test/jalview/bin/CommandsTest.java

   1 package jalview.bin;
   2
   3 import java.util.Date;
   4
   5 import org.testng.Assert;
   6 import org.testng.annotations.BeforeClass;
   7 import org.testng.annotations.DataProvider;
   8 import org.testng.annotations.Test;
   9
  10 import jalview.gui.AlignFrame;
  11 import jalview.gui.Desktop;
  12 import jalview.gui.JvOptionPane;
  13
  14 @Test(singleThreaded = true)
  15 public class CommandsTest
  16 {
  17   @BeforeClass(alwaysRun = true)
  18   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
  19   {
  20     Cache.loadProperties("test/jalview/gui/quitProps.jvprops");
  21     Date oneHourFromNow = new Date(
  22             System.currentTimeMillis() + 3600 * 1000);
  23     Cache.setDateProperty("JALVIEW_NEWS_RSS_LASTMODIFIED", oneHourFromNow);
  24   }
  25
  26   @BeforeClass(alwaysRun = true)
  27   public void setUpJvOptionPane()
  28   {
  29     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
  30     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
  31   }
  32
  33   @Test(groups = "Functional", dataProvider = "cmdLines")
  34   public void commandsOpenTest(String cmdLine, String sequence)
  35   {
  36     String[] args = cmdLine.split("\\s+");
  37     Jalview.main(args);
  38     ArgParser argparser = new ArgParser(args);
  39     boolean commandsSuccess = Commands.processArgs(argparser, false);
  40     Assert.assertTrue(commandsSuccess, "Overall commandsSuccess is false");
  41
  42     if (sequence != null)
  43     {
  44       AlignFrame[] afs = Desktop.getAlignFrames();
  45       boolean found = false;
  46       ALIGNFRAME: for (AlignFrame af : afs)
  47       {
  48         for (String name : af.getViewport().getAlignment()
  49                 .getSequenceNames())
  50         {
  51           if (sequence.equals(name))
  52           {
  53             found = true;
  54             break ALIGNFRAME;
  55           }
  56         }
  57       }
  58       Assert.assertTrue(found, "Sequence '" + sequence
  59               + "' was not found in opened alignment files: " + cmdLine);
  60     }
  61   }
  62
  63   @DataProvider(name = "cmdLines")
  64   public Object[][] cmdLines()
  65   {
  66     return new Object[][] { { "--open=examples/uniref50.fa", "FER1_SPIOL" },
  67         { "--argfile=test/jalview/bin/argparser/argfile0.txt", null } };
  68   }
  69
  70 }