site/j2s/jalview/datamodel/UniprotEntry.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");
   2 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
   3 this.sequence = null;
   4 this.name = null;
   5 this.accession = null;
   6 this.feature = null;
   7 this.dbrefs = null;
   8 this.protName = null;
   9 Clazz.instantialize (this, arguments);
  10 }, jalview.datamodel, "UniprotEntry");
  11 Clazz.defineMethod (c$, "setAccession",
  12 function (items) {
  13 this.accession = items;
  14 }, "java.util.Vector");
  15 Clazz.defineMethod (c$, "setFeature",
  16 function (items) {
  17 this.feature = items;
  18 }, "java.util.Vector");
  19 Clazz.defineMethod (c$, "getFeature",
  20 function () {
  21 return this.feature;
  22 });
  23 Clazz.defineMethod (c$, "getAccession",
  24 function () {
  25 return this.accession;
  26 });
  27 Clazz.defineMethod (c$, "setProtein",
  28 function (names) {
  29 this.protName = names;
  30 }, "jalview.datamodel.UniprotProteinName");
  31 Clazz.defineMethod (c$, "getProtein",
  32 function () {
  33 return this.protName;
  34 });
  35 Clazz.defineMethod (c$, "setName",
  36 function (na) {
  37 this.name = na;
  38 }, "java.util.Vector");
  39 Clazz.defineMethod (c$, "getName",
  40 function () {
  41 return this.name;
  42 });
  43 Clazz.defineMethod (c$, "getUniprotSequence",
  44 function () {
  45 return this.sequence;
  46 });
  47 Clazz.defineMethod (c$, "setUniprotSequence",
  48 function (seq) {
  49 this.sequence = seq;
  50 }, "jalview.datamodel.UniprotSequence");
  51 Clazz.defineMethod (c$, "getDbReference",
  52 function () {
  53 return this.dbrefs;
  54 });
  55 Clazz.defineMethod (c$, "setDbReference",
  56 function (dbref) {
  57 this.dbrefs = dbref;
  58 }, "java.util.Vector");