binaries/matrices/BLOSUM60

   1 #  Matrix made by matblas from blosum60.iij
   2 #  * column uses minimum score
   3 #  BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units
   4 #  Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
   5 #  Cluster Percentage: >= 60
   6 #  Entropy =   0.6603, Expected =  -0.4917
   7    A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  B  Z  X  *
   8 A  4 -1 -1 -2  0 -1 -1  0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1  1  0 -3 -2  0 -2 -1  0 -4
   9 R -1  5  0 -1 -3  1  0 -2  0 -3 -2  2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -2 -1  0 -1 -4
  10 N -1  0  6  1 -2  0  0  0  1 -3 -3  0 -2 -3 -2  1  0 -4 -2 -3  3  0 -1 -4
  11 D -2 -1  1  6 -3  0  2 -1 -1 -3 -3 -1 -3 -3 -1  0 -1 -4 -3 -3  4  1 -1 -4
  12 C  0 -3 -2 -3  9 -3 -3 -2 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -4
  13 Q -1  1  0  0 -3  5  2 -2  1 -3 -2  1  0 -3 -1  0 -1 -2 -1 -2  0  3 -1 -4
  14 E -1  0  0  2 -3  2  5 -2  0 -3 -3  1 -2 -3 -1  0 -1 -3 -2 -2  1  4 -1 -4
  15 G  0 -2  0 -1 -2 -2 -2  6 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -2  0 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -1 -4
  16 H -2  0  1 -1 -3  1  0 -2  7 -3 -3 -1 -1 -1 -2 -1 -2 -2  2 -3  0  0 -1 -4
  17 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -3 -3  4  2 -3  1  0 -3 -2 -1 -2 -1  3 -3 -3 -1 -4
  18 L -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -4 -3  2  4 -2  2  0 -3 -2 -1 -2 -1  1 -3 -2 -1 -4
  19 K -1  2  0 -1 -3  1  1 -1 -1 -3 -2  4 -1 -3 -1  0 -1 -3 -2 -2  0  1 -1 -4
  20 M -1 -1 -2 -3 -1  0 -2 -2 -1  1  2 -1  5  0 -2 -1 -1 -1 -1  1 -3 -1 -1 -4
  21 F -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1  0  0 -3  0  6 -4 -2 -2  1  3 -1 -3 -3 -1 -4
  22 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -1 -2 -4
  23 S  1 -1  1  0 -1  0  0  0 -1 -2 -2  0 -1 -2 -1  4  1 -3 -2 -2  0  0  0 -4
  24 T  0 -1  0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1  1  4 -2 -2  0  0 -1  0 -4
  25 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -1  1 -4 -3 -2 10  2 -3 -4 -2 -2 -4
  26 Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3  2 -1 -1 -2 -1  3 -3 -2 -2  2  6 -1 -2 -2 -1 -4
  27 V  0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3  3  1 -2  1 -1 -2 -2  0 -3 -1  4 -3 -2 -1 -4
  28 B -2 -1  3  4 -3  0  1 -1  0 -3 -3  0 -3 -3 -2  0  0 -4 -2 -3  4  1 -1 -4
  29 Z -1  0  0  1 -3  3  4 -2  0 -3 -2  1 -1 -3 -1  0 -1 -2 -2 -2  1  3 -1 -4
  30 X  0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2  0  0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -4
  31 * -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4  1