site/j2s/jalview/math/RotatableMatrix.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.math");
   2 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
   3 this.matrix = null;
   4 this.temp = null;
   5 this.rot = null;
   6 Clazz.instantialize (this, arguments);
   7 }, jalview.math, "RotatableMatrix");
   8 Clazz.makeConstructor (c$,
   9 function (rows, cols) {
  10 this.matrix =  Clazz.newFloatArray (rows, cols, 0);
  11 this.temp =  Clazz.newFloatArray (3, 0);
  12 this.rot =  Clazz.newFloatArray (3, 3, 0);
  13 }, "~N,~N");
  14 Clazz.defineMethod (c$, "addElement",
  15 function (i, j, value) {
  16 this.matrix[i][j] = value;
  17 }, "~N,~N,~N");
  18 Clazz.defineMethod (c$, "print",
  19 function () {
  20 System.out.println (this.matrix[0][0] + " " + this.matrix[0][1] + " " + this.matrix[0][2]);
  21 System.out.println (this.matrix[1][0] + " " + this.matrix[1][1] + " " + this.matrix[1][2]);
  22 System.out.println (this.matrix[2][0] + " " + this.matrix[2][1] + " " + this.matrix[2][2]);
  23 });
  24 Clazz.defineMethod (c$, "rotate",
  25 function (degrees, axis) {
  26 var costheta = Math.cos ((degrees * 3.141592653589793) / 180.0);
  27 var sintheta = Math.sin ((degrees * 3.141592653589793) / 180.0);
  28 if (axis == 'z') {
  29 this.rot[0][0] = costheta;
  30 this.rot[0][1] = -sintheta;
  31 this.rot[0][2] = 0.0;
  32 this.rot[1][0] = sintheta;
  33 this.rot[1][1] = costheta;
  34 this.rot[1][2] = 0.0;
  35 this.rot[2][0] = 0.0;
  36 this.rot[2][1] = 0.0;
  37 this.rot[2][2] = 1.0;
  38 this.preMultiply (this.rot);
  39 }if (axis == 'x') {
  40 this.rot[0][0] = 1.0;
  41 this.rot[0][1] = 0.0;
  42 this.rot[0][2] = 0.0;
  43 this.rot[1][0] = 0.0;
  44 this.rot[1][1] = costheta;
  45 this.rot[1][2] = sintheta;
  46 this.rot[2][0] = 0.0;
  47 this.rot[2][1] = -sintheta;
  48 this.rot[2][2] = costheta;
  49 this.preMultiply (this.rot);
  50 }if (axis == 'y') {
  51 this.rot[0][0] = costheta;
  52 this.rot[0][1] = 0.0;
  53 this.rot[0][2] = -sintheta;
  54 this.rot[1][0] = 0.0;
  55 this.rot[1][1] = 1.0;
  56 this.rot[1][2] = 0.0;
  57 this.rot[2][0] = sintheta;
  58 this.rot[2][1] = 0.0;
  59 this.rot[2][2] = costheta;
  60 this.preMultiply (this.rot);
  61 }}, "~N,~S");
  62 Clazz.defineMethod (c$, "vectorMultiply",
  63 function (vect) {
  64 this.temp[0] = vect[0];
  65 this.temp[1] = vect[1];
  66 this.temp[2] = vect[2];
  67 for (var i = 0; i < 3; i++) {
  68 this.temp[i] = (this.matrix[i][0] * vect[0]) + (this.matrix[i][1] * vect[1]) + (this.matrix[i][2] * vect[2]);
  69 }
  70 vect[0] = this.temp[0];
  71 vect[1] = this.temp[1];
  72 vect[2] = this.temp[2];
  73 return vect;
  74 }, "~A");
  75 Clazz.defineMethod (c$, "preMultiply",
  76 function (mat) {
  77 var tmp =  Clazz.newFloatArray (3, 3, 0);
  78 for (var i = 0; i < 3; i++) {
  79 for (var j = 0; j < 3; j++) {
  80 tmp[i][j] = (mat[i][0] * this.matrix[0][j]) + (mat[i][1] * this.matrix[1][j]) + (mat[i][2] * this.matrix[2][j]);
  81 }
  82 }
  83 for (var i = 0; i < 3; i++) {
  84 for (var j = 0; j < 3; j++) {
  85 this.matrix[i][j] = tmp[i][j];
  86 }
  87 }
  88 }, "~A");
  89 Clazz.defineMethod (c$, "postMultiply",
  90 function (mat) {
  91 var tmp =  Clazz.newFloatArray (3, 3, 0);
  92 for (var i = 0; i < 3; i++) {
  93 for (var j = 0; j < 3; j++) {
  94 tmp[i][j] = (this.matrix[i][0] * mat[0][j]) + (this.matrix[i][1] * mat[1][j]) + (this.matrix[i][2] * mat[2][j]);
  95 }
  96 }
  97 for (var i = 0; i < 3; i++) {
  98 for (var j = 0; j < 3; j++) {
  99 this.matrix[i][j] = tmp[i][j];
 100 }
 101 }
 102 }, "~A");
 103 Clazz.defineMethod (c$, "setIdentity",
 104 function () {
 105 this.matrix[0][0] = 1.0;
 106 this.matrix[1][1] = 1.0;
 107 this.matrix[2][2] = 1.0;
 108 this.matrix[0][1] = 0.0;
 109 this.matrix[0][2] = 0.0;
 110 this.matrix[1][0] = 0.0;
 111 this.matrix[1][2] = 0.0;
 112 this.matrix[2][0] = 0.0;
 113 this.matrix[2][1] = 0.0;
 114 });