site/j2s/jalview/viewmodel/styles/ViewStyle.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.viewmodel.styles");
   2 Clazz.load (["jalview.api.ViewStyleI", "java.awt.Color"], "jalview.viewmodel.styles.ViewStyle", ["java.lang.Boolean"], function () {
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
   4 this.abovePIDThreshold = false;
   5 this.charHeight = 0;
   6 this.charWidth = 0;
   7 this.idWidth = -1;
   8 this.colourAppliesToAllGroups = false;
   9 this.centreColumnLabels = false;
  10 this.showdbrefs = false;
  11 this.shownpfeats = false;
  12 this.colourByReferenceSeq = false;
  13 this.conservationColourSelected = false;
  14 this.displayReferenceSeq = false;
  15 this.increment = 0;
  16 this.renderGaps = true;
  17 this.rightAlignIds = false;
  18 this.scaleAboveWrapped = false;
  19 this.scaleLeftWrapped = true;
  20 this.scaleRightWrapped = true;
  21 this.seqNameItalics = false;
  22 this.showAnnotation = true;
  23 this.showBoxes = true;
  24 this.showColourText = false;
  25 this.showHiddenMarkers = true;
  26 this.showJVSuffix = true;
  27 this.showSeqFeaturesHeight = false;
  28 this.showSequenceFeatures = false;
  29 this.showText = true;
  30 this.showUnconserved = false;
  31 this.textColour = null;
  32 this.textColour2 = null;
  33 this.threshold = 0;
  34 this.thresholdTextColour = 0;
  35 this.upperCasebold = false;
  36 this.fontName = null;
  37 this.fontSize = 0;
  38 this.scaleProteinAsCdna = true;
  39 this.wrapAlignment = false;
  40 this.wrappedWidth = 0;
  41 this.fontStyle = 0;
  42 Clazz.instantialize (this, arguments);
  43 }, jalview.viewmodel.styles, "ViewStyle", null, jalview.api.ViewStyleI);
  44 Clazz.prepareFields (c$, function () {
  45 this.textColour = java.awt.Color.black;
  46 this.textColour2 = java.awt.Color.white;
  47 });
  48 Clazz.makeConstructor (c$,
  49 function (vs) {
  50 this.setAbovePIDThreshold (vs.getAbovePIDThreshold ());
  51 this.setCentreColumnLabels (vs.isCentreColumnLabels ());
  52 this.setCharHeight (vs.getCharHeight ());
  53 this.setCharWidth (vs.getCharWidth ());
  54 this.setColourAppliesToAllGroups (vs.getColourAppliesToAllGroups ());
  55 this.setColourByReferenceSeq (vs.isColourByReferenceSeq ());
  56 this.setColourText (vs.getColourText ());
  57 this.setConservationColourSelected (vs.isConservationColourSelected ());
  58 this.setConservationSelected (vs.getConservationSelected ());
  59 this.setDisplayReferenceSeq (vs.isDisplayReferenceSeq ());
  60 this.setFontName (vs.getFontName ());
  61 this.setFontSize (vs.getFontSize ());
  62 this.setFontStyle (vs.getFontStyle ());
  63 this.setIdWidth (vs.getIdWidth ());
  64 this.setIncrement (vs.getIncrement ());
  65 this.setRenderGaps (vs.isRenderGaps ());
  66 this.setRightAlignIds (vs.isRightAlignIds ());
  67 this.setScaleAboveWrapped (vs.getScaleAboveWrapped ());
  68 this.setScaleLeftWrapped (vs.getScaleLeftWrapped ());
  69 this.setScaleProteinAsCdna (vs.isScaleProteinAsCdna ());
  70 this.setScaleRightWrapped (vs.getScaleRightWrapped ());
  71 this.setSeqNameItalics (vs.isSeqNameItalics ());
  72 this.setShowAnnotation (vs.isShowAnnotation ());
  73 this.setShowBoxes (vs.getShowBoxes ());
  74 this.setShowColourText (vs.isShowColourText ());
  75 this.setShowDBRefs (vs.isShowDBRefs ());
  76 this.setShowHiddenMarkers (vs.getShowHiddenMarkers ());
  77 this.setShowJVSuffix (vs.getShowJVSuffix ());
  78 this.setShowNPFeats (vs.isShowNPFeats ());
  79 this.setShowSequenceFeaturesHeight (vs.isShowSequenceFeaturesHeight ());
  80 this.setShowSequenceFeatures (vs.isShowSequenceFeatures ());
  81 this.setShowText (vs.getShowText ());
  82 this.setShowUnconserved (vs.getShowUnconserved ());
