JPRED-2 Initial commit of software for the Jpred website (some files excluded due...
[jpred.git] / websoft / data / blast / KSpur.flt
diff --git a/websoft/data/blast/KSpur.flt b/websoft/data/blast/KSpur.flt
new file mode 100755 (executable)
index 0000000..937d9df
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,30 @@
+; comments must have a semicolon in the first column or else
+; unpredictable behavior after reading the file will result
+; the first value is the type of filter; the second is info; then data
+1                   1 = filter      2 = matrix
+250                 if 1, window    if 2, cutoff
+100                 { symbol "A", name "Adenine" },
+33                  { symbol "B" , name "G or T or C" },
+0                   { symbol "C", name "Cytosine" },
+67                  { symbol "D", name "G or A or T" },
+;                   { symbol "", name "" },
+;                   { symbol "", name "" },
+100                 { symbol "G", name "Guanine" },
+33                  { symbol "H", name "A or C or T" } ,
+;                   { symbol "", name "" },
+;                   { symbol "", name "" },
+50                  { symbol "K", name "G or T" },
+;                   { symbol "", name ""},
+50                  { symbol "M", name "A or C" },
+50                  { symbol "N", name "A or G or C or T" } ,
+;                   { symbol "", name "" },
+;                   { symbol "", name "" },
+;                   { symbol "", name ""},
+100                 { symbol "R", name "G or A"},
+50                  { symbol "S", name "G or C"},
+0                   { symbol "T", name "Thymine"},
+;                   { symbol "", name ""},
+67                  { symbol "V", name "G or C or A"},
+50                  { symbol "W", name "A or T" },
+;                   { symbol "", name ""},
+0                   { symbol "Y", name "T or C"}