site/j2s/jalview/appletgui/ScalePanel.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.appletgui");\r
   2 Clazz.load (["awt2swing.Panel", "java.awt.event.MouseListener", "$.MouseMotionListener"], "jalview.appletgui.ScalePanel", ["awt2swing.MenuItem", "$.PopupMenu", "jalview.datamodel.SequenceGroup", "jalview.util.MessageManager", "java.awt.Color", "java.awt.event.ActionListener"], function () {\r
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
   4 this.offy = 4;\r
   5 this.$width = 0;\r
   6 this.av = null;\r
   7 this.ap = null;\r
   8 this.stretchingGroup = false;\r
   9 this.min = 0;\r
  10 this.max = 0;\r
  11 this.mouseDragging = false;\r
  12 this.reveal = null;\r
  13 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
  14 }, jalview.appletgui, "ScalePanel", awt2swing.Panel, [java.awt.event.MouseMotionListener, java.awt.event.MouseListener]);\r
  15 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  16 function (av, ap) {\r
  17 Clazz.superConstructor (this, jalview.appletgui.ScalePanel, []);\r
  18 this.setName ("scalePanel");\r
  19 this.setLayout (null);\r
  20 this.av = av;\r
  21 this.ap = ap;\r
  22 this.addMouseListener (this);\r
  23 this.addMouseMotionListener (this);\r
  24 }, "jalview.appletgui.AlignViewport,jalview.appletgui.AlignmentPanel");\r
  25 Clazz.overrideMethod (c$, "mousePressed", \r
  26 function (evt) {\r
  27 var x = (Clazz.doubleToInt (evt.getX () / this.av.getCharWidth ())) + this.av.getStartRes ();\r
  28 var res;\r
  29 if (this.av.hasHiddenColumns ()) {\r
  30 res = this.av.getColumnSelection ().adjustForHiddenColumns (x);\r
  31 } else {\r
  32 res = x;\r
  33 }this.min = res;\r
  34 this.max = res;\r
  35 if ((evt.getModifiers () & 4) == 4) {\r
  36 var pop =  new awt2swing.PopupMenu ();\r
  37 if (this.reveal != null) {\r
  38 var item =  new awt2swing.MenuItem (jalview.util.MessageManager.getString ("label.reveal"));\r
  39 item.addActionListener (((Clazz.isClassDefined ("jalview.appletgui.ScalePanel$1") ? 0 : jalview.appletgui.ScalePanel.$ScalePanel$1$ ()), Clazz.innerTypeInstance (jalview.appletgui.ScalePanel$1, this, null)));\r
  40 pop.add (item);\r
  41 if (this.av.getColumnSelection ().hasManyHiddenColumns ()) {\r
  42 item =  new awt2swing.MenuItem (jalview.util.MessageManager.getString ("action.reveal_all"));\r
  43 item.addActionListener (((Clazz.isClassDefined ("jalview.appletgui.ScalePanel$2") ? 0 : jalview.appletgui.ScalePanel.$ScalePanel$2$ ()), Clazz.innerTypeInstance (jalview.appletgui.ScalePanel$2, this, null)));\r
  44 pop.add (item);\r
  45 }this.add (pop);\r
  46 pop.show (this, evt.getX (), evt.getY ());\r
  47 } else if (this.av.getColumnSelection ().contains (res)) {\r
  48 var item =  new awt2swing.MenuItem (jalview.util.MessageManager.getString ("label.hide_columns"));\r
  49 item.addActionListener (((Clazz.isClassDefined ("jalview.appletgui.ScalePanel$3") ? 0 : jalview.appletgui.ScalePanel.$ScalePanel$3$ ()), Clazz.innerTypeInstance (jalview.appletgui.ScalePanel$3, this, Clazz.cloneFinals ("res", res))));\r
  50 pop.add (item);\r
  51 this.add (pop);\r
  52 pop.show (this, evt.getX (), evt.getY ());\r
  53 }} else {\r
  54 if (!evt.isControlDown () && !evt.isShiftDown ()) {\r
  55 this.av.getColumnSelection ().clear ();\r
  56 }this.av.getColumnSelection ().addElement (res);\r