  83 this.setTextColour (vs.getTextColour ());
  84 this.setTextColour2 (vs.getTextColour2 ());
  85 this.setThreshold (vs.getThreshold ());
  86 this.setThresholdTextColour (vs.getThresholdTextColour ());
  87 this.setUpperCasebold (vs.isUpperCasebold ());
  88 this.setWrapAlignment (vs.getWrapAlignment ());
  89 this.setWrappedWidth (vs.getWrappedWidth ());
  90 }, "jalview.api.ViewStyleI");
  91 Clazz.makeConstructor (c$,
  92 function () {
  93 });
  94 Clazz.overrideMethod (c$, "equals",
  95 function (other) {
  96 if (other == null || !(Clazz.instanceOf (other, jalview.viewmodel.styles.ViewStyle))) {
  97 return false;
  98 }var vs = other;
  99 var match = (this.getAbovePIDThreshold () == vs.getAbovePIDThreshold () && this.isCentreColumnLabels () == vs.isCentreColumnLabels () && this.getCharHeight () == vs.getCharHeight () && this.getCharWidth () == vs.getCharWidth () && this.getColourAppliesToAllGroups () == vs.getColourAppliesToAllGroups () && this.isColourByReferenceSeq () == vs.isColourByReferenceSeq () && this.getColourText () == vs.getColourText () && this.isConservationColourSelected () == vs.isConservationColourSelected () && this.getConservationSelected () == vs.getConservationSelected () && this.isDisplayReferenceSeq () == vs.isDisplayReferenceSeq () && this.getFontSize () == vs.getFontSize () && this.getFontStyle () == vs.getFontStyle () && this.getIdWidth () == vs.getIdWidth () && this.getIncrement () == vs.getIncrement () && this.isRenderGaps () == vs.isRenderGaps () && this.isRightAlignIds () == vs.isRightAlignIds () && this.getScaleAboveWrapped () == vs.getScaleAboveWrapped () && this.getScaleLeftWrapped () == vs.getScaleLeftWrapped () && this.isScaleProteinAsCdna () == vs.isScaleProteinAsCdna () && this.getScaleRightWrapped () == vs.getScaleRightWrapped () && this.isSeqNameItalics () == vs.isSeqNameItalics () && this.isShowAnnotation () == vs.isShowAnnotation () && this.getShowBoxes () == vs.getShowBoxes () && this.isShowColourText () == vs.isShowColourText () && this.isShowDBRefs () == vs.isShowDBRefs () && this.getShowHiddenMarkers () == vs.getShowHiddenMarkers () && this.getShowJVSuffix () == vs.getShowJVSuffix () && this.isShowNPFeats () == vs.isShowNPFeats () && this.isShowSequenceFeaturesHeight () == vs.isShowSequenceFeaturesHeight () && this.isShowSequenceFeatures () == vs.isShowSequenceFeatures () && this.getShowText () == vs.getShowText () && this.getShowUnconserved () == vs.getShowUnconserved () && this.getThreshold () == vs.getThreshold () && this.getThresholdTextColour () == vs.getThresholdTextColour () && this.isUpperCasebold () == vs.isUpperCasebold () && this.getWrapAlignment () == vs.getWrapAlignment () && this.getWrappedWidth () == vs.getWrappedWidth ());
 100 match = match && String.valueOf (this.getFontName ()).equals (String.valueOf (vs.getFontName ()));
 101 match = match && String.valueOf (this.getTextColour ()).equals (String.valueOf (vs.getTextColour ()));
 102 match = match && String.valueOf (this.getTextColour2 ()).equals (String.valueOf (vs.getTextColour2 ()));
 103 return match;
 104 }, "~O");
 105 Clazz.overrideMethod (c$, "hashCode",
 106 function () {
 107 var hash = 0;
 108 var m = 1;
 109 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.abovePIDThreshold).hashCode ();
 110 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.centreColumnLabels).hashCode ();
 111 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.colourAppliesToAllGroups).hashCode ();
 112 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.displayReferenceSeq).hashCode ();
 113 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.renderGaps).hashCode ();
 114 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.rightAlignIds).hashCode ();
