git://source.jalview.org
/
jabaws.git
/ tree
commit
grep
author
committer
pickaxe
?
search:
re
summary
|
shortlog
|
log
|
commit
|
commitdiff
| tree
history
|
HEAD
|
snapshot
JWS-117 Compiled all tools with ./compilebin.sh and some were missing related files.
[jabaws.git]
/
binaries
/
src
/
ViennaRNA
/
lib
/
drwxr-xr-x
..
drwxr-xr-x
-
.deps
tree
|
history
-rw-r--r--
14716
1.8.4_epars.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
492209
1.8.4_intloops.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
157183
2Dfold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
170996
2Dpfold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
46559
LPfold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
44767
Lfold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
7563
MEA.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
92039
Makefile
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
1241
Makefile.am
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
109024
Makefile.in
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
72212
PS_dot.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
7509
ProfileAln.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
7050
ProfileDist.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
13182
RNAstruct.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
30696
aliLfold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
52717
ali_plex.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
5441
alicircfold.inc
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
55140
alifold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
41248
alipfold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4585
aln_util.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
49789
c_plex.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
6594
circfold.inc
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
49431
cofold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
33627
convert_epars.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
309
dist_vars.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
17170
duplex.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
27106
energy_par.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
11616
findpath.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
95268
fold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2907
fold_vars.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
25160
gquad.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
13132
intl11.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
13132
intl11dH.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
67535
intl21.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
67535
intl21dH.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
347538
intl22.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
347538
intl22dH.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
14098
inverse.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
6519944
libRNA.a
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
341920
libRNA_a-2Dfold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
412184
libRNA_a-2Dpfold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
151256
libRNA_a-LPfold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
188496
libRNA_a-Lfold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
32176
libRNA_a-MEA.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
133472
libRNA_a-PS_dot.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
22688
libRNA_a-ProfileAln.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
19472
libRNA_a-ProfileDist.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
33704
libRNA_a-RNAstruct.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
111872
libRNA_a-aliLfold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
160096
libRNA_a-ali_plex.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
208088
libRNA_a-alifold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
176048
libRNA_a-alipfold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
19232
libRNA_a-aln_util.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
167552
libRNA_a-c_plex.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
231240
libRNA_a-cofold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
485528
libRNA_a-convert_epars.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2616
libRNA_a-dist_vars.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
98880
libRNA_a-duplex.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
421416
libRNA_a-energy_par.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
38400
libRNA_a-findpath.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
394800
libRNA_a-fold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12616
libRNA_a-fold_vars.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
51944
libRNA_a-gquad.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
45608
libRNA_a-inverse.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
13656
libRNA_a-list.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
21712
libRNA_a-mm.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
58736
libRNA_a-move_set.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
60456
libRNA_a-naview.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
57120
libRNA_a-params.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
223776
libRNA_a-part_func.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
118152
libRNA_a-part_func_co.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
121840
libRNA_a-part_func_up.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
352544
libRNA_a-plex.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
56192
libRNA_a-plex_functions.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
15648
libRNA_a-plot_layouts.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
97928
libRNA_a-read_epars.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
67448
libRNA_a-ribo.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
121480
libRNA_a-snofold.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
325848
libRNA_a-snoop.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
32656
libRNA_a-stringdist.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
133968
libRNA_a-subopt.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
161528
libRNA_a-svm_utils.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
41928
libRNA_a-treedist.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
70040
libRNA_a-utils.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
10592
list.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
1766
list.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3406
mm.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
64959
model_avg.inc
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
58700
model_sd.inc
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
24854
move_set.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
31118
naview.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
26100
params.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
54067
part_func.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
34265
part_func_co.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
49884
part_func_up.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
103094
plex.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
10017
plex_functions.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4534
plot_layouts.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
37118
read_epars.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
54293
ribo.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
41319
snofold.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
97672
snoop.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
11645
stringdist.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
45482
subopt.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
389928
svm.o
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12447
svm_utils.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
16083
treedist.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
34666
utils.c
blob
|
history
|
raw