binaries/src/ViennaRNA/RNAforester/README

   1 This is Version 1.4 of the RNAforester package.
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   4 See the NEWS and Changelog files for changes between versions.
   5 Please read the copyright notice in the file COPYING!
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   7 The RNAforester package is a tool for aligning RNA secondary structures
   8 and it's user interface integrates to those of the tools of the
   9 Vienna RNA package (http://www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/).
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  11 RNAforester supports the following functionality:
  12 - calculate a global alignment of RNA secondary structures
  13 - calculate a local alignments (local similarity) of RNA secondary structures
  14 - calculate multiple alignments of RNA secondary structures
  15 - visualize RNA secondary structure alignments as 2d plots
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  17 The package should be easily portable. It is known to compile without
  18 modifications at least under SunOS 8.x, and linux.
  19 Other UN*X flavours should present no problems.
  20 You need a compiler that understands standard C++.
  21 See the INSTALL file for details.
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  23 For more details about RNAforester information see the man page.
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  25 If you're a commercial user and find these programs useful, please consider
  26 supporting further developments with a donation.
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  28 The most recent source code and documentation should always be available on
  29 the web at http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/rnaforester
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  31 I appreciate any feedback! Send your comments, suggestions, and questions to
  32 mhoechsm@techfak.uni-bielefeld.de
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  34 Matthias Hoechsmann, June 2004
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