site/j2s/jalview/datamodel/Annotation.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");\r
   2 Clazz.load (null, "jalview.datamodel.Annotation", ["java.lang.Float", "$.StringBuffer"], function () {\r
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
   4 this.displayCharacter = "";\r
   5 this.description = "";\r
   6 this.secondaryStructure = ' ';\r
   7 this.value = 0;\r
   8 this.colour = null;\r
   9 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
  10 }, jalview.datamodel, "Annotation");\r
  11 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  12 function (displayChar, desc, ss, val) {\r
  13 this.displayCharacter = displayChar;\r
  14 this.description = desc;\r
  15 this.secondaryStructure = ss;\r
  16 this.value = val;\r
  17 }, "~S,~S,~S,~N");\r
  18 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  19 function (displayChar, desc, ss, val, colour) {\r
  20 this.construct (displayChar, desc, ss, val);\r
  21 this.colour = colour;\r
  22 }, "~S,~S,~S,~N,java.awt.Color");\r
  23 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  24 function (that) {\r
  25 if (that == null || this === that) {\r
  26 return;\r
  27 }if (that.displayCharacter != null) this.displayCharacter =  String.instantialize (that.displayCharacter);\r
  28 if (that.description != null) this.description =  String.instantialize (that.description);\r
  29 this.secondaryStructure = that.secondaryStructure;\r
  30 this.value = that.value;\r
  31 this.colour = that.colour;\r
  32 }, "jalview.datamodel.Annotation");\r
  33 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  34 function (val) {\r
  35 this.construct (null, null, ' ', val, null);\r
  36 }, "~N");\r
  37 Clazz.overrideMethod (c$, "toString", \r
  38 function () {\r
  39 var sb =  new StringBuffer ();\r
  40 if (this.displayCharacter != null) {\r
  41 sb.append ("\'");\r
  42 sb.append (this.displayCharacter);\r
  43 sb.append ("\'");\r
  44 }{\r
  45 sb.append (",");\r
  46 }if (this.secondaryStructure.charCodeAt (0) != 0 && !("" + this.displayCharacter).equals ("" + this.secondaryStructure)) {\r
  47 sb.append ("\'");\r
  48 sb.append (this.secondaryStructure);\r
  49 sb.append ("\'");\r
  50 }{\r
  51 sb.append (",");\r
  52 }if (this.description != null && this.description.length > 0) {\r
  53 sb.append ("\"");\r
  54 sb.append (this.description);\r
  55 sb.append ("\"");\r
  56 }{\r
  57 sb.append (",");\r
  58 }if (!Float.isNaN (this.value)) {\r
  59 sb.append (this.value);\r
  60 }if (this.colour != null) {\r
  61 if (sb.length () > 0) {\r
  62 sb.append (",");\r
  63 }sb.append ("[");\r
  64 sb.append (this.colour.getRed ());\r
  65 sb.append (",");\r
  66 sb.append (this.colour.getGreen ());\r
  67 sb.append (",");\r
  68 sb.append (this.colour.getBlue ());\r
  69 sb.append ("]");\r
  70 }return sb.toString ();\r
  71 });\r
  72 });\r