binaries/src/ViennaRNA/lib/Makefile.in

   1 # Makefile.in generated by automake 1.11.6 from Makefile.am.
   2 # @configure_input@
   3
   4 # Copyright (C) 1994, 1995, 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001, 2002,
   5 # 2003, 2004, 2005, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011 Free Software
   6 # Foundation, Inc.
   7 # This Makefile.in is free software; the Free Software Foundation
   8 # gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
   9 # with or without modifications, as long as this notice is preserved.
  10
  11 # This program is distributed in the hope that it will be useful,
  12 # but WITHOUT ANY WARRANTY, to the extent permitted by law; without
  13 # even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A
  14 # PARTICULAR PURPOSE.
  15
  16 @SET_MAKE@
  17
  18
  19 VPATH = @srcdir@
  20 am__make_dryrun = \
  21   { \
  22     am__dry=no; \
  23     case $$MAKEFLAGS in \
  24       *\\[\ \   ]*) \
  25         echo 'am--echo: ; @echo "AM"  OK' | $(MAKE) -f - 2>/dev/null \
  26           | grep '^AM OK$$' >/dev/null || am__dry=yes;; \
  27       *) \
  28         for am__flg in $$MAKEFLAGS; do \
  29           case $$am__flg in \
  30             *=*|--*) ;; \
  31             *n*) am__dry=yes; break;; \
  32           esac; \
  33         done;; \
  34     esac; \
  35     test $$am__dry = yes; \
  36   }
  37 pkgdatadir = $(datadir)/@PACKAGE@
  38 pkgincludedir = $(includedir)/@PACKAGE@
  39 pkglibdir = $(libdir)/@PACKAGE@
  40 pkglibexecdir = $(libexecdir)/@PACKAGE@
  41 am__cd = CDPATH="$${ZSH_VERSION+.}$(PATH_SEPARATOR)" && cd
  42 install_sh_DATA = $(install_sh) -c -m 644
  43 install_sh_PROGRAM = $(install_sh) -c
  44 install_sh_SCRIPT = $(install_sh) -c
  45 INSTALL_HEADER = $(INSTALL_DATA)
  46 transform = $(program_transform_name)
  47 NORMAL_INSTALL = :
  48 PRE_INSTALL = :
  49 POST_INSTALL = :
  50 NORMAL_UNINSTALL = :
  51 PRE_UNINSTALL = :
  52 POST_UNINSTALL = :
  53 build_triplet = @build@
  54 host_triplet = @host@
  55 subdir = lib
  56 DIST_COMMON = $(noinst_HEADERS) $(srcdir)/Makefile.am \
  57         $(srcdir)/Makefile.in
  58 ACLOCAL_M4 = $(top_srcdir)/aclocal.m4
  59 am__aclocal_m4_deps = $(top_srcdir)/acinclude.m4 \
  60         $(top_srcdir)/m4/package.m4 $(top_srcdir)/configure.ac
  61 am__configure_deps = $(am__aclocal_m4_deps) $(CONFIGURE_DEPENDENCIES) \
  62         $(ACLOCAL_M4)
  63 mkinstalldirs = $(install_sh) -d
  64 CONFIG_HEADER = $(top_builddir)/config.h
  65 CONFIG_CLEAN_FILES =
  66 CONFIG_CLEAN_VPATH_FILES =
