JAL-1807 Bob's JalviewJS prototype first commit
[jalviewjs.git] / site / j2s / JU / InfTree.js
1 Clazz.declarePackage ("JU");\r
2 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
3 this.hn = null;\r
4 this.v = null;\r
5 this.c = null;\r
6 this.r = null;\r
7 this.u = null;\r
8 this.x = null;\r
9 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
10 }, JU, "InfTree");\r
11 Clazz.defineMethod (c$, "huft_build", \r
12  function (b, bindex, n, s, d, e, t, m, hp, hn, v) {\r
13 var a;\r
14 var f;\r
15 var g;\r
16 var h;\r
17 var i;\r
18 var j;\r
19 var k;\r
20 var l;\r
21 var mask;\r
22 var p;\r
23 var q;\r
24 var w;\r
25 var xp;\r
26 var y;\r
27 var z;\r
28 p = 0;\r
29 i = n;\r
30 do {\r
31 this.c[b[bindex + p]]++;\r
32 p++;\r
33 i--;\r
34 } while (i != 0);\r
35 if (this.c[0] == n) {\r
36 t[0] = -1;\r
37 m[0] = 0;\r
38 return 0;\r
39 }l = m[0];\r
40 for (j = 1; j <= 15; j++) if (this.c[j] != 0) break;\r
41 \r
42 k = j;\r
43 if (l < j) {\r
44 l = j;\r
45 }for (i = 15; i != 0; i--) {\r
46 if (this.c[i] != 0) break;\r
47 }\r
48 g = i;\r
49 if (l > i) {\r
50 l = i;\r
51 }m[0] = l;\r
52 for (y = 1 << j; j < i; j++, y <<= 1) {\r
53 if ((y -= this.c[j]) < 0) {\r
54 return -3;\r
55 }}\r
56 if ((y -= this.c[i]) < 0) {\r
57 return -3;\r
58 }this.c[i] += y;\r
59 this.x[1] = j = 0;\r
60 p = 1;\r
61 xp = 2;\r
62 while (--i != 0) {\r
63 this.x[xp] = (j += this.c[p]);\r
64 xp++;\r
65 p++;\r
66 }\r
67 i = 0;\r
68 p = 0;\r
69 do {\r
70 if ((j = b[bindex + p]) != 0) {\r
71 v[this.x[j]++] = i;\r
72 }p++;\r
73 } while (++i < n);\r
74 n = this.x[g];\r
75 this.x[0] = i = 0;\r
76 p = 0;\r
77 h = -1;\r
78 w = -l;\r
79 this.u[0] = 0;\r
80 q = 0;\r
81 z = 0;\r
82 for (; k <= g; k++) {\r
83 a = this.c[k];\r
84 while (a-- != 0) {\r
85 while (k > w + l) {\r
86 h++;\r
87 w += l;\r
88 z = g - w;\r
89 z = (z > l) ? l : z;\r
90 if ((f = 1 << (j = k - w)) > a + 1) {\r
91 f -= a + 1;\r
92 xp = k;\r
93 if (j < z) {\r
94 while (++j < z) {\r
95 if ((f <<= 1) <= this.c[++xp]) break;\r
96 f -= this.c[xp];\r
97 }\r
98 }}z = 1 << j;\r
99 if (hn[0] + z > 1440) {\r
100 return -3;\r
101 }this.u[h] = q = hn[0];\r
102 hn[0] += z;\r
103 if (h != 0) {\r
104 this.x[h] = i;\r
105 this.r[0] = j;\r
106 this.r[1] = l;\r
107 j = i >>> (w - l);\r
108 this.r[2] = (q - this.u[h - 1] - j);\r
109 System.arraycopy (this.r, 0, hp, (this.u[h - 1] + j) * 3, 3);\r
110 } else {\r
111 t[0] = q;\r
112 }}\r
113 this.r[1] = (k - w);\r
114 if (p >= n) {\r
115 this.r[0] = 192;\r
116 } else if (v[p] < s) {\r