  57 var sg =  new jalview.datamodel.SequenceGroup ();\r
  58 for (var i = 0; i < this.av.getAlignment ().getSequences ().size (); i++) {\r
  59 sg.addSequence (this.av.getAlignment ().getSequenceAt (i), false);\r
  60 }\r
  61 sg.setStartRes (res);\r
  62 sg.setEndRes (res);\r
  63 this.av.setSelectionGroup (sg);\r
  64 if (evt.isShiftDown ()) {\r
  65 var min = Math.min (this.av.getColumnSelection ().getMin (), res);\r
  66 var max = Math.max (this.av.getColumnSelection ().getMax (), res);\r
  67 for (var i = min; i < max; i++) {\r
  68 this.av.getColumnSelection ().addElement (i);\r
  69 }\r
  70 sg.setStartRes (min);\r
  71 sg.setEndRes (max);\r
  72 }}this.ap.paintAlignment (true);\r
  73 this.av.sendSelection ();\r
  74 }, "java.awt.event.MouseEvent");\r
  75 Clazz.overrideMethod (c$, "mouseReleased", \r
  76 function (evt) {\r
  77 this.mouseDragging = false;\r
  78 var res = (Clazz.doubleToInt (evt.getX () / this.av.getCharWidth ())) + this.av.getStartRes ();\r
  79 if (res > this.av.getAlignment ().getWidth ()) {\r
  80 res = this.av.getAlignment ().getWidth () - 1;\r
  81 }if (this.av.hasHiddenColumns ()) {\r
  82 res = this.av.getColumnSelection ().adjustForHiddenColumns (res);\r
  83 }if (!this.stretchingGroup) {\r
  84 this.ap.paintAlignment (false);\r
  85 return;\r
  86 }var sg = this.av.getSelectionGroup ();\r
  87 if (res > sg.getStartRes ()) {\r
  88 sg.setEndRes (res);\r
  89 } else if (res < sg.getStartRes ()) {\r
  90 sg.setStartRes (res);\r
  91 }this.stretchingGroup = false;\r
  92 this.ap.paintAlignment (false);\r
  93 this.av.sendSelection ();\r
  94 }, "java.awt.event.MouseEvent");\r
  95 Clazz.overrideMethod (c$, "mouseDragged", \r
  96 function (evt) {\r
  97 this.mouseDragging = true;\r
  98 var res = (Clazz.doubleToInt (evt.getX () / this.av.getCharWidth ())) + this.av.getStartRes ();\r
  99 if (res < 0) {\r
 100 res = 0;\r
 101 }if (this.av.hasHiddenColumns ()) {\r
 102 res = this.av.getColumnSelection ().adjustForHiddenColumns (res);\r
 103 }if (res > this.av.getAlignment ().getWidth ()) {\r
 104 res = this.av.getAlignment ().getWidth () - 1;\r
 105 }if (res < this.min) {\r
 106 this.min = res;\r
 107 }if (res > this.max) {\r
 108 this.max = res;\r
 109 }var sg = this.av.getSelectionGroup ();\r
 110 if (sg != null) {\r
 111 this.stretchingGroup = true;\r
 112 if (!this.av.getColumnSelection ().contains (res)) {\r
 113 this.av.getColumnSelection ().addElement (res);\r
 114 }if (res > sg.getStartRes ()) {\r
 115 sg.setEndRes (res);\r
 116 }if (res < sg.getStartRes ()) {\r
 117 sg.setStartRes (res);\r
 118 }var col;\r
 119 for (var i = this.min; i <= this.max; i++) {\r
 120 col = this.av.getColumnSelection ().adjustForHiddenColumns (i);\r
 121 if ((col < sg.getStartRes ()) || (col > sg.getEndRes ())) {\r
 122 this.av.getColumnSelection ().removeElement (col);\r
 123 } else {\r
 124 this.av.getColumnSelection ().addElement (col);\r
 125 }}\r
 126 this.ap.paintAlignment (false);\r
 127 }}, "java.awt.event.MouseEvent");\r
 128 Clazz.overrideMethod (c$, "mouseEntered", \r
 129 function (evt) {\r
 130 if (this.mouseDragging) {\r
 131 this.ap.seqPanel.scrollCanvas (null);\r
 132 }}, "java.awt.event.MouseEvent");\r
 133 Clazz.overrideMethod (c$, "mouseExited", \r
 134 function (evt) {\r
 135 if (this.mouseDragging) {\r
 136 this.ap.seqPanel.scrollCanvas (evt);\r