  67 am__vpath_adj_setup = srcdirstrip=`echo "$(srcdir)" | sed 's|.|.|g'`;
  68 am__vpath_adj = case $$p in \
  69     $(srcdir)/*) f=`echo "$$p" | sed "s|^$$srcdirstrip/||"`;; \
  70     *) f=$$p;; \
  71   esac;
  72 am__strip_dir = f=`echo $$p | sed -e 's|^.*/||'`;
  73 am__install_max = 40
  74 am__nobase_strip_setup = \
  75   srcdirstrip=`echo "$(srcdir)" | sed 's/[].[^$$\\*|]/\\\\&/g'`
  76 am__nobase_strip = \
  77   for p in $$list; do echo "$$p"; done | sed -e "s|$$srcdirstrip/||"
  78 am__nobase_list = $(am__nobase_strip_setup); \
  79   for p in $$list; do echo "$$p $$p"; done | \
  80   sed "s| $$srcdirstrip/| |;"' / .*\//!s/ .*/ ./; s,\( .*\)/[^/]*$$,\1,' | \
  81   $(AWK) 'BEGIN { files["."] = "" } { files[$$2] = files[$$2] " " $$1; \
  82     if (++n[$$2] == $(am__install_max)) \
  83       { print $$2, files[$$2]; n[$$2] = 0; files[$$2] = "" } } \
  84     END { for (dir in files) print dir, files[dir] }'
  85 am__base_list = \
  86   sed '$$!N;$$!N;$$!N;$$!N;$$!N;$$!N;$$!N;s/\n/ /g' | \
  87   sed '$$!N;$$!N;$$!N;$$!N;s/\n/ /g'
  88 am__uninstall_files_from_dir = { \
  89   test -z "$$files" \
  90     || { test ! -d "$$dir" && test ! -f "$$dir" && test ! -r "$$dir"; } \
  91     || { echo " ( cd '$$dir' && rm -f" $$files ")"; \
  92          $(am__cd) "$$dir" && rm -f $$files; }; \
  93   }
  94 am__installdirs = "$(DESTDIR)$(libdir)"
  95 LIBRARIES = $(lib_LIBRARIES)
  96 AR = ar
  97 ARFLAGS = cru
  98 AM_V_AR = $(am__v_AR_@AM_V@)
  99 am__v_AR_ = $(am__v_AR_@AM_DEFAULT_V@)
 100 am__v_AR_0 = @echo "  AR    " $@;
 101 AM_V_at = $(am__v_at_@AM_V@)
 102 am__v_at_ = $(am__v_at_@AM_DEFAULT_V@)
 103 am__v_at_0 = @
 104 libRNA_a_AR = $(AR) $(ARFLAGS)
 105 libRNA_a_LIBADD =
 106 am__libRNA_a_SOURCES_DIST = dist_vars.c fold_vars.c part_func.c \
 107         read_epars.c treedist.c energy_par.c inverse.c ProfileDist.c \
 108         RNAstruct.c utils.c fold.c naview.c PS_dot.c stringdist.c \
 109         params.c subopt.c list.c Lfold.c cofold.c part_func_co.c \
 110         ProfileAln.c duplex.c alifold.c alipfold.c aln_util.c LPfold.c \
 111         part_func_up.c ribo.c findpath.c convert_epars.c MEA.c \
 112         aliLfold.c mm.c 2Dfold.c 2Dpfold.c plex_functions.c \
 113         plot_layouts.c ali_plex.c c_plex.c plex.c snofold.c snoop.c \
 114         move_set.c gquad.c ../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp svm_utils.c
 115 @WITH_LIBSVM_TRUE@am__objects_1 = svm.$(OBJEXT)
 116 @WITH_LIBSVM_TRUE@am__objects_2 = libRNA_a-svm_utils.$(OBJEXT)
 117 am_libRNA_a_OBJECTS = libRNA_a-dist_vars.$(OBJEXT) \
 118         libRNA_a-fold_vars.$(OBJEXT) libRNA_a-part_func.$(OBJEXT) \
