binaries/matrices/PAM10

   1 #
   2 # This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93]
   3 #
   4 # PAM 10 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574
   5 #
   6 # Expected score = -8.27, Entropy = 3.43 bits
   7 #
   8 # Lowest score = -23, Highest score = 13
   9 #
  10     A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V   B   Z   X   *
  11 A   7 -10  -7  -6 -10  -7  -5  -4 -11  -8  -9 -10  -8 -12  -4  -3  -3 -20 -11  -5  -6  -6  -6 -23
  12 R -10   9  -9 -17 -11  -4 -15 -13  -4  -8 -12  -2  -7 -12  -7  -6 -10  -5 -14 -11 -11  -7  -9 -23
  13 N  -7  -9   9  -1 -17  -7  -5  -6  -2  -8 -10  -4 -15 -12  -9  -2  -5 -11  -7 -12   7  -6  -6 -23
  14 D  -6 -17  -1   8 -21  -6   0  -6  -7 -11 -19  -8 -17 -21 -12  -7  -8 -21 -17 -11   7  -1  -9 -23
  15 C -10 -11 -17 -21  10 -20 -20 -13 -10  -9 -21 -20 -20 -19 -11  -6 -11 -22  -7  -9 -18 -20 -13 -23
  16 Q  -7  -4  -7  -6 -20   9  -1 -10  -2 -11  -8  -6  -7 -19  -6  -8  -9 -19 -18 -10  -6   7  -8 -23
  17 E  -5 -15  -5   0 -20  -1   8  -7  -9  -8 -13  -7 -10 -20  -9  -7  -9 -23 -11 -10  -1   7  -8 -23
  18 G  -4 -13  -6  -6 -13 -10  -7   7 -13 -17 -14 -10 -12 -12 -10  -4 -10 -21 -20  -9  -6  -8  -8 -23
  19 H -11  -4  -2  -7 -10  -2  -9 -13  10 -13  -9 -10 -17  -9  -7  -9 -11 -10  -6  -9  -4  -4  -8 -23
  20 I  -8  -8  -8 -11  -9 -11  -8 -17 -13   9  -4  -9  -3  -5 -12 -10  -5 -20  -9  -1  -9  -9  -8 -23
  21 L  -9 -12 -10 -19 -21  -8 -13 -14  -9  -4   7 -11  -2  -5 -10 -12 -10  -9 -10  -5 -12 -10  -9 -23
  22 K -10  -2  -4  -8 -20  -6  -7 -10 -10  -9 -11   7  -4 -20 -10  -7  -6 -18 -12 -13  -5  -6  -8 -23
  23 M  -8  -7 -15 -17 -20  -7 -10 -12 -17  -3  -2  -4  12  -7 -11  -8  -7 -19 -17  -4 -16  -8  -9 -23
  24 F -12 -12 -12 -21 -19 -19 -20 -12  -9  -5  -5 -20  -7   9 -13  -9 -12  -7  -1 -12 -14 -20 -12 -23
  25 P  -4  -7  -9 -12 -11  -6  -9 -10  -7 -12 -10 -10 -11 -13   8  -4  -7 -20 -20  -9 -10  -7  -8 -23
  26 S  -3  -6  -2  -7  -6  -8  -7  -4  -9 -10 -12  -7  -8  -9  -4   7  -2  -8 -10 -10  -4  -8  -6 -23
  27 T  -3 -10  -5  -8 -11  -9  -9 -10 -11  -5 -10  -6  -7 -12  -7  -2   8 -19  -9  -6  -6  -9  -7 -23
  28 W -20  -5 -11 -21 -22 -19 -23 -21 -10 -20  -9 -18 -19  -7 -20  -8 -19  13  -8 -22 -13 -21 -16 -23
  29 Y -11 -14  -7 -17  -7 -18 -11 -20  -6  -9 -10 -12 -17  -1 -20 -10  -9  -8  10 -10  -9 -13 -11 -23
  30 V  -5 -11 -12 -11  -9 -10 -10  -9  -9  -1  -5 -13  -4 -12  -9 -10  -6 -22 -10   8 -11 -10  -8 -23
  31 B  -6 -11   7   7 -18  -6  -1  -6  -4  -9 -12  -5 -16 -14 -10  -4  -6 -13  -9 -11   7  -3  -8 -23
  32 Z  -6  -7  -6  -1 -20   7   7  -8  -4  -9 -10  -6  -8 -20  -7  -8  -9 -21 -13 -10  -3   7  -8 -23
  33 X  -6  -9  -6  -9 -13  -8  -8  -8  -8  -8  -9  -8  -9 -12  -8  -6  -7 -16 -11  -8  -8  -8  -8 -23
  34 * -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23 -23   1