117 this.r[0] = (v[p] < 256 ? 0 : 96);\r
118 this.r[2] = v[p++];\r
119 } else {\r
120 this.r[0] = (e[v[p] - s] + 16 + 64);\r
121 this.r[2] = d[v[p++] - s];\r
122 }f = 1 << (k - w);\r
123 for (j = i >>> w; j < z; j += f) {\r
124 System.arraycopy (this.r, 0, hp, (q + j) * 3, 3);\r
125 }\r
126 for (j = 1 << (k - 1); (i & j) != 0; j >>>= 1) {\r
127 i ^= j;\r
128 }\r
129 i ^= j;\r
130 mask = (1 << w) - 1;\r
131 while ((i & mask) != this.x[h]) {\r
132 h--;\r
133 w -= l;\r
134 mask = (1 << w) - 1;\r
135 }\r
136 }\r
137 }\r
138 return y != 0 && g != 1 ? -5 : 0;\r
139 }, "~A,~N,~N,~N,~A,~A,~A,~A,~A,~A,~A");\r
140 Clazz.defineMethod (c$, "inflate_trees_bits", \r
141 function (c, bb, tb, hp, z) {\r
142 var result;\r
143 this.initWorkArea (19);\r
144 this.hn[0] = 0;\r
145 result = this.huft_build (c, 0, 19, 19, null, null, tb, bb, hp, this.hn, this.v);\r
146 if (result == -3) {\r
147 z.msg = "oversubscribed dynamic bit lengths tree";\r
148 } else if (result == -5 || bb[0] == 0) {\r
149 z.msg = "incomplete dynamic bit lengths tree";\r
150 result = -3;\r
151 }return result;\r
152 }, "~A,~A,~A,~A,JU.ZStream");\r
153 Clazz.defineMethod (c$, "inflate_trees_dynamic", \r
154 function (nl, nd, c, bl, bd, tl, td, hp, z) {\r
155 var result;\r
156 this.initWorkArea (288);\r
157 this.hn[0] = 0;\r
158 result = this.huft_build (c, 0, nl, 257, JU.InfTree.cplens, JU.InfTree.cplext, tl, bl, hp, this.hn, this.v);\r
159 if (result != 0 || bl[0] == 0) {\r
160 if (result == -3) {\r
161 z.msg = "oversubscribed literal/length tree";\r
162 } else if (result != -4) {\r
163 z.msg = "incomplete literal/length tree";\r
164 result = -3;\r
165 }return result;\r
166 }this.initWorkArea (288);\r
167 result = this.huft_build (c, nl, nd, 0, JU.InfTree.cpdist, JU.InfTree.cpdext, td, bd, hp, this.hn, this.v);\r
168 if (result != 0 || (bd[0] == 0 && nl > 257)) {\r
169 if (result == -3) {\r
170 z.msg = "oversubscribed distance tree";\r
171 } else if (result == -5) {\r
172 z.msg = "incomplete distance tree";\r
173 result = -3;\r
174 } else if (result != -4) {\r
175 z.msg = "empty distance tree with lengths";\r
176 result = -3;\r
177 }return result;\r
178 }return 0;\r
179 }, "~N,~N,~A,~A,~A,~A,~A,~A,JU.ZStream");\r
180 c$.inflate_trees_fixed = Clazz.defineMethod (c$, "inflate_trees_fixed", \r
181 function (bl, bd, tl, td, z) {\r
182 bl[0] = 9;\r
183 bd[0] = 5;\r
184 tl[0] = JU.InfTree.fixed_tl;\r
185 td[0] = JU.InfTree.fixed_td;\r
186 return 0;\r
187 }, "~A,~A,~A,~A,JU.ZStream");\r
188 Clazz.defineMethod (c$, "initWorkArea", \r
