Add GLprobs and MSAprobs to binaries
[jabaws.git] / binaries / src / MSAProbs-0.9.7 / MSAProbs / MSADef.h
1 #ifndef _MSA_DEF_H
2 #define _MSA_DEF_H
3 #include <stdio.h>
4 #include <stdlib.h>
5 #include <string.h>
6 #include <float.h>
7 #include <math.h>
8
9 #ifdef _OPENMP
10 #include <omp.h>
11 #endif
12
13 //maximum number
14 #define MAX_INT_NUM                             0x7FFFFFFF
15 #define MAX_FLOAT_NUM                   FLT_MAX
16 #define INT_MULTIPLY                    1000
17
18 #define SUBMATRIX_INT_SCALE             100
19
20 //a tree node is a leaf or a node
21 enum {
22         NONE, NODE, LEAF
23 };
24
25 #endif
26