 115 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.scaleProteinAsCdna).hashCode ();
 116 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.scaleRightWrapped).hashCode ();
 117 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.seqNameItalics).hashCode ();
 118 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.showAnnotation).hashCode ();
 119 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.showBoxes).hashCode ();
 120 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.showdbrefs).hashCode ();
 121 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.showJVSuffix).hashCode ();
 122 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.showSequenceFeatures).hashCode ();
 123 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.showUnconserved).hashCode ();
 124 hash += m++ * Boolean.$valueOf (this.wrapAlignment).hashCode ();
 125 hash += m++ * this.charHeight;
 126 hash += m++ * this.charWidth;
 127 hash += m++ * this.fontSize;
 128 hash += m++ * this.fontStyle;
 129 hash += m++ * this.idWidth;
 130 hash += String.valueOf (this.fontName).hashCode ();
 131 return hash;
 132 });
 133 Clazz.defineMethod (c$, "isUpperCasebold",
 134 function () {
 135 return this.upperCasebold;
 136 });
 137 Clazz.overrideMethod (c$, "setUpperCasebold",
 138 function (upperCasebold) {
 139 this.upperCasebold = upperCasebold;
 140 }, "~B");
 141 Clazz.defineMethod (c$, "getAbovePIDThreshold",
 142 function () {
 143 return this.abovePIDThreshold;
 144 });
 145 Clazz.defineMethod (c$, "getCharHeight",
 146 function () {
 147 return this.charHeight;
 148 });
 149 Clazz.defineMethod (c$, "getCharWidth",
 150 function () {
 151 return this.charWidth;
 152 });
 153 Clazz.defineMethod (c$, "getColourAppliesToAllGroups",
 154 function () {
 155 return this.colourAppliesToAllGroups;
 156 });
 157 Clazz.defineMethod (c$, "getColourText",
 158 function () {
 159 return this.showColourText;
 160 });
 161 Clazz.defineMethod (c$, "getConservationSelected",
 162 function () {
 163 return this.conservationColourSelected;
 164 });
 165 Clazz.defineMethod (c$, "getIncrement",
 166 function () {
 167 return this.increment;
 168 });
 169 Clazz.defineMethod (c$, "getScaleAboveWrapped",
 170 function () {
 171 return this.scaleAboveWrapped;
 172 });
 173 Clazz.defineMethod (c$, "getScaleLeftWrapped",
 174 function () {
 175 return this.scaleLeftWrapped;
 176 });
 177 Clazz.defineMethod (c$, "getScaleRightWrapped",
 178 function () {
 179 return this.scaleRightWrapped;
 180 });
 181 Clazz.defineMethod (c$, "getShowBoxes",
 182 function () {
 183 return this.showBoxes;
 184 });
 185 Clazz.defineMethod (c$, "getShowHiddenMarkers",
 186 function () {
 187 return this.showHiddenMarkers;
 188 });
 189 Clazz.defineMethod (c$, "getShowJVSuffix",
 190 function () {
 191 return this.showJVSuffix;
 192 });
 193 Clazz.defineMethod (c$, "getShowText",
 194 function () {
 195 return this.showText;
 196 });
 197 Clazz.defineMethod (c$, "getShowUnconserved",
 198 function () {
 199 return this.showUnconserved;
 200 });
 201 Clazz.defineMethod (c$, "getTextColour",
 202 function () {
 203 return this.textColour;
 204 });
 205 Clazz.defineMethod (c$, "getTextColour2",
 206 function () {
 207 return this.textColour2;
 208 });
 209 Clazz.defineMethod (c$, "getThreshold",
 210 function () {
 211 return this.threshold;
 212 });
 213 Clazz.defineMethod (c$, "getThresholdTextColour",
 214 function () {
 215 return this.thresholdTextColour;
 216 });
 217 Clazz.defineMethod (c$, "getWrapAlignment",
 218 function () {
 219 return this.wrapAlignment;
 220 });
 221 Clazz.defineMethod (c$, "getWrappedWidth",
 222 function () {
 223 return this.wrappedWidth;
 224 });