189  function (vsize) {\r
190 if (this.hn == null) {\r
191 this.hn =  Clazz.newIntArray (1, 0);\r
192 this.v =  Clazz.newIntArray (vsize, 0);\r
193 this.c =  Clazz.newIntArray (16, 0);\r
194 this.r =  Clazz.newIntArray (3, 0);\r
195 this.u =  Clazz.newIntArray (15, 0);\r
196 this.x =  Clazz.newIntArray (16, 0);\r
197 }if (this.v.length < vsize) {\r
198 this.v =  Clazz.newIntArray (vsize, 0);\r
199 }for (var i = 0; i < vsize; i++) {\r
200 this.v[i] = 0;\r
201 }\r
202 for (var i = 0; i < 16; i++) {\r
203 this.c[i] = 0;\r
204 }\r
205 for (var i = 0; i < 3; i++) {\r
206 this.r[i] = 0;\r
207 }\r
208 System.arraycopy (this.c, 0, this.u, 0, 15);\r
209 System.arraycopy (this.c, 0, this.x, 0, 16);\r
210 }, "~N");\r
211 Clazz.defineStatics (c$,\r
212 "MANY", 1440,\r
213 "Z_OK", 0,\r
214 "Z_DATA_ERROR", -3,\r
215 "Z_MEM_ERROR", -4,\r
216 "Z_BUF_ERROR", -5,\r
217 "fixed_bl", 9,\r
218 "fixed_bd", 5,\r
219 "fixed_tl",  Clazz.newIntArray (-1, [96, 7, 256, 0, 8, 80, 0, 8, 16, 84, 8, 115, 82, 7, 31, 0, 8, 112, 0, 8, 48, 0, 9, 192, 80, 7, 10, 0, 8, 96, 0, 8, 32, 0, 9, 160, 0, 8, 0, 0, 8, 128, 0, 8, 64, 0, 9, 224, 80, 7, 6, 0, 8, 88, 0, 8, 24, 0, 9, 144, 83, 7, 59, 0, 8, 120, 0, 8, 56, 0, 9, 208, 81, 7, 17, 0, 8, 104, 0, 8, 40, 0, 9, 176, 0, 8, 8, 0, 8, 136, 0, 8, 72, 0, 9, 240, 80, 7, 4, 0, 8, 84, 0, 8, 20, 85, 8, 227, 83, 7, 43, 0, 8, 116, 0, 8, 52, 0, 9, 200, 81, 7, 13, 0, 8, 100, 0, 8, 36, 0, 9, 168, 0, 8, 4, 0, 8, 132, 0, 8, 68, 0, 9, 232, 80, 7, 8, 0, 8, 92, 0, 8, 28, 0, 9, 152, 84, 7, 83, 0, 8, 124, 0, 8, 60, 0, 9, 216, 82, 7, 23, 0, 8, 108, 0, 8, 44, 0, 9, 184, 0, 8, 12, 0, 8, 140, 0, 8, 76, 0, 9, 248, 80, 7, 3, 0, 8, 82, 0, 8, 18, 85, 8, 163, 83, 7, 35, 0, 8, 114, 0, 8, 50, 0, 9, 196, 81, 7, 11, 0, 8, 98, 0, 8, 34, 0, 9, 164, 0, 8, 2, 0, 8, 130, 0, 8, 66, 0, 9, 228, 80, 7, 7, 0, 8, 90, 0, 8, 26, 0, 9, 148, 84, 7, 67, 0, 8, 122, 0, 8, 58, 0, 9, 212, 82, 7, 19, 0, 8, 106, 0, 8, 42, 0, 9, 180, 0, 8, 10, 0, 8, 138, 0, 8, 74, 0, 9, 244, 80, 7, 5, 0, 8, 86, 0, 8, 22, 192, 8, 0, 83, 7, 51, 0, 8, 118, 0, 8, 54, 0, 9, 204, 81, 7, 15, 0, 8, 102, 0, 8, 38, 0, 9, 172, 0, 8, 6, 0, 8, 134, 0, 8, 70, 0, 9, 236, 80, 7, 9, 0, 8, 94, 0, 8, 30, 0, 9, 156, 84, 7, 99, 0, 8, 126, 0, 8, 62, 0, 9, 220, 82, 7, 27, 0, 8, 110, 0, 8, 46, 0, 9, 188, 0, 8, 14, 0, 8, 142, 0, 8, 78, 0, 9, 252, 96, 7, 256, 0, 8, 81, 0, 8, 17, 85, 8, 131, 82, 7, 31, 0, 8, 113, 0, 8, 49, 0, 9, 194, 80, 7, 10, 0, 8, 97, 0, 8, 33, 0, 9, 162, 0, 8, 1, 0, 8, 129, 0, 8, 65, 0, 9, 226, 80, 7, 6, 0, 8, 89, 0, 