 119         libRNA_a-read_epars.$(OBJEXT) libRNA_a-treedist.$(OBJEXT) \
 120         libRNA_a-energy_par.$(OBJEXT) libRNA_a-inverse.$(OBJEXT) \
 121         libRNA_a-ProfileDist.$(OBJEXT) libRNA_a-RNAstruct.$(OBJEXT) \
 122         libRNA_a-utils.$(OBJEXT) libRNA_a-fold.$(OBJEXT) \
 123         libRNA_a-naview.$(OBJEXT) libRNA_a-PS_dot.$(OBJEXT) \
 124         libRNA_a-stringdist.$(OBJEXT) libRNA_a-params.$(OBJEXT) \
 125         libRNA_a-subopt.$(OBJEXT) libRNA_a-list.$(OBJEXT) \
 126         libRNA_a-Lfold.$(OBJEXT) libRNA_a-cofold.$(OBJEXT) \
 127         libRNA_a-part_func_co.$(OBJEXT) libRNA_a-ProfileAln.$(OBJEXT) \
 128         libRNA_a-duplex.$(OBJEXT) libRNA_a-alifold.$(OBJEXT) \
 129         libRNA_a-alipfold.$(OBJEXT) libRNA_a-aln_util.$(OBJEXT) \
 130         libRNA_a-LPfold.$(OBJEXT) libRNA_a-part_func_up.$(OBJEXT) \
 131         libRNA_a-ribo.$(OBJEXT) libRNA_a-findpath.$(OBJEXT) \
 132         libRNA_a-convert_epars.$(OBJEXT) libRNA_a-MEA.$(OBJEXT) \
 133         libRNA_a-aliLfold.$(OBJEXT) libRNA_a-mm.$(OBJEXT) \
 134         libRNA_a-2Dfold.$(OBJEXT) libRNA_a-2Dpfold.$(OBJEXT) \
 135         libRNA_a-plex_functions.$(OBJEXT) \
 136         libRNA_a-plot_layouts.$(OBJEXT) libRNA_a-ali_plex.$(OBJEXT) \
 137         libRNA_a-c_plex.$(OBJEXT) libRNA_a-plex.$(OBJEXT) \
 138         libRNA_a-snofold.$(OBJEXT) libRNA_a-snoop.$(OBJEXT) \
 139         libRNA_a-move_set.$(OBJEXT) libRNA_a-gquad.$(OBJEXT) \
 140         $(am__objects_1) $(am__objects_2)
 141 libRNA_a_OBJECTS = $(am_libRNA_a_OBJECTS)
 142 DEFAULT_INCLUDES = -I.@am__isrc@ -I$(top_builddir)
 143 depcomp = $(SHELL) $(top_srcdir)/config/depcomp
 144 am__depfiles_maybe = depfiles
 145 am__mv = mv -f
 146 AM_V_lt = $(am__v_lt_@AM_V@)
 147 am__v_lt_ = $(am__v_lt_@AM_DEFAULT_V@)
 148 am__v_lt_0 = --silent
 149 COMPILE = $(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) \
 150         $(CPPFLAGS) $(AM_CFLAGS) $(CFLAGS)
 151 AM_V_CC = $(am__v_CC_@AM_V@)
 152 am__v_CC_ = $(am__v_CC_@AM_DEFAULT_V@)
 153 am__v_CC_0 = @echo "  CC    " $@;
 154 CCLD = $(CC)
 155 LINK = $(CCLD) $(AM_CFLAGS) $(CFLAGS) $(AM_LDFLAGS) $(LDFLAGS) -o $@
 156 AM_V_CCLD = $(am__v_CCLD_@AM_V@)
 157 am__v_CCLD_ = $(am__v_CCLD_@AM_DEFAULT_V@)
 158 am__v_CCLD_0 = @echo "  CCLD  " $@;
 159 CXXCOMPILE = $(CXX) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) \
 160         $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(AM_CXXFLAGS) $(CXXFLAGS)
 161 AM_V_CXX = $(am__v_CXX_@AM_V@)
 162 am__v_CXX_ = $(am__v_CXX_@AM_DEFAULT_V@)
 163 am__v_CXX_0 = @echo "  CXX   " $@;
