site/j2s/jalview/math/RotatableMatrix.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.math");\r
   2 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
   3 this.matrix = null;\r
   4 this.temp = null;\r
   5 this.rot = null;\r
   6 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
   7 }, jalview.math, "RotatableMatrix");\r
   8 Clazz.makeConstructor (c$, \r
   9 function (rows, cols) {\r
  10 this.matrix =  Clazz.newFloatArray (rows, cols, 0);\r
  11 this.temp =  Clazz.newFloatArray (3, 0);\r
  12 this.rot =  Clazz.newFloatArray (3, 3, 0);\r
  13 }, "~N,~N");\r
  14 Clazz.defineMethod (c$, "addElement", \r
  15 function (i, j, value) {\r
  16 this.matrix[i][j] = value;\r
  17 }, "~N,~N,~N");\r
  18 Clazz.defineMethod (c$, "print", \r
  19 function () {\r
  20 System.out.println (this.matrix[0][0] + " " + this.matrix[0][1] + " " + this.matrix[0][2]);\r
  21 System.out.println (this.matrix[1][0] + " " + this.matrix[1][1] + " " + this.matrix[1][2]);\r
  22 System.out.println (this.matrix[2][0] + " " + this.matrix[2][1] + " " + this.matrix[2][2]);\r
  23 });\r
  24 Clazz.defineMethod (c$, "rotate", \r
  25 function (degrees, axis) {\r
  26 var costheta = Math.cos ((degrees * 3.141592653589793) / 180.0);\r
  27 var sintheta = Math.sin ((degrees * 3.141592653589793) / 180.0);\r
  28 if (axis == 'z') {\r
  29 this.rot[0][0] = costheta;\r
  30 this.rot[0][1] = -sintheta;\r
  31 this.rot[0][2] = 0.0;\r
  32 this.rot[1][0] = sintheta;\r
  33 this.rot[1][1] = costheta;\r
  34 this.rot[1][2] = 0.0;\r
  35 this.rot[2][0] = 0.0;\r
  36 this.rot[2][1] = 0.0;\r
  37 this.rot[2][2] = 1.0;\r
  38 this.preMultiply (this.rot);\r
  39 }if (axis == 'x') {\r
  40 this.rot[0][0] = 1.0;\r
  41 this.rot[0][1] = 0.0;\r
  42 this.rot[0][2] = 0.0;\r
  43 this.rot[1][0] = 0.0;\r
  44 this.rot[1][1] = costheta;\r
  45 this.rot[1][2] = sintheta;\r
  46 this.rot[2][0] = 0.0;\r
  47 this.rot[2][1] = -sintheta;\r
  48 this.rot[2][2] = costheta;\r
  49 this.preMultiply (this.rot);\r
  50 }if (axis == 'y') {\r
  51 this.rot[0][0] = costheta;\r
  52 this.rot[0][1] = 0.0;\r
  53 this.rot[0][2] = -sintheta;\r
  54 this.rot[1][0] = 0.0;\r
  55 this.rot[1][1] = 1.0;\r
  56 this.rot[1][2] = 0.0;\r
  57 this.rot[2][0] = sintheta;\r
  58 this.rot[2][1] = 0.0;\r
  59 this.rot[2][2] = costheta;\r
  60 this.preMultiply (this.rot);\r
  61 }}, "~N,~S");\r
  62 Clazz.defineMethod (c$, "vectorMultiply", \r
  63 function (vect) {\r
  64 this.temp[0] = vect[0];\r
  65 this.temp[1] = vect[1];\r
  66 this.temp[2] = vect[2];\r
  67 for (var i = 0; i < 3; i++) {\r
  68 this.temp[i] = (this.matrix[i][0] * vect[0]) + (this.matrix[i][1] * vect[1]) + (this.matrix[i][2] * vect[2]);\r
  69 }\r
  70 vect[0] = this.temp[0];\r
  71 vect[1] = this.temp[1];\r
  72 vect[2] = this.temp[2];\r
  73 return vect;\r
  74 }, "~A");\r
  75 Clazz.defineMethod (c$, "preMultiply", \r
  76 function (mat) {\r
  77 var tmp =  Clazz.newFloatArray (3, 3, 0);\r
  78 for (var i = 0; i < 3; i++) {\r
  79 for (var j = 0; j < 3; j++) {\r
  80 tmp[i][j] = (mat[i][0] * this.matrix[0][j]) + (mat[i][1] * this.matrix[1][j]) + (mat[i][2] * this.matrix[2][j]);\r
  81 }\r
  82 }\r
  83 for (var i = 0; i < 3; i++) {\r
  84 for (var j = 0; j < 3; j++) {\r
  85 this.matrix[i][j] = tmp[i][j];\r
  86 }\r
  87 }\r
  88 }, "~A");\r
  89 Clazz.defineMethod (c$, "postMultiply", \r
  90 function (mat) {\r
  91 var tmp =  Clazz.newFloatArray (3, 3, 0);\r
  92 for (var i = 0; i < 3; i++) {\r
  93 for (var j = 0; j < 3; j++) {\r
  94 tmp[i][j] = (this.matrix[i][0] * mat[0][j]) + (this.matrix[i][1] * mat[1][j]) + (this.matrix[i][2] * mat[2][j]);\r
  95 }\r
  96 }\r
  97 for (var i = 0; i < 3; i++) {\r
  98 for (var j = 0; j < 3; j++) {\r
  99 this.matrix[i][j] = tmp[i][j];\r
 100 }\r
 101 }\r
 102 }, "~A");\r
 103 Clazz.defineMethod (c$, "setIdentity", \r
 104 function () {\r
 105 this.matrix[0][0] = 1.0;\r
 106 this.matrix[1][1] = 1.0;\r
 107 this.matrix[2][2] = 1.0;\r
 108 this.matrix[0][1] = 0.0;\r
 109 this.matrix[0][2] = 0.0;\r
 110 this.matrix[1][0] = 0.0;\r
 111 this.matrix[1][2] = 0.0;\r
 112 this.matrix[2][0] = 0.0;\r
 113 this.matrix[2][1] = 0.0;\r
 114 });\r