 137 }}, "java.awt.event.MouseEvent");\r
 138 Clazz.overrideMethod (c$, "mouseClicked", \r
 139 function (evt) {\r
 140 }, "java.awt.event.MouseEvent");\r
 141 Clazz.overrideMethod (c$, "mouseMoved", \r
 142 function (evt) {\r
 143 if (!this.av.hasHiddenColumns ()) {\r
 144 return;\r
 145 }var res = (Clazz.doubleToInt (evt.getX () / this.av.getCharWidth ())) + this.av.getStartRes ();\r
 146 res = this.av.getColumnSelection ().adjustForHiddenColumns (res);\r
 147 this.reveal = null;\r
 148 for (var region, $region = this.av.getColumnSelection ().getHiddenColumns ().iterator (); $region.hasNext () && ((region = $region.next ()) || true);) {\r
 149 if (res + 1 == region[0] || res - 1 == region[1]) {\r
 150 this.reveal = region;\r
 151 break;\r
 152 }}\r
 153 this.repaint ();\r
 154 }, "java.awt.event.MouseEvent");\r
 155 Clazz.overrideMethod (c$, "paintComponent", \r
 156 function (g) {\r
 157 if (this.av.getWrapAlignment ()) return;\r
 158 this.drawScale (g, this.av.getStartRes (), this.av.getEndRes (), this.getSize ().width, this.getSize ().height);\r
 159 }, "java.awt.Graphics");\r
 160 Clazz.defineMethod (c$, "drawScale", \r
 161 function (gg, startx, endx, width, height) {\r
 162 gg.setFont (this.av.getFont ());\r
 163 gg.setColor (java.awt.Color.white);\r
 164 gg.fillRect (0, 0, width, height);\r
 165 gg.setColor (java.awt.Color.black);\r
 166 var cs = this.av.getColumnSelection ();\r
 167 gg.setColor ( new java.awt.Color (220, 0, 0));\r
 168 var avcharWidth = this.av.getCharWidth ();\r
 169 var avcharHeight = this.av.getCharHeight ();\r
 170 for (var i = 0; i < cs.size (); i++) {\r
 171 var sel = cs.columnAt (i);\r
 172 if (this.av.hasHiddenColumns ()) {\r
 173 sel = this.av.getColumnSelection ().findColumnPosition (sel);\r
 174 }if ((sel >= startx) && (sel <= endx)) {\r
 175 gg.fillRect ((sel - startx) * avcharWidth, 0, avcharWidth, this.getSize ().height);\r
 176 }}\r
 177 gg.setColor (java.awt.Color.black);\r
 178 var scalestartx = (Clazz.doubleToInt (startx / 10)) * 10;\r
 179 var fm = gg.getFontMetrics (this.av.getFont ());\r
 180 var y = avcharHeight - fm.getDescent ();\r
 181 if ((scalestartx % 10) == 0) {\r
 182 scalestartx += 5;\r
 183 }var string;\r
 184 var maxX = 0;\r
 185 for (var i = scalestartx; i < endx; i += 5) {\r
 186 if ((i % 10) == 0) {\r
 187 string = String.valueOf (this.av.getColumnSelection ().adjustForHiddenColumns (i));\r
 188 if ((i - startx - 1) * avcharWidth > maxX) {\r
 189 gg.drawString (string, (i - startx - 1) * avcharWidth, y);\r
 190 maxX = (i - startx + 1) * avcharWidth + fm.stringWidth (string);\r
 191 }gg.drawLine (((i - startx - 1) * avcharWidth) + (Clazz.doubleToInt (avcharWidth / 2)), y + 2, ((i - startx - 1) * avcharWidth) + (Clazz.doubleToInt (avcharWidth / 2)), y + (fm.getDescent () * 2));\r
 192 } else {\r
 193 gg.drawLine (((i - startx - 1) * avcharWidth) + (Clazz.doubleToInt (avcharWidth / 2)), y + fm.getDescent (), ((i - startx - 1) * avcharWidth) + (Clazz.doubleToInt (avcharWidth / 2)), y + (fm.getDescent () * 2));\r
 194 }}\r
 195 if (this.av.hasHiddenColumns ()) {\r
 196 gg.setColor (java.awt.Color.blue);\r
 197 var res;\r
 198 if (this.av.getShowHiddenMarkers ()) {\r
 199 for (var i = 0; i < this.av.getColumnSelection ().getHiddenColumns ().size (); i++) {\r
 200 res = this.av.getColumnSelection ().findHiddenRegionPosition (i) - startx;\r
