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   1 <html><head><title>testng.xml for Ant suite</title></head><body><tt>&lt;!DOCTYPE&nbsp;suite&nbsp;SYSTEM&nbsp;"http://testng.org/testng-1.0.dtd"&gt;<br/>&lt;suite&nbsp;thread-count="5"&nbsp;skipfailedinvocationCounts="false"&nbsp;verbose="3"&nbsp;name="Ant&nbsp;suite"&nbsp;junit="false"&nbsp;annotations="JDK"&nbsp;data-provider-thread-count="10"&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&lt;test&nbsp;name="Ant&nbsp;test"&nbsp;junit="false"&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;groups&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;run&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;exclude&nbsp;name="performance"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;/run&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;/groups&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;classes&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data._structure.JnetAnnotation$AType"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data._structure.JnetAnnotation"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data._structure.JpredAnnotation"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data._structure.JpredResult"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.MsaWS"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.Align"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.AlignResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.CancelJob"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.CancelJobResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.CustomAlign"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.CustomAlignResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetJobStatus"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetJobStatusResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetLimit"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetLimitResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetLimits"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetLimitsResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetPresets"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetPresetsResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetProgress"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetProgressResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetResult"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetResultResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetRunnerOptions"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.GetRunnerOptionsResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.JobExecutionExceptionBean"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.JobSubmissionExceptionBean"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.LimitExceededExceptionBean"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.PresetAlign"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.PresetAlignResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.PullExecStatistics"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.PullExecStatisticsResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.PullFile"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.PullFileResponse"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.ResultNotAvailableExceptionBean"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.UnsupportedRuntimeExceptionBean"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.msa.jaxws.WrongParameterExceptionBean"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.Alignment"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.AlignmentMetadata"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.ClustalAlignmentUtil"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.ClustalAlignmentUtilTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaGeneratorManager"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequence"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequenceGenerator$1"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequenceGenerator$DNAAlphabet"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequenceGenerator$Letters"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequenceGenerator$ProteinAlphabet"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequenceGenerator$SeqType"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequenceGenerator"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequenceGeneratorTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.FastaSequenceTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.Program"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.SequenceUtil"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.SequenceUtilTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.data.sequence.UnknownFileFormatException"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.AsyncExecutor"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.Cleaner"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.ClusterJobId"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.Configurator"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.EngineConfiguratorTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.FilePuller"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.FilePullerTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.Job"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.LoadBalancer"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.ProgressGetter"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.PulledFileCache"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.PulledFileCacheTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.SubmissionManager"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.SyncExecutor"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.ClusterNativeSpecExecutable"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.CommandBuilder$Parameter"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.CommandBuilder"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.CommandBuilderTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.ConfExecutable"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.ConfiguredExecutable"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.EnvVariableProcessor"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.Executable$ExecProvider"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.Executable"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.PathValidator"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.PathValidatorTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.PipedExecutable"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.RunConfiguration"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.SkeletalExecutable"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.client.Util"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.AsyncJobRunner"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.ClusterSession$1"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.ClusterSession"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.ClusterSessionTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.ClusterUtil"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.DrmaaAsyncClusterEngineTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.DrmaaClusterEngineTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.JobRunner"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.StatisticManager"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa.UtilTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa._DrmaaExample"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.drmaa._JobStatus"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.dundee._Queue$1"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.dundee._Queue"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.dundee._QueueConstraints"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.cluster.dundee._QueueTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.conf.DirectoryManager"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.conf.DirectoryManagerTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.conf.PropertyHelperManager"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.conf.PropertyHelperManagerTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.conf.RunnerConfigMarshaller$MySchemaOutputResolver"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.conf.RunnerConfigMarshaller"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.conf.RunnerConfigMarshallerTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.conf._Key"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.AsyncLocalRunner"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.AsyncLocalRunnerTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.EngineResourcesLeakTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.ExecutableWrapper$1"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.ExecutableWrapper"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.LocalEngineUtil"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.LocalExecutorService$1"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.LocalExecutorService"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.LocalRunner"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.LocalRunnerTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.StreamGobbler$OutputType"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local.StreamGobbler"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local._TrackingExecutor$1"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local._TrackingExecutor$2"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.engine.local._TrackingExecutor"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.AllTestSuit"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.Argument"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.ChunkHolder"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.JobExecutionException"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.JobStatus"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.JobSubmissionException"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.Limit"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.LimitExceededException"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.LimitsManager"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.Option"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.OptionCombinatorTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.OptionMarshallerTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.Parameter"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.Preset"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.PresetManager"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.PresetTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.ResultNotAvailableException"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.RunnerConfig"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.RunnerConfigTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.UnsupportedRuntimeException"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.ValueConstrain$1"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.ValueConstrain$Type"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.ValueConstrain"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.metadata.WrongParameterException"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.pipeline._jpred.BlastParser$Psiseq"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.pipeline._jpred.BlastParser"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.pipeline._jpred.Jpred4"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.pipeline._jpred.PScore"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.pipeline._jpred.Pairwise"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.OptionCombinator"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.Util"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._NativeSpecHelper"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._SkeletalCommandBuilder"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.BlastAll$blastType"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.BlastAll$dataBase"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.BlastAll"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.BlastParameters"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.DisEMBLTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.Disembl"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.Environment"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.Mcl"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.MclTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.NetNglyc"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.NetNglycTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.OB"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.OBTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.PSIBlast$blastType"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.PSIBlast$dataBase"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.PSIBlast"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.RPSBlast$DB"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.RPSBlast"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.RPSBlastTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.Ronn"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.RonnTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.Runners"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.Tmhmm2"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._impl.Tmhmm2Tester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner._jpred._Jpred"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.ClustalW"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.ClustalWParametersTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.ClustalWTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.LimitTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.Mafft"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.MafftParametersTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.MafftTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.Muscle"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.MuscleParametersTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.MuscleTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.Probcons"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.ProbconsParametersTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.ProbconsTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.Tcoffee"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.TcoffeeParametersTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.msa.TcoffeeTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.runner.psiblast.PsiBlast"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.client.Jws2Client$Services"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.client.Jws2Client"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.client.WSTester"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.server.ClustalWS"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.server.MafftWS"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.server.MuscleWS"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.server.ProbconsWS"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.server.SimpleWSPublisher"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.server.TcoffeeWS"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;class&nbsp;name="compbio.ws.server.WSUtil"/&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;/classes&gt;<br/>&nbsp;&nbsp;&lt;/test&gt;<br/>&lt;/suite&gt;<br/></tt></body></html>