 225 Clazz.defineMethod (c$, "isColourByReferenceSeq",
 226 function () {
 227 return this.colourByReferenceSeq;
 228 });
 229 Clazz.defineMethod (c$, "isConservationColourSelected",
 230 function () {
 231 return this.conservationColourSelected;
 232 });
 233 Clazz.defineMethod (c$, "isDisplayReferenceSeq",
 234 function () {
 235 return this.displayReferenceSeq;
 236 });
 237 Clazz.defineMethod (c$, "isRenderGaps",
 238 function () {
 239 return this.renderGaps;
 240 });
 241 Clazz.defineMethod (c$, "isRightAlignIds",
 242 function () {
 243 return this.rightAlignIds;
 244 });
 245 Clazz.defineMethod (c$, "isSeqNameItalics",
 246 function () {
 247 return this.seqNameItalics;
 248 });
 249 Clazz.defineMethod (c$, "isShowAnnotation",
 250 function () {
 251 return this.showAnnotation;
 252 });
 253 Clazz.defineMethod (c$, "isShowColourText",
 254 function () {
 255 return this.showColourText;
 256 });
 257 Clazz.defineMethod (c$, "isShowSequenceFeaturesHeight",
 258 function () {
 259 return this.showSeqFeaturesHeight;
 260 });
 261 Clazz.defineMethod (c$, "isShowSequenceFeatures",
 262 function () {
 263 return this.showSequenceFeatures;
 264 });
 265 Clazz.overrideMethod (c$, "setAbovePIDThreshold",
 266 function (b) {
 267 this.abovePIDThreshold = b;
 268 }, "~B");
 269 Clazz.overrideMethod (c$, "setCharHeight",
 270 function (h) {
 271 this.charHeight = h;
 272 }, "~N");
 273 Clazz.overrideMethod (c$, "setCharWidth",
 274 function (w) {
 275 this.charWidth = w;
 276 }, "~N");
 277 Clazz.overrideMethod (c$, "setColourAppliesToAllGroups",
 278 function (b) {
 279 this.colourAppliesToAllGroups = b;
 280 }, "~B");
 281 Clazz.overrideMethod (c$, "setColourByReferenceSeq",
 282 function (colourByReferenceSeq) {
 283 this.colourByReferenceSeq = colourByReferenceSeq;
 284 }, "~B");
 285 Clazz.overrideMethod (c$, "setColourText",
 286 function (state) {
 287 this.showColourText = state;
 288 }, "~B");
 289 Clazz.overrideMethod (c$, "setConservationColourSelected",
 290 function (conservationColourSelected) {
 291 this.conservationColourSelected = conservationColourSelected;
 292 }, "~B");
 293 Clazz.overrideMethod (c$, "setConservationSelected",
 294 function (b) {
 295 this.conservationColourSelected = b;
 296 }, "~B");
 297 Clazz.overrideMethod (c$, "setDisplayReferenceSeq",
 298 function (displayReferenceSeq) {
 299 this.displayReferenceSeq = displayReferenceSeq;
 300 }, "~B");
 301 Clazz.overrideMethod (c$, "setIncrement",
 302 function (inc) {
 303 this.increment = inc;
 304 }, "~N");
 305 Clazz.overrideMethod (c$, "setRenderGaps",
 306 function (state) {
 307 this.renderGaps = state;
 308 }, "~B");
 309 Clazz.overrideMethod (c$, "setRightAlignIds",
 310 function (rightAlignIds) {
 311 this.rightAlignIds = rightAlignIds;
 312 }, "~B");
 313 Clazz.overrideMethod (c$, "setScaleAboveWrapped",
 314 function (b) {
 315 this.scaleAboveWrapped = b;
 316 }, "~B");
 317 Clazz.overrideMethod (c$, "setScaleLeftWrapped",
 318 function (b) {
 319 this.scaleLeftWrapped = b;
 320 }, "~B");
 321 Clazz.overrideMethod (c$, "setScaleRightWrapped",
 322 function (b) {
 323 this.scaleRightWrapped = b;
 324 }, "~B");
 325 Clazz.overrideMethod (c$, "setSeqNameItalics",
 326 function (italics) {
 327 this.seqNameItalics = italics;
 328 }, "~B");
 329 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowAnnotation",
 330 function (b) {
 331 this.showAnnotation = b;
 332 }, "~B");
 333 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowBoxes",
 334 function (state) {
 335 this.showBoxes = state;
 336 }, "~B");
 337 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowColourText",
 338 function (showColourText) {
 339 this.showColourText = showColourText;
