binaries/src/ViennaRNA/Kinfold/cache_util.h

   1 /*
   2   Last changed Time-stamp: <2006-10-03 09:37:34 xtof>
   3   c  Christoph Flamm and Ivo L Hofacker
   4   {xtof,ivo}@tbi.univie.ac.at
   5   Kinfold: $Name:  $
   6   $Id: cache_util.h,v 1.2 2006/10/04 12:45:12 xtof Exp $
   7 */
   8
   9 #ifndef CACHE_UTIL_H
  10 #define CACHE_UTIL_H
  11
  12 #ifdef __GNUC__
  13 #define UNUSED __attribute__ ((unused))
  14 #else
  15 #define UNUSED
  16 #endif
  17
  18 typedef struct {
  19   char *structure;
  20   int top;           /* number of neighbors */
  21   int lmin;          /* is a local minimum ? */
  22   double flux;       /* sum of rates */
  23   double energy;     /* energy of this structure */
  24   short *neighbors;
  25   float *rates;
  26   double *energies;
  27 } cache_entry;
  28
  29 extern cache_entry *lookup_cache (char *x);
  30 extern int write_cache (cache_entry *x);
  31 void kill_cache(void);
  32
  33 #endif