 164 CXXLINK = $(CXXLD) $(AM_CXXFLAGS) $(CXXFLAGS) $(AM_LDFLAGS) $(LDFLAGS) \
 165         -o $@
 166 AM_V_CXXLD = $(am__v_CXXLD_@AM_V@)
 167 am__v_CXXLD_ = $(am__v_CXXLD_@AM_DEFAULT_V@)
 168 am__v_CXXLD_0 = @echo "  CXXLD " $@;
 169 AM_V_GEN = $(am__v_GEN_@AM_V@)
 170 am__v_GEN_ = $(am__v_GEN_@AM_DEFAULT_V@)
 171 am__v_GEN_0 = @echo "  GEN   " $@;
 172 SOURCES = $(libRNA_a_SOURCES)
 173 DIST_SOURCES = $(am__libRNA_a_SOURCES_DIST)
 174 am__can_run_installinfo = \
 175   case $$AM_UPDATE_INFO_DIR in \
 176     n|no|NO) false;; \
 177     *) (install-info --version) >/dev/null 2>&1;; \
 178   esac
 179 HEADERS = $(noinst_HEADERS)
 180 ETAGS = etags
 181 CTAGS = ctags
 182 DISTFILES = $(DIST_COMMON) $(DIST_SOURCES) $(TEXINFOS) $(EXTRA_DIST)
 183 ACLOCAL = @ACLOCAL@
 184 AMTAR = @AMTAR@
 185 AM_DEFAULT_VERBOSITY = @AM_DEFAULT_VERBOSITY@
 186 AUTOCONF = @AUTOCONF@
 187 AUTOHEADER = @AUTOHEADER@
 188 AUTOMAKE = @AUTOMAKE@
 189 AWK = @AWK@
 190 CC = @CC@
 191 CCDEPMODE = @CCDEPMODE@
 192 CFLAGS = @CFLAGS@
 193 CLUSTER_DIR = @CLUSTER_DIR@
 194 CPP = @CPP@
 195 CPPFLAGS = @CPPFLAGS@
 196 CXX = @CXX@
 197 CXXCPP = @CXXCPP@
 198 CXXDEPMODE = @CXXDEPMODE@
 199 CXXFLAGS = @CXXFLAGS@
 200 CXXLD = @CXXLD@
 201 CYGPATH_W = @CYGPATH_W@
 202 DEFS = @DEFS@
 203 DEPDIR = @DEPDIR@
 204 DOXYGEN_CMD_LATEX = @DOXYGEN_CMD_LATEX@
 205 DOXYGEN_CMD_MAKEINDEX = @DOXYGEN_CMD_MAKEINDEX@
 206 DOXYGEN_CONF = @DOXYGEN_CONF@
 207 DOXYGEN_DOCDIR = @DOXYGEN_DOCDIR@
 208 DOXYGEN_GENERATE_HTML = @DOXYGEN_GENERATE_HTML@
 209 DOXYGEN_GENERATE_LATEX = @DOXYGEN_GENERATE_LATEX@
 210 DOXYGEN_HAVE_DOT = @DOXYGEN_HAVE_DOT@
 211 DOXYGEN_PROJECT_NAME = @DOXYGEN_PROJECT_NAME@
 212 DOXYGEN_SRCDIR = @DOXYGEN_SRCDIR@
 213 DOXYGEN_WITH_PDFLATEX = @DOXYGEN_WITH_PDFLATEX@
 214 ECHO_C = @ECHO_C@
 215 ECHO_N = @ECHO_N@
 216 ECHO_T = @ECHO_T@
 217 EGREP = @EGREP@
 218 EXEEXT = @EXEEXT@
 219 FPIC = @FPIC@
 220 GREP = @GREP@
 221 INSTALL = @INSTALL@
 222 INSTALL_DATA = @INSTALL_DATA@
 223 INSTALL_PROGRAM = @INSTALL_PROGRAM@
 224 INSTALL_SCRIPT = @INSTALL_SCRIPT@
 225 INSTALL_STRIP_PROGRAM = @INSTALL_STRIP_PROGRAM@
 226 ISODATE = @ISODATE@
 227 LDFLAGS = @LDFLAGS@
 228 LIBOBJS = @LIBOBJS@
 229 LIBS = @LIBS@
 230 LIBSVM_DIR = @LIBSVM_DIR@
 231 LTLIBOBJS = @LTLIBOBJS@
 232 MAKEINFO = @MAKEINFO@
 233 MKDIR_P = @MKDIR_P@
 234 OBJEXT = @OBJEXT@
 235 OPENMP_CFLAGS = @OPENMP_CFLAGS@
 236 PACKAGE = @PACKAGE@
 237 PACKAGE_BUGREPORT = @PACKAGE_BUGREPORT@
 238 PACKAGE_NAME = @PACKAGE_NAME@
 239 PACKAGE_STRING = @PACKAGE_STRING@
 240 PACKAGE_TARNAME = @PACKAGE_TARNAME@
 241 PACKAGE_URL = @PACKAGE_URL@