 201 if (res < 0 || res > endx - scalestartx) {\r
 202 continue;\r
 203 }gg.fillPolygon ( Clazz.newIntArray (-1, [res * avcharWidth - Clazz.doubleToInt (avcharHeight / 4), res * avcharWidth + Clazz.doubleToInt (avcharHeight / 4), res * avcharWidth]),  Clazz.newIntArray (-1, [y - Clazz.doubleToInt (avcharHeight / 2), y - Clazz.doubleToInt (avcharHeight / 2), y + 8]), 3);\r
 204 }\r
 205 }if (this.reveal != null && this.reveal[0] > startx && this.reveal[0] < endx) {\r
 206 gg.drawString (jalview.util.MessageManager.getString ("label.reveal_columns"), this.reveal[0] * avcharWidth, 0);\r
 207 }}}, "java.awt.Graphics,~N,~N,~N,~N");\r
 208 c$.$ScalePanel$1$ = function () {\r
 209 Clazz.pu$h(self.c$);\r
 210 c$ = Clazz.declareAnonymous (jalview.appletgui, "ScalePanel$1", null, java.awt.event.ActionListener);\r
 211 Clazz.overrideMethod (c$, "actionPerformed", \r
 212 function (e) {\r
 213 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].av.showColumn (this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].reveal[0]);\r
 214 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].reveal = null;\r
 215 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.paintAlignment (true);\r
 216 if (this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.overviewPanel != null) {\r
 217 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.overviewPanel.updateOverviewImage ();\r
 218 }}, "java.awt.event.ActionEvent");\r
 219 c$ = Clazz.p0p ();\r
 220 };\r
 221 c$.$ScalePanel$2$ = function () {\r
 222 Clazz.pu$h(self.c$);\r
 223 c$ = Clazz.declareAnonymous (jalview.appletgui, "ScalePanel$2", null, java.awt.event.ActionListener);\r
 224 Clazz.overrideMethod (c$, "actionPerformed", \r
 225 function (e) {\r
 226 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].av.showAllHiddenColumns ();\r
 227 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].reveal = null;\r
 228 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.paintAlignment (true);\r
 229 if (this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.overviewPanel != null) {\r
 230 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.overviewPanel.updateOverviewImage ();\r
 231 }}, "java.awt.event.ActionEvent");\r
 232 c$ = Clazz.p0p ();\r
 233 };\r
 234 c$.$ScalePanel$3$ = function () {\r
 235 Clazz.pu$h(self.c$);\r
 236 c$ = Clazz.declareAnonymous (jalview.appletgui, "ScalePanel$3", null, java.awt.event.ActionListener);\r
 237 Clazz.overrideMethod (c$, "actionPerformed", \r
 238 function (e) {\r
 239 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].av.hideColumns (this.f$.res, this.f$.res);\r
 240 if (this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].av.getSelectionGroup () != null && this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].av.getSelectionGroup ().getSize () == this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].av.getAlignment ().getHeight ()) {\r
 241 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].av.setSelectionGroup (null);\r
 242 }this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.paintAlignment (true);\r
 243 if (this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.overviewPanel != null) {\r
 244 this.b$["jalview.appletgui.ScalePanel"].ap.overviewPanel.updateOverviewImage ();\r
 245 }}, "java.awt.event.ActionEvent");\r
 246 c$ = Clazz.p0p ();\r
 247 };\r
 248 });\r