binaries/src/ViennaRNA/configure.ac

   1 dnl Process this file with autoconf to produce a configure script.
   2
   3 dnl Every other copy of the package version number gets its value from here
   4 AC_INIT([ViennaRNA],[2.1.2],[rna@tbi.univie.ac.at],[ViennaRNA], [http://www.tbi.univie.ac.a/~ivo/RNA])
   5 AC_PREREQ([2.59])
   6 AC_CONFIG_AUX_DIR(config)
   7
   8 AC_SUBST(VERSION)
   9
  10 m4_include([m4/package.m4])
  11
  12 dnl change the default installation prefix
  13 dnl AC_PREFIX_DEFAULT(/usr/local/RNA)
  14
  15 AM_SILENT_RULES([yes])
  16 AM_INIT_AUTOMAKE([1.11])
  17
  18 dnl create a config.h file (Automake will add -DHAVE_CONFIG_H)
  19 AC_CONFIG_HEADERS([config.h])
  20
  21 dnl configure options
  22 AM_WITH_DMALLOC
  23
  24 AC_ARG_VAR(PERLPREFIX, [Prefix for installation of the Perl module.
  25 By default the perl module is installed wherever Perl thinks it belongs, ignoring the $prefix used by configure])
  26
  27
  28 ISODATE=`date +%Y-%m-%d`
  29 AC_SUBST(ISODATE)
  30
  31 AC_CANONICAL_HOST
  32
  33 dnl Checks for programs.
  34 AC_PROG_CXX
  35 AC_PROG_CXXCPP
  36 AC_PROG_CC
  37 AC_PROG_CPP
  38 AC_PROG_CC_FPIC
  39
  40 AC_ARG_VAR(FPIC,[compiler flag for generating PIC code that can be used in a shared library])
  41
  42 if test "$GCC" = yes; then
  43    AC_DEFINE(UNUSED, __attribute__ ((unused)), avoid warning about unused variables)
  44 else
  45    AC_DEFINE(UNUSED,, only for gcc)
  46 fi
  47
  48 AC_PROG_INSTALL
  49 AC_PROG_RANLIB
  50 AC_PROG_MAKE_SET
  51 AC_PROG_GREP
  52 AM_PROG_CC_C_O
  53
  54
  55 dnl Check for OpenMP and prepare flags
  56 AC_OPENMP
  57 AC_SUBST(OPENMP_CFLAGS)
  58
  59 dnl Checks for libraries.
  60 AC_CHECK_LIB([m], [exp])
  61
  62 dnl Checks for header files.
  63 AC_HEADER_STDC
  64 AC_HEADER_STDBOOL
  65 AC_CHECK_HEADERS([malloc.h float.h limits.h stdlib.h string.h strings.h unistd.h unistd.h math.h])
  66
  67 dnl Checks for funtions
  68 AC_FUNC_MALLOC
  69 AC_FUNC_REALLOC
  70 AC_FUNC_STRTOD
  71 AC_CHECK_FUNCS([floor strdup strstr strchr strrchr strstr strtol strtoul pow rint sqrt erand48 memset memmove erand48])
  72
  73 dnl Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
  74 AC_C_CONST
  75 AC_TYPE_SIZE_T
  76 AC_C_INLINE([])
  77
  78 AC_RNA_INIT
  79
  80 AC_OUTPUT
  81
  82 AC_RNA_NOTICE