bin/jalview/datamodel/FeatureProperties.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");\r
   2 Clazz.load (null, "jalview.datamodel.FeatureProperties", ["jalview.datamodel.DBRefSource"], function () {\r
   3 c$ = Clazz.declareType (jalview.datamodel, "FeatureProperties");\r
   4 c$.isCodingFeature = Clazz.defineMethod (c$, "isCodingFeature", \r
   5 function (dbrefsource, type) {\r
   6 if (type.equalsIgnoreCase ("CDS")) {\r
   7 return (dbrefsource == null || dbrefsource.equalsIgnoreCase (jalview.datamodel.DBRefSource.EMBL) || dbrefsource.equalsIgnoreCase (jalview.datamodel.DBRefSource.EMBLCDS));\r
   8 }return false;\r
   9 }, "~S,~S");\r
  10 c$.getCodingFeature = Clazz.defineMethod (c$, "getCodingFeature", \r
  11 function (dbrefsource) {\r
  12 if (jalview.datamodel.DBRefSource.EMBL.equalsIgnoreCase (dbrefsource) || jalview.datamodel.DBRefSource.EMBLCDS.equalsIgnoreCase (dbrefsource)) {\r
  13 return "CDS";\r
  14 }return null;\r
  15 }, "~S");\r
  16 Clazz.defineStatics (c$,\r
  17 "EMBL_CODING_FEATURE", "CDS",\r
  18 "EXONPOS", "exon number",\r
  19 "EXONPRODUCT", "product");\r
  20 });\r