bin/jalview/viewmodel/annotationfilter/AnnotationFilterParameter.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.viewmodel.annotationfilter");
   2 Clazz.load (["java.lang.Enum", "java.util.ArrayList"], "jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter", null, function () {
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
   4 this.thresholdType = null;
   5 this.thresholdValue = 0;
   6 this.filterAlphaHelix = false;
   7 this.filterBetaSheet = false;
   8 this.filterTurn = false;
   9 this.regexString = null;
  10 this.regexSearchFields = null;
  11 Clazz.instantialize (this, arguments);
  12 }, jalview.viewmodel.annotationfilter, "AnnotationFilterParameter");
  13 Clazz.prepareFields (c$, function () {
  14 this.regexSearchFields =  new java.util.ArrayList ();
  15 });
  16 Clazz.defineMethod (c$, "getThresholdType",
  17 function () {
  18 return this.thresholdType;
  19 });
  20 Clazz.defineMethod (c$, "setThresholdType",
  21 function (thresholdType) {
  22 this.thresholdType = thresholdType;
  23 }, "jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter.ThresholdType");
  24 Clazz.defineMethod (c$, "getThresholdValue",
  25 function () {
  26 return this.thresholdValue;
  27 });
  28 Clazz.defineMethod (c$, "setThresholdValue",
  29 function (thresholdValue) {
  30 this.thresholdValue = thresholdValue;
  31 }, "~N");
  32 Clazz.defineMethod (c$, "getRegexString",
  33 function () {
  34 return this.regexString;
  35 });
  36 Clazz.defineMethod (c$, "setRegexString",
  37 function (regexString) {
  38 this.regexString = regexString;
  39 }, "~S");
  40 Clazz.defineMethod (c$, "getRegexSearchFields",
  41 function () {
  42 return this.regexSearchFields;
  43 });
  44 Clazz.defineMethod (c$, "addRegexSearchField",
  45 function (regexSearchField) {
  46 this.regexSearchFields.add (regexSearchField);
  47 }, "jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter.SearchableAnnotationField");
  48 Clazz.defineMethod (c$, "isFilterAlphaHelix",
  49 function () {
  50 return this.filterAlphaHelix;
  51 });
  52 Clazz.defineMethod (c$, "setFilterAlphaHelix",
  53 function (alphaHelix) {
  54 this.filterAlphaHelix = alphaHelix;
  55 }, "~B");
  56 Clazz.defineMethod (c$, "isFilterBetaSheet",
  57 function () {
  58 return this.filterBetaSheet;
  59 });
  60 Clazz.defineMethod (c$, "setFilterBetaSheet",
  61 function (betaSheet) {
  62 this.filterBetaSheet = betaSheet;
  63 }, "~B");
  64 Clazz.defineMethod (c$, "isFilterTurn",
  65 function () {
  66 return this.filterTurn;
  67 });
  68 Clazz.defineMethod (c$, "setFilterTurn",
  69 function (turn) {
  70 this.filterTurn = turn;
  71 }, "~B");
  72 Clazz.pu$h ();
  73 c$ = Clazz.declareType (jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter, "ThresholdType", Enum);
  74 Clazz.defineEnumConstant (c$, "NO_THRESHOLD", 0, []);
  75 Clazz.defineEnumConstant (c$, "BELOW_THRESHOLD", 1, []);
  76 Clazz.defineEnumConstant (c$, "ABOVE_THRESHOLD", 2, []);
  77 c$ = Clazz.p0p ();
  78 Clazz.pu$h ();
  79 c$ = Clazz.declareType (jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter, "SearchableAnnotationField", Enum);
  80 Clazz.defineEnumConstant (c$, "DISPLAY_STRING", 0, []);
  81 Clazz.defineEnumConstant (c$, "DESCRIPTION", 1, []);
  82 c$ = Clazz.p0p ();
  83 });