 340 }, "~B");
 341 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowHiddenMarkers",
 342 function (show) {
 343 this.showHiddenMarkers = show;
 344 }, "~B");
 345 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowJVSuffix",
 346 function (b) {
 347 this.showJVSuffix = b;
 348 }, "~B");
 349 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowSequenceFeaturesHeight",
 350 function (selected) {
 351 this.showSeqFeaturesHeight = selected;
 352 }, "~B");
 353 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowSequenceFeatures",
 354 function (b) {
 355 this.showSequenceFeatures = b;
 356 }, "~B");
 357 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowText",
 358 function (state) {
 359 this.showText = state;
 360 }, "~B");
 361 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowUnconserved",
 362 function (showunconserved) {
 363 this.showUnconserved = showunconserved;
 364 }, "~B");
 365 Clazz.overrideMethod (c$, "setTextColour",
 366 function (textColour) {
 367 this.textColour = textColour;
 368 }, "java.awt.Color");
 369 Clazz.overrideMethod (c$, "setTextColour2",
 370 function (textColour2) {
 371 this.textColour2 = textColour2;
 372 }, "java.awt.Color");
 373 Clazz.overrideMethod (c$, "setThreshold",
 374 function (thresh) {
 375 this.threshold = thresh;
 376 }, "~N");
 377 Clazz.overrideMethod (c$, "setThresholdTextColour",
 378 function (thresholdTextColour) {
 379 this.thresholdTextColour = thresholdTextColour;
 380 }, "~N");
 381 Clazz.overrideMethod (c$, "setWrapAlignment",
 382 function (state) {
 383 this.wrapAlignment = state;
 384 }, "~B");
 385 Clazz.overrideMethod (c$, "setWrappedWidth",
 386 function (w) {
 387 this.wrappedWidth = w;
 388 }, "~N");
 389 Clazz.overrideMethod (c$, "sameStyle",
 390 function (that) {
 391 return this.equals (that);
 392 }, "jalview.api.ViewStyleI");
 393 Clazz.defineMethod (c$, "getFontName",
 394 function () {
 395 return this.fontName;
 396 });
 397 Clazz.defineMethod (c$, "getFontSize",
 398 function () {
 399 return this.fontSize;
 400 });
 401 Clazz.defineMethod (c$, "getFontStyle",
 402 function () {
 403 return this.fontStyle;
 404 });
 405 Clazz.overrideMethod (c$, "setFontName",
 406 function (name) {
 407 this.fontName = name;
 408 }, "~S");
 409 Clazz.overrideMethod (c$, "setFontSize",
 410 function (size) {
 411 this.fontSize = size;
 412 }, "~N");
 413 Clazz.overrideMethod (c$, "setFontStyle",
 414 function (style) {
 415 this.fontStyle = style;
 416 }, "~N");
 417 Clazz.defineMethod (c$, "getIdWidth",
 418 function () {
 419 return this.idWidth;
 420 });
 421 Clazz.overrideMethod (c$, "setIdWidth",
 422 function (idWidth) {
 423 this.idWidth = idWidth;
 424 }, "~N");
 425 Clazz.defineMethod (c$, "isCentreColumnLabels",
 426 function () {
 427 return this.centreColumnLabels;
 428 });
 429 Clazz.overrideMethod (c$, "setCentreColumnLabels",
 430 function (centreColumnLabels) {
 431 this.centreColumnLabels = centreColumnLabels;
 432 }, "~B");
 433 Clazz.defineMethod (c$, "isShowDBRefs",
 434 function () {
 435 return this.showdbrefs;
 436 });
 437 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowDBRefs",
 438 function (showdbrefs) {
 439 this.showdbrefs = showdbrefs;
 440 }, "~B");
 441 Clazz.defineMethod (c$, "isShowNPFeats",
 442 function () {
 443 return this.shownpfeats;
 444 });
 445 Clazz.overrideMethod (c$, "setShowNPFeats",
 446 function (shownpfeats) {
 447 this.shownpfeats = shownpfeats;
 448 }, "~B");
 449 Clazz.defineMethod (c$, "isScaleProteinAsCdna",
 450 function () {
 451 return this.scaleProteinAsCdna;
 452 });
 453 Clazz.overrideMethod (c$, "setScaleProteinAsCdna",
 454 function (b) {
 455 this.scaleProteinAsCdna = b;
 456 }, "~B");
 457 });