--debug
--nonews
--nosplash
--noannotation
--substitutions
--open={argfiledirname}/sample.a2m
--colour=gecos:flower
--structure={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_1_model_3.pdb
--paematrix={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_1_model_3_scores.json
--tempfac=plddt
--structure={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_2_model_4.pdb
--paematrix={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_2_model_4_scores.json
--tempfac=plddt
--structure={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_3_model_2.pdb
--paematrix={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_3_model_2_scores.json
--tempfac=plddt
--structure={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_4_model_5.pdb
--paematrix={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_4_model_5_scores.json
--tempfac=plddt
--structure={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_5_model_1.pdb
--tempfac=plddt
--paematrix={dirname}/test_fab41_unrelaxed_rank_5_model_1_scores.json
--image={dirname}/{basename}.html
#--headless