#include "energy_const.h" typedef struct { int id; int stack[NBPAIRS+1][NBPAIRS+1]; int hairpin[31]; int bulge[MAXLOOP+1]; int internal_loop[MAXLOOP+1]; int mismatchI[NBPAIRS+1][5][5]; int mismatchH[NBPAIRS+1][5][5]; int mismatchM[NBPAIRS+1][5][5]; int dangle5[NBPAIRS+1][5]; int dangle3[NBPAIRS+1][5]; int int11[NBPAIRS+1][NBPAIRS+1][5][5]; int int21[NBPAIRS+1][NBPAIRS+1][5][5][5]; int int22[NBPAIRS+1][NBPAIRS+1][5][5][5][5]; int F_ninio[5]; double lxc; int MLbase; int MLintern[NBPAIRS+1]; int MLclosing; int TerminalAU; int DuplexInit; int TETRA_ENERGY[200]; char Tetraloops[1401]; int Triloop_E[40]; char Triloops[241]; double temperature; } paramT; extern paramT *scale_parameters(void); extern paramT *copy_parameters(void); extern paramT *set_parameters(paramT *dest);