X-Git-Url: http://source.jalview.org/gitweb/?a=blobdiff_plain;f=examples%2Ftestdata%2Fphyre2results%2F56da5616b4559c93%2Faligs%2Fd2cjoa_.13.alig.html;fp=examples%2Ftestdata%2Fphyre2results%2F56da5616b4559c93%2Faligs%2Fd2cjoa_.13.alig.html;h=03e6a70ad93e3b1f8dd7983d77d6db53b90f5266;hb=c51dbe7933683b64548f5353e67561d2b5e377f7;hp=0000000000000000000000000000000000000000;hpb=12d4dfa00a5e93ae1de1d8409c6d5ca2bc8af13f;p=jalview.git diff --git a/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d2cjoa_.13.alig.html b/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d2cjoa_.13.alig.html new file mode 100644 index 0000000..03e6a70 --- /dev/null +++ b/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/aligs/d2cjoa_.13.alig.html @@ -0,0 +1,252 @@ +
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  | Insertion relative to template | +
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
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Detailed help on interpreting your alignment |
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Predicted Secondary structure |   | +. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | +A | S | Y | K | V | K | L | I | T | P | D | G | . | +P | I | E | F | D | C | P | D | N | V | Y | I | L | D | Q | A | E | E | A | G | H | D | L | P | Y | S | C | R | A | G | S | C | S | S | C | A | G | K | I | A | G | G | A | V | D | Q | T |
Template Sequence |   | +A | T | Y | K | V | T | L | V | R | P | D | G | S | E | T | T | I | D | V | P | E | D | E | Y | I | L | D | V | A | E | E | Q | G | L | D | L | P | F | S | C | R | A | G | A | C | S | T | C | A | G | K | L | L | E | G | E | V | D | Q | S |
Template Known Secondary structure |   | +T | T | S | T | T | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | +||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | +1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 |
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  |   | +107 | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | +||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | +D | G | N | F | L | D | D | D | Q | L | E | E | G | W | V | L | T | C | V | A | Y | P | Q | S | D | V | T | I | E | T | H | K | E | A | E | L | ||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | +D | Q | S | F | L | D | D | D | Q | I | E | K | G | F | V | L | T | C | V | A | Y | P | R | S | D | C | K | I | L | T | N | Q | E | E | E | L | ||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | +S | S | S | T | G | G | G | S | S | S | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | +||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | +61 | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
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Kelley LA et al. Nature Protocols +10, 845-858 (2015) + [paper] + [Citation + link] | |||||||||
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