X-Git-Url: http://source.jalview.org/gitweb/?p=jpred.git;a=blobdiff_plain;f=websoft%2Fdata%2Fblast%2FKSpcc.mat;fp=websoft%2Fdata%2Fblast%2FKSpcc.mat;h=7c2a29de64b9465643837914b192d375cf5fd78a;hp=0000000000000000000000000000000000000000;hb=443c228bf0712d71e7fa34b5a2dc4b2b2e79f13f;hpb=9aa768067094f24f46f273077f867348e6143711

diff --git a/websoft/data/blast/KSpcc.mat b/websoft/data/blast/KSpcc.mat
new file mode 100755
index 0000000..7c2a29d
--- /dev/null
+++ b/websoft/data/blast/KSpcc.mat
@@ -0,0 +1,25 @@
+; original matrix
+A 1.297  1.551  1.084  2.612  0.377  1.248  0.877 ; A
+B 0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000 ; BDN
+C 0.824  0.022  0.308  0.152  0.180  0.156  0.044 ; C
+D 0.030  2.352  2.268  0.237  0.663  1.620  1.448 ; D
+E 0.262  3.496  3.108  0.998  5.685  2.494  3.048 ; E
+F 0.531  0.076  0.403  0.662  0.189  0.106  0.013 ; F
+G 0.045  0.275  0.578  0.216  0.211  0.426  0.156 ; G
+H 0.347  0.275  0.679  0.395  0.294  0.579  0.213 ; H
+I 2.597  0.098  0.345  0.894  0.514  0.471  0.431 ; I
+K 1.375  2.639  1.763  0.191  1.815  1.961  2.795 ; K
+L 3.167  0.297  0.398  3.902  0.585  0.501  0.483 ; L
+M 2.240  0.370  0.480  1.409  0.541  0.772  0.663 ; M
+N 0.835  1.475  1.534  0.039  1.722  2.456  2.280 ; N
+P 0.000  0.008  0.000  0.013  0.000  0.000  0.000 ; P
+Q 0.179  2.114  1.778  0.631  2.550  1.578  2.526 ; Q
+R 0.659  1.163  1.210  0.031  1.358  1.937  1.798 ; R
+S 0.382  0.583  1.052  0.419  0.525  0.916  0.628 ; S
+T 0.169  0.702  0.955  0.654  0.791  0.843  0.647 ; T
+V 1.665  0.403  0.386  0.949  0.211  0.342  0.360 ; V
+W 0.240  0.000  0.000  0.456  0.019  0.000  0.000 ; W
+X 0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000 ; X-
+Y 1.417  0.090  0.122  1.659  0.190  0.130  0.155 ; Y
+Z 0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000 ; ZEQ
+* 0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000 ; **