binaries/src/ViennaRNA/Kinfold/configure.ac

   1 #                                               -*- Autoconf -*-
   2 # Process this file with autoconf to produce a configure script.
   3
   4 AC_PREREQ(2.61)
   5
   6 AC_INIT([kinfold], [1.3], [rna@tbi.univie.ac.at], [Kinfold])
   7 AC_CONFIG_SRCDIR([cache_util.h])
   8
   9 AM_SILENT_RULES([yes])
  10 dnl Every other copy of the package version number gets its value from here
  11 AM_INIT_AUTOMAKE([1.11])
  12
  13 dnl configure options
  14 AM_WITH_DMALLOC
  15
  16 dnl Checks for programs.
  17 AC_PROG_CC
  18 dnl AC_PROG_MAKE_SET
  19
  20 dnl create a config.h file (Automake will add -DHAVE_CONFIG_H)
  21 AC_CONFIG_HEADERS(config.h)
  22
  23 AC_SUBST(VERSION)
  24
  25 ISODATE=`date +%Y-%m-%d`
  26 AC_SUBST(ISODATE)
  27
  28 AC_CANONICAL_HOST
  29
  30 dnl Checks for library functions.
  31 AC_CHECK_FUNCS([strdup memset strchr])
  32
  33 AC_ARG_WITH(ViennaRNA-include,
  34   [ --with-ViennaRNA-include    where to search for ViennaRNA header files],
  35   ac_VRNA_includes="$withval",
  36   )
  37
  38 AC_ARG_WITH(ViennaRNA-lib,
  39   [ --with-ViennaRNA-lib        where to search for libRNA.a],
  40   ac_VRNA_lib="$withval",
  41   )
  42 AC_OPENMP
  43
  44 AC_PATH_VRNA
  45
  46 dnl Checks for header files.
  47 AC_HEADER_STDC
  48 AC_CHECK_HEADERS(stdlib.h string.h strings.h unistd.h fold.h)
  49
  50 dnl Checks for libraries.
  51 dnl Replace `main' with a function in -lm:
  52 AC_CHECK_LIB(m, exp)
  53 AC_FUNC_MALLOC
  54 AC_FUNC_REALLOC
  55
  56 dnl checking for -lRNA will fail if both are built simultaneously
  57 dnl AC_CHECK_LIB(RNA, fold)
  58 LIBS=["-lRNA ${LIBS}"]
  59
  60 dnl Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
  61 AC_C_CONST
  62
  63 AC_CONFIG_FILES([Example/Makefile Makefile])
  64
  65 AC_OUTPUT