bin/jalview/datamodel/BinaryNode.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");
   2 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
   3 this.$element = null;
   4 this.name = null;
   5 this.$left = null;
   6 this.$right = null;
   7 this.$parent = null;
   8 this.bootstrap = 0;
   9 Clazz.instantialize (this, arguments);
  10 }, jalview.datamodel, "BinaryNode");
  11 Clazz.makeConstructor (c$,
  12 function () {
  13 this.$left = this.$right = this.$parent = null;
  14 this.bootstrap = 0;
  15 });
  16 Clazz.makeConstructor (c$,
  17 function (element, parent, name) {
  18 this.$element = element;
  19 this.$parent = parent;
  20 this.name = name;
  21 this.$left = this.$right = null;
  22 }, "~O,jalview.datamodel.BinaryNode,~S");
  23 Clazz.defineMethod (c$, "element",
  24 function () {
  25 return this.$element;
  26 });
  27 Clazz.defineMethod (c$, "setElement",
  28 function (v) {
  29 return this.$element = v;
  30 }, "~O");
  31 Clazz.defineMethod (c$, "left",
  32 function () {
  33 return this.$left;
  34 });
  35 Clazz.defineMethod (c$, "setLeft",
  36 function (n) {
  37 return this.$left = n;
  38 }, "jalview.datamodel.BinaryNode");
  39 Clazz.defineMethod (c$, "right",
  40 function () {
  41 return this.$right;
  42 });
  43 Clazz.defineMethod (c$, "setRight",
  44 function (n) {
  45 return this.$right = n;
  46 }, "jalview.datamodel.BinaryNode");
  47 Clazz.defineMethod (c$, "parent",
  48 function () {
  49 return this.$parent;
  50 });
  51 Clazz.defineMethod (c$, "setParent",
  52 function (n) {
  53 return this.$parent = n;
  54 }, "jalview.datamodel.BinaryNode");
  55 Clazz.defineMethod (c$, "isLeaf",
  56 function () {
  57 return (this.$left == null) && (this.$right == null);
  58 });
  59 Clazz.defineMethod (c$, "SetChildren",
  60 function (leftchild, rightchild) {
  61 if (leftchild != null) {
  62 this.setLeft (leftchild);
  63 leftchild.detach ();
  64 leftchild.setParent (this);
  65 }if (rightchild != null) {
  66 this.setRight (rightchild);
  67 rightchild.detach ();
  68 rightchild.setParent (this);
  69 }}, "jalview.datamodel.BinaryNode,jalview.datamodel.BinaryNode");
  70 Clazz.defineMethod (c$, "detach",
  71 function () {
  72 if (this.$parent != null) {
  73 if (this.$parent.$left === this) {
  74 this.$parent.$left = null;
  75 } else {
  76 if (this.$parent.$right === this) {
  77 this.$parent.$right = null;
  78 }}}this.$parent = null;
  79 return this;
  80 });
  81 Clazz.defineMethod (c$, "ascendLeft",
  82 function () {
  83 var c = this;
  84 do {
  85 c = c.parent ();
  86 } while ((c != null) && (c.left () != null) && !c.left ().isLeaf ());
  87 return c;
  88 });
  89 Clazz.defineMethod (c$, "ascendRight",
  90 function () {
  91 var c = this;
  92 do {
  93 c = c.parent ();
  94 } while ((c != null) && (c.right () != null) && !c.right ().isLeaf ());
  95 return c;
  96 });
  97 Clazz.defineMethod (c$, "setName",
  98 function (name) {
  99 this.name = name;
 100 }, "~S");
 101 Clazz.defineMethod (c$, "getName",
 102 function () {
 103 return this.name;
 104 });
 105 Clazz.defineMethod (c$, "setBootstrap",
 106 function (boot) {
 107 this.bootstrap = boot;
 108 }, "~N");
 109 Clazz.defineMethod (c$, "getBootstrap",
 110 function () {
 111 return this.bootstrap;
 112 });