X-Git-Url: http://source.jalview.org/gitweb/?a=blobdiff_plain;f=examples%2Ftestdata%2Fphyre2results%2F56da5616b4559c93%2Faligs%2Fd1i7ha_.31.alig.html;fp=examples%2Ftestdata%2Fphyre2results%2F56da5616b4559c93%2Faligs%2Fd1i7ha_.31.alig.html;h=38ae65784148c7baf9abcbd12544e40210dbf8ae;hb=42ca4613b0a07bab7c27a61b11acafdc9a3c27d1;hp=0000000000000000000000000000000000000000;hpb=f1ad88cc8d9b26244086e5c24b73fb80b0ff0a38;p=jalview.git diff --git a/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d1i7ha_.31.alig.html b/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d1i7ha_.31.alig.html new file mode 100644 index 0000000..38ae657 --- /dev/null +++ b/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d1i7ha_.31.alig.html @@ -0,0 +1,260 @@ +
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  | Insertion relative to template | +
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
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Detailed help on interpreting your alignment |
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Predicted Secondary structure |   | +. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | +T | P | D | G | P | I | E | F | D | C | P | D | N | V | Y | I | L | D | Q | A | E | E | A | G | H | D | L | P | Y | S | C | R | . | +A | G | S | C | S | S | C | A | G | K | I | A | G | G | A | V | D | Q | T | D | G | N | F | L | D | D | D |
Template Sequence |   | +C | P | D | G | . | +A | V | L | E | A | N | S | G | E | T | I | L | D | A | A | L | R | N | G | I | E | I | E | H | A | C | E | K | S | C | A | C | T | T | C | H | C | I | V | R | E | G | F | D | S | L | P | E | S | S | E | Q | E | D | D |
Template Known Secondary structure |   | +B | T | T | . | T | T | B | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | +. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | +13 | . | . | . | + | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . |
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Predicted Secondary structure |   | +. | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | +. | +. | +. | +. | +. | +. | +Q | L | E | E | G | W | V | L | T | C | V | A | Y | P | Q | S | D | . | +V | T | I | E | T | H | K | E | ||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | +M | L | D | K | A | W | G | L | E | P | E | S | R | L | S | C | Q | A | R | V | T | D | E | D | L | V | V | E | I | P | R | Y | ||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | +T | T | T | T | T | T | T | T | T | B | S | S | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | +||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | +72 | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||
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Kelley LA et al. Nature Protocols +10, 845-858 (2015) + [paper] + [Citation + link] | |||||||||
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