binaries/matrices/BLOSUMN

   1 #  Matrix made by matblas from blosumn.iij
   2 #  * column uses minimum score
   3 #  BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units
   4 #  Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
   5 #  Cluster Percentage: >= -2
   6 #  Entropy =   1.5172, Expected =  -1.1484
   7    A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  B  Z  X  *
   8 A  6 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -1 -3 -3 -3 -2 -2 -4 -1  1 -1 -4 -4 -1 -3 -2 -1 -7
   9 R -2  7 -1 -3 -6  0 -2 -4 -1 -5 -4  2 -3 -4 -3 -2 -2 -5 -4 -4 -2 -1 -2 -7
  10 N -2 -1  7  1 -4 -1 -1 -2  0 -5 -5 -1 -4 -5 -4  0 -1 -6 -4 -4  4 -1 -2 -7
  11 D -3 -3  1  7 -6 -2  1 -3 -2 -6 -6 -2 -5 -5 -3 -2 -2 -7 -5 -5  4  0 -3 -7
  12 C -2 -6 -4 -6  9 -5 -7 -5 -6 -2 -3 -5 -3 -3 -5 -2 -2 -5 -4 -2 -5 -6 -4 -7
  13 Q -1  0 -1 -2 -5  7  1 -4  0 -4 -3  1 -1 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 -1  4 -2 -7
  14 E -2 -2 -1  1 -7  1  6 -4 -1 -5 -5  0 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4  0  5 -2 -7
  15 G -1 -4 -2 -3 -5 -4 -4  6 -4 -6 -6 -3 -5 -5 -4 -1 -3 -5 -6 -5 -2 -4 -3 -7
  16 H -3 -1  0 -2 -6  0 -1 -4  9 -5 -4 -2 -3 -3 -4 -2 -3 -4  1 -5 -1 -1 -3 -7
  17 I -3 -5 -5 -6 -2 -4 -5 -6 -5  6  1 -4  1 -1 -5 -4 -2 -4 -3  2 -5 -5 -2 -7
  18 L -3 -4 -5 -6 -3 -3 -5 -6 -4  1  5 -4  2  0 -5 -4 -3 -4 -3  0 -5 -4 -2 -7
  19 K -2  2 -1 -2 -5  1  0 -3 -2 -4 -4  6 -2 -4 -2 -1 -2 -6 -4 -4 -1  0 -2 -7
  20 M -2 -3 -4 -5 -3 -1 -4 -5 -3  1  2 -2  8 -1 -4 -3 -2 -2 -3  0 -5 -3 -2 -7
  21 F -4 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -3 -1  0 -4 -1  7 -5 -4 -3  0  3 -2 -5 -5 -3 -7
  22 P -1 -3 -4 -3 -5 -2 -3 -4 -4 -5 -5 -2 -4 -5  8 -2 -3 -5 -5 -4 -4 -3 -3 -7
  23 S  1 -2  0 -2 -2 -1 -1 -1 -2 -4 -4 -1 -3 -4 -2  6  1 -4 -3 -3 -1 -1 -1 -7
  24 T -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -2 -3 -2 -2 -3 -3  1  6 -5 -3 -1 -2 -2 -1 -7
  25 W -4 -5 -6 -7 -5 -4 -5 -5 -4 -4 -4 -6 -2  0 -5 -4 -5 11  1 -3 -6 -4 -4 -7
  26 Y -4 -4 -4 -5 -4 -3 -4 -6  1 -3 -3 -4 -3  3 -5 -3 -3  1  8 -3 -4 -4 -3 -7
  27 V -1 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -5 -5  2  0 -4  0 -2 -4 -3 -1 -3 -3  5 -5 -4 -2 -7
  28 B -3 -2  4  4 -5 -1  0 -2 -1 -5 -5 -1 -5 -5 -4 -1 -2 -6 -4 -5  4  1 -2 -7
  29 Z -2 -1 -1  0 -6  4  5 -4 -1 -5 -4  0 -3 -5 -3 -1 -2 -4 -4 -4  1  4 -2 -7
  30 X -1 -2 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -2 -2 -7
  31 * -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7  1