X-Git-Url: http://source.jalview.org/gitweb/?a=blobdiff_plain;f=examples%2Ftestdata%2Fphyre2results%2F56da5616b4559c93%2Faligs%2Fd1e0za_.23.alig.html;fp=examples%2Ftestdata%2Fphyre2results%2F56da5616b4559c93%2Faligs%2Fd1e0za_.23.alig.html;h=793c8caf01510c1369643a9fcf01fb8dbf29b455;hb=42ca4613b0a07bab7c27a61b11acafdc9a3c27d1;hp=0000000000000000000000000000000000000000;hpb=f1ad88cc8d9b26244086e5c24b73fb80b0ff0a38;p=jalview.git diff --git a/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d1e0za_.23.alig.html b/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d1e0za_.23.alig.html new file mode 100644 index 0000000..793c8ca --- /dev/null +++ b/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d1e0za_.23.alig.html @@ -0,0 +1,239 @@ +
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  | Insertion relative to template | +
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
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Detailed help on interpreting your alignment |
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Predicted Secondary structure |   | +||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | +P | D | G | P | I | E | F | D | C | P | D | N | V | Y | I | L | D | Q | A | E | E | A | G | H | D | L | P | Y | S | C | R | A | G | S | C | S | S | C | A | G | K | I | A | G | G | A | V | D | Q | T | D | G | N | F | L | D | D | D | Q | L |
Template Sequence |   | +G | E | D | Y | G | T | M | E | V | A | E | G | E | Y | I | L | E | A | A | E | A | Q | G | Y | D | W | P | F | S | C | R | A | G | A | C | A | N | C | A | S | I | V | K | E | G | E | I | D | M | D | M | Q | Q | I | L | S | D | E | E | V |
Template Known Secondary structure |   | +T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | +||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | +34 | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . |
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Predicted Secondary structure |   | +. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | +E | E | G | . | +W | V | L | T | C | V | A | Y | P | Q | S | D | V | T | I | E | T | H | K | E | A | E | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | +E | E | K | D | V | R | L | T | C | I | G | S | P | A | A | D | . | +E | V | K | I | V | Y | N | A | H | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | +T | S | S | S | S | S | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | +. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Kelley LA et al. Nature Protocols +10, 845-858 (2015) + [paper] + [Citation + link] | |||||||||
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