ctrl/CMD for toggling sequences in creating groups exercise (the use of shift is...
[jalview-manual.git] / TheJalviewTutorial.tex
index 27c80f7..ed3dad0 100644 (file)
@@ -805,6 +805,7 @@ $\Rightarrow$ Load Project} menu option. Observe how many of the windows
 reopen. Are they the same as when they were saved ? } {\bf See the video at:
 \url{http://www.jalview.org/Help/Getting-Started}.} }
 
+%% Suzanne: Jim's comment: this now appears at the end of the section, over the page from the exercise. I doubt anyone will read it there.
 \subsection{Jalview Projects}
 \parbox[c]{4in}{If you wish to save a complete Jalview session rather than
 just a single alignment (e.g. because you have calculated trees or multiple
@@ -995,10 +996,10 @@ context menu in the alignment window.
 Open the {\sl Selection $\Rightarrow$ Edit New Group $\Rightarrow$ Group Colour
 } menu and select {\sl Percentage Identity}.
 This will turn the selected region into a group and colour it accordingly.}
-\exstep{Hold down [CTRL] ([CMD] on Mac) or [SHIFT] and use the mouse to select and deselect sequences in
+\exstep{Hold down [CTRL] ([CMD] on Mac) and use the mouse to select and deselect sequences in
 the alignment by clicking on their Sequence ID label. Note how the group expands
 to include newly selected sequences, and the Percentage Identity colouring changes. }
-\exstep{ Another way to resize the group is by using the mouse to click and drag
+\exstep{ Another way to resize the group is simply to use the mouse to click and drag
 the right-hand edge of the selected group.}
 
 \exstep{The current selection can be exported and saved, place mouse on the text