r
233     /**\r
234      * Method isElementDefinition.\r
235      * \r
236      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
237      * of a global\r
238      * element or element with anonymous type definition.\r
239      */\r
240     public boolean isElementDefinition(\r
241     ) {\r
242         return _elementDefinition;\r
243     }\r
244 \r
245 }\r