 242 PACKAGE_VERSION = @PACKAGE_VERSION@
 243 PATH_SEPARATOR = @PATH_SEPARATOR@
 244 PERLPREFIX = @PERLPREFIX@
 245 PERL_INTERFACE = @PERL_INTERFACE@
 246 POW_LIB = @POW_LIB@
 247 PYTHON_INTERFACE = @PYTHON_INTERFACE@
 248 PerlCmd = @PerlCmd@
 249 PythonCmd = @PythonCmd@
 250 RANLIB = @RANLIB@
 251 REFERENCE_MANUAL_PDF_NAME = @REFERENCE_MANUAL_PDF_NAME@
 252 REFERENCE_MANUAL_TAGFILE = @REFERENCE_MANUAL_TAGFILE@
 253 SET_MAKE = @SET_MAKE@
 254 SHELL = @SHELL@
 255 STRIP = @STRIP@
 256 VERSION = @VERSION@
 257 abs_builddir = @abs_builddir@
 258 abs_srcdir = @abs_srcdir@
 259 abs_top_builddir = @abs_top_builddir@
 260 abs_top_srcdir = @abs_top_srcdir@
 261 ac_ct_CC = @ac_ct_CC@
 262 ac_ct_CXX = @ac_ct_CXX@
 263 am__include = @am__include@
 264 am__leading_dot = @am__leading_dot@
 265 am__quote = @am__quote@
 266 am__tar = @am__tar@
 267 am__untar = @am__untar@
 268 bindir = @bindir@
 269 build = @build@
 270 build_alias = @build_alias@
 271 build_cpu = @build_cpu@
 272 build_os = @build_os@
 273 build_vendor = @build_vendor@
 274 builddir = @builddir@
 275 datadir = @datadir@
 276 datarootdir = @datarootdir@
 277 docdir = @docdir@
 278 dot = @dot@
 279 doxygen = @doxygen@
 280 dvidir = @dvidir@
 281 egrep = @egrep@
 282 exec_prefix = @exec_prefix@
 283 host = @host@
 284 host_alias = @host_alias@
 285 host_cpu = @host_cpu@
 286 host_os = @host_os@
 287 host_vendor = @host_vendor@
 288 htmldir = @htmldir@
 289 includedir = @includedir@
 290 infodir = @infodir@
 291 install_sh = @install_sh@
 292 latex = @latex@
 293 libdir = @libdir@
 294 libexecdir = @libexecdir@
 295 localedir = @localedir@
 296 localstatedir = @localstatedir@
 297 makeindex = @makeindex@
 298 mandir = @mandir@
 299 mkdir_p = @mkdir_p@
 300 oldincludedir = @oldincludedir@
 301 pdfdir = @pdfdir@
 302 pdflatex = @pdflatex@
 303 perl = @perl@
 304 prefix = @prefix@
 305 program_transform_name = @program_transform_name@
 306 psdir = @psdir@
 307 sbindir = @sbindir@
 308 sharedstatedir = @sharedstatedir@
 309 srcdir = @srcdir@
 310 subdirs = @subdirs@
 311 sysconfdir = @sysconfdir@
 312 target_alias = @target_alias@
 313 top_build_prefix = @top_build_prefix@
 314 top_builddir = @top_builddir@
 315 top_srcdir = @top_srcdir@
 316 lib_LIBRARIES = libRNA.a
 317 @WITH_LIBSVM_TRUE@SVM_SRC = ../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp
 318 @WITH_LIBSVM_TRUE@SVM_INC = -I${srcdir}/../@LIBSVM_DIR@
 319 @WITH_LIBSVM_TRUE@SVM_H = ../@LIBSVM_DIR@/svm.h
 320 @WITH_LIBSVM_TRUE@SVM_UTILS = svm_utils.c
 321 libRNA_a_SOURCES = dist_vars.c fold_vars.c part_func.c read_epars.c\