8, 25, 0, 9, 146, 83, 7, 59, 0, 8, 121, 0, 8, 57, 0, 9, 210, 81, 7, 17, 0, 8, 105, 0, 8, 41, 0, 9, 178, 0, 8, 9, 0, 8, 137, 0, 8, 73, 0, 9, 242, 80, 7, 4, 0, 8, 85, 0, 8, 21, 80, 8, 258, 83, 7, 43, 0, 8, 117, 0, 8, 53, 0, 9, 202, 81, 7, 13, 0, 8, 101, 0, 8, 37, 0, 9, 170, 0, 8, 5, 0, 8, 133, 0, 8, 69, 0, 9, 234, 80, 7, 8, 0, 8, 93, 0, 8, 29, 0, 9, 154, 84, 7, 83, 0, 8, 125, 0, 8, 61, 0, 9, 218, 82, 7, 23, 0, 8, 109, 0, 8, 45, 0, 9, 186, 0, 8, 13, 0, 8, 141, 0, 8, 77, 0, 9, 250, 80, 7, 3, 0, 8, 83, 0, 8, 19, 85, 8, 195, 83, 7, 35, 0, 8, 115, 0, 8, 51, 0, 9, 198, 81, 7, 11, 0, 8, 99, 0, 8, 35, 0, 9, 166, 0, 8, 3, 0, 8, 131, 0, 8, 67, 0, 9, 230, 80, 7, 7, 0, 8, 91, 0, 8, 27, 0, 9, 150, 84, 7, 67, 0, 8, 123, 0, 8, 59, 0, 9, 214, 82, 7, 19, 0, 8, 107, 0, 8, 43, 0, 9, 182, 0, 8, 11, 0, 8, 139, 0, 8, 75, 0, 9, 246, 80, 7, 5, 0, 8, 87, 0, 8, 23, 192, 8, 0, 83, 7, 51, 0, 8, 119, 0, 8, 55, 0, 9, 206, 81, 7, 15, 0, 8, 103, 0, 8, 39, 0, 9, 174, 0, 8, 7, 0, 8, 135, 0, 8, 71, 0, 9, 238, 80, 7, 9, 0, 8, 95, 0, 8, 31, 0, 9, 158, 84, 7, 99, 0, 8, 127, 0, 8, 63, 0, 9, 222, 82, 7, 27, 0, 8, 111, 0, 8, 47, 0, 9, 190, 0, 8, 15, 0, 8, 143, 0, 8, 79, 0, 9, 254, 96, 7, 256, 0, 8, 80, 0, 8, 16, 84, 8, 115, 82, 7, 31, 0, 8, 112, 0, 8, 48, 0, 9, 193, 80, 7, 10, 0, 8, 96, 0, 8, 32, 0, 9, 161, 0, 8, 0, 0, 8, 128, 0, 8, 64, 0, 9, 225, 80, 7, 6, 0, 8, 88, 0, 8, 24, 0, 9, 145, 83, 7, 59, 0, 8, 120, 0, 8, 56, 0, 9, 209, 81, 7, 17, 0, 8, 104, 0, 8, 40, 0, 9, 177, 0, 8, 8, 0, 8, 136, 0, 8, 72, 0, 9, 241, 80, 7, 4, 0, 8, 84, 0, 8, 20, 85, 8, 227, 83, 7, 43, 0, 8, 116, 0, 8, 52, 0, 9, 201, 81, 7, 13, 0, 8, 100, 0, 8, 36, 0, 9, 169, 0, 8, 4, 0, 8, 132, 0, 8, 68, 0, 9, 233, 80, 7, 8, 0, 8, 92, 0, 8, 28, 0, 9, 153, 84, 7, 83, 0, 8, 124, 0, 8, 60, 0, 9, 217, 82, 7, 23, 0, 8, 108, 0, 8, 44, 0, 9, 185, 0, 8, 12, 0, 8, 140, 0, 8, 76, 0, 9, 249, 80, 7, 3, 0, 8, 82, 0, 8, 18, 85, 8, 163, 83, 7, 35, 0, 8, 114, 0, 8, 50, 0, 9, 197, 81, 7, 11, 0, 8, 98, 0, 8, 34, 0, 9, 165, 0, 8, 2, 0, 8, 130, 0, 8, 66, 0, 9, 229, 80, 7, 7, 0, 8, 90, 0, 8, 26, 0, 9, 149, 84, 7, 67, 0, 8, 122, 0, 8, 58, 0, 9, 213, 82, 7, 19, 0, 8, 106, 0, 8, 42, 0, 9, 181, 0, 8, 10, 0, 8, 138, 0, 8, 74, 0, 9, 245, 80, 7, 5, 0, 8, 86, 0, 8, 22, 192, 8, 0, 83, 7, 51, 0, 8, 118, 0, 8, 54, 0, 9, 205, 81, 7, 15, 0, 8, 102, 0, 8, 38, 0, 9, 173, 0, 8, 6, 0, 8, 134, 0, 8, 70, 0, 9, 237, 80, 7, 9, 0, 8, 94, 0, 8, 30, 0, 9, 157, 84, 7, 99, 0, 8, 126, 0, 8, 62, 0, 9, 221, 82, 7, 27, 0, 8, 110, 0, 8, 46, 0, 9, 189, 0, 8, 14, 0, 8, 142, 0, 8, 78, 