site/j2s/jalview/datamodel/PDBEntry.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");
   2 Clazz.load (["java.lang.Enum"], "jalview.datamodel.PDBEntry", null, function () {
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
   4 this.file = null;
   5 this.type = null;
   6 this.id = null;
   7 this.chainCode = null;
   8 this.properties = null;
   9 Clazz.instantialize (this, arguments);
  10 }, jalview.datamodel, "PDBEntry");
  11 Clazz.overrideMethod (c$, "equals",
  12 function (obj) {
  13 if (obj == null || !(Clazz.instanceOf (obj, jalview.datamodel.PDBEntry))) {
  14 return false;
  15 }if (obj === this) {
  16 return true;
  17 }var o = obj;
  18 return (this.type === o.type || (this.type != null && o.type != null && o.type.equals (this.type))) && (this.id === o.id || (this.id != null && o.id != null && o.id.equalsIgnoreCase (this.id))) && (this.chainCode === o.chainCode || (this.chainCode != null && o.chainCode != null && o.chainCode.equalsIgnoreCase (this.chainCode))) && (this.properties === o.properties || (this.properties != null && o.properties != null && this.properties.equals (o.properties)));
  19 }, "~O");
  20 Clazz.makeConstructor (c$,
  21 function () {
  22 });
  23 Clazz.makeConstructor (c$,
  24 function (pdbId, chain, type, filePath) {
  25 this.id = pdbId;
  26 this.chainCode = chain;
  27 this.type = type == null ? null : type.toString ();
  28 this.file = filePath;
  29 }, "~S,~S,jalview.datamodel.PDBEntry.Type,~S");
  30 Clazz.makeConstructor (c$,
  31 function (entry) {
  32 this.file = entry.file;
  33 this.type = entry.type;
  34 this.id = entry.id;
  35 this.chainCode = entry.chainCode;
  36 if (entry.properties != null) {
  37 this.properties = entry.properties.clone ();
  38 }}, "jalview.datamodel.PDBEntry");
  39 Clazz.defineMethod (c$, "setFile",
  40 function (file) {
  41 this.file = file;
  42 }, "~S");
  43 Clazz.defineMethod (c$, "getFile",
  44 function () {
  45 return this.file;
  46 });
  47 Clazz.defineMethod (c$, "setType",
  48 function (t) {
  49 this.type = t;
  50 }, "~S");
  51 Clazz.defineMethod (c$, "setType",
  52 function (type) {
  53 this.type = type == null ? null : type.toString ();
  54 }, "jalview.datamodel.PDBEntry.Type");
  55 Clazz.defineMethod (c$, "getType",
  56 function () {
  57 return this.type;
  58 });
  59 Clazz.defineMethod (c$, "setId",
  60 function (id) {
  61 this.id = id;
  62 }, "~S");
  63 Clazz.defineMethod (c$, "getId",
  64 function () {
  65 return this.id;
  66 });
  67 Clazz.defineMethod (c$, "setProperty",
  68 function (property) {
  69 this.properties = property;
  70 }, "java.util.Hashtable");
  71 Clazz.defineMethod (c$, "getProperty",
  72 function () {
  73 return this.properties;
  74 });
  75 Clazz.defineMethod (c$, "getChainCode",
  76 function () {
  77 return this.chainCode;
  78 });
  79 Clazz.defineMethod (c$, "setChainCode",
  80 function (chainCode) {
  81 this.chainCode = chainCode;
  82 }, "~S");
  83 Clazz.pu$h(self.c$);
  84 c$ = Clazz.declareType (jalview.datamodel.PDBEntry, "Type", Enum);
  85 Clazz.defineEnumConstant (c$, "PDB", 0, []);
  86 Clazz.defineEnumConstant (c$, "FILE", 1, []);
  87 c$ = Clazz.p0p ();
  88 });