0, 9, 253, 96, 7, 256, 0, 8, 81, 0, 8, 17, 85, 8, 131, 82, 7, 31, 0, 8, 113, 0, 8, 49, 0, 9, 195, 80, 7, 10, 0, 8, 97, 0, 8, 33, 0, 9, 163, 0, 8, 1, 0, 8, 129, 0, 8, 65, 0, 9, 227, 80, 7, 6, 0, 8, 89, 0, 8, 25, 0, 9, 147, 83, 7, 59, 0, 8, 121, 0, 8, 57, 0, 9, 211, 81, 7, 17, 0, 8, 105, 0, 8, 41, 0, 9, 179, 0, 8, 9, 0, 8, 137, 0, 8, 73, 0, 9, 243, 80, 7, 4, 0, 8, 85, 0, 8, 21, 80, 8, 258, 83, 7, 43, 0, 8, 117, 0, 8, 53, 0, 9, 203, 81, 7, 13, 0, 8, 101, 0, 8, 37, 0, 9, 171, 0, 8, 5, 0, 8, 133, 0, 8, 69, 0, 9, 235, 80, 7, 8, 0, 8, 93, 0, 8, 29, 0, 9, 155, 84, 7, 83, 0, 8, 125, 0, 8, 61, 0, 9, 219, 82, 7, 23, 0, 8, 109, 0, 8, 45, 0, 9, 187, 0, 8, 13, 0, 8, 141, 0, 8, 77, 0, 9, 251, 80, 7, 3, 0, 8, 83, 0, 8, 19, 85, 8, 195, 83, 7, 35, 0, 8, 115, 0, 8, 51, 0, 9, 199, 81, 7, 11, 0, 8, 99, 0, 8, 35, 0, 9, 167, 0, 8, 3, 0, 8, 131, 0, 8, 67, 0, 9, 231, 80, 7, 7, 0, 8, 91, 0, 8, 27, 0, 9, 151, 84, 7, 67, 0, 8, 123, 0, 8, 59, 0, 9, 215, 82, 7, 19, 0, 8, 107, 0, 8, 43, 0, 9, 183, 0, 8, 11, 0, 8, 139, 0, 8, 75, 0, 9, 247, 80, 7, 5, 0, 8, 87, 0, 8, 23, 192, 8, 0, 83, 7, 51, 0, 8, 119, 0, 8, 55, 0, 9, 207, 81, 7, 15, 0, 8, 103, 0, 8, 39, 0, 9, 175, 0, 8, 7, 0, 8, 135, 0, 8, 71, 0, 9, 239, 80, 7, 9, 0, 8, 95, 0, 8, 31, 0, 9, 159, 84, 7, 99, 0, 8, 127, 0, 8, 63, 0, 9, 223, 82, 7, 27, 0, 8, 111, 0, 8, 47, 0, 9, 191, 0, 8, 15, 0, 8, 143, 0, 8, 79, 0, 9, 255]),\r
220 "fixed_td",  Clazz.newIntArray (-1, [80, 5, 1, 87, 5, 257, 83, 5, 17, 91, 5, 4097, 81, 5, 5, 89, 5, 1025, 85, 5, 65, 93, 5, 16385, 80, 5, 3, 88, 5, 513, 84, 5, 33, 92, 5, 8193, 82, 5, 9, 90, 5, 2049, 86, 5, 129, 192, 5, 24577, 80, 5, 2, 87, 5, 385, 83, 5, 25, 91, 5, 6145, 81, 5, 7, 89, 5, 1537, 85, 5, 97, 93, 5, 24577, 80, 5, 4, 88, 5, 769, 84, 5, 49, 92, 5, 12289, 82, 5, 13, 90, 5, 3073, 86, 5, 193, 192, 5, 24577]),\r
221 "cplens",  Clazz.newIntArray (-1, [3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 13, 15, 17, 19, 23, 27, 31, 35, 43, 51, 59, 67, 83, 99, 115, 131, 163, 195, 227, 258, 0, 0]),\r
222 "cplext",  Clazz.newIntArray (-1, [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3, 4, 4, 4, 4, 5, 5, 5, 5, 0, 112, 112]),\r
223 "cpdist",  Clazz.newIntArray (-1, [1, 2, 3, 4, 5, 7, 9, 13, 17, 25, 33, 49, 65, 97, 129, 193, 257, 385, 513, 769, 1025, 1537, 2049, 3073, 4097, 6145, 8193, 12289, 16385, 24577]),\r
224 "cpdext",  Clazz.newIntArray (-1, [0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 2, 3, 3, 4, 4, 5, 5, 6, 6, 7, 7, 8, 8, 9, 9, 10, 10, 11, 11, 12, 12, 13, 13]),\r
225 "BMAX", 15);\r