 322                     treedist.c energy_par.c inverse.c ProfileDist.c \
 323                     RNAstruct.c utils.c fold.c naview.c PS_dot.c \
 324                     stringdist.c params.c subopt.c list.c Lfold.c \
 325                     cofold.c part_func_co.c ProfileAln.c duplex.c \
 326                     alifold.c alipfold.c aln_util.c LPfold.c \
 327                     part_func_up.c ribo.c findpath.c convert_epars.c\
 328                     MEA.c aliLfold.c mm.c 2Dfold.c 2Dpfold.c plex_functions.c\
 329                     plot_layouts.c ali_plex.c c_plex.c plex.c snofold.c\
 330                     snoop.c move_set.c gquad.c ${SVM_SRC} ${SVM_UTILS}
 331
 332 libRNA_a_CFLAGS = $(AM_CFLAGS) $(OPENMP_CFLAGS) @FPIC@
 333 noinst_HEADERS = intl11.h intl11dH.h intl21.h intl21dH.h \
 334                   intl22.h intl22dH.h list.h\
 335                   1.8.4_epars.h 1.8.4_intloops.h
 336
 337 EXTRA_DIST = circfold.inc alicircfold.inc model_avg.inc model_sd.inc ${SVM_H}
 338 AM_CPPFLAGS = -I$(srcdir)/../H ${SVM_INC} @FPIC@
 339 all: all-am
 340
 341 .SUFFIXES:
 342 .SUFFIXES: .c .cpp .o .obj
 343 $(srcdir)/Makefile.in:  $(srcdir)/Makefile.am  $(am__configure_deps)
 344         @for dep in $?; do \
 345           case '$(am__configure_deps)' in \
 346             *$$dep*) \
 347               ( cd $(top_builddir) && $(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) am--refresh ) \
 348                 && { if test -f $@; then exit 0; else break; fi; }; \
 349               exit 1;; \
 350           esac; \
 351         done; \
 352         echo ' cd $(top_srcdir) && $(AUTOMAKE) --gnu lib/Makefile'; \
 353         $(am__cd) $(top_srcdir) && \
 354           $(AUTOMAKE) --gnu lib/Makefile
 355 .PRECIOUS: Makefile
 356 Makefile: $(srcdir)/Makefile.in $(top_builddir)/config.status
 357         @case '$?' in \
 358           *config.status*) \
 359             cd $(top_builddir) && $(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) am--refresh;; \
 360           *) \
 361             echo ' cd $(top_builddir) && $(SHELL) ./config.status $(subdir)/$@ $(am__depfiles_maybe)'; \
 362             cd $(top_builddir) && $(SHELL) ./config.status $(subdir)/$@ $(am__depfiles_maybe);; \
 363         esac;
 364
 365 $(top_builddir)/config.status: $(top_srcdir)/configure $(CONFIG_STATUS_DEPENDENCIES)
 366         cd $(top_builddir) && $(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) am--refresh
 367
 368 $(top_srcdir)/configure:  $(am__configure_deps)
 369         cd $(top_builddir) && $(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) am--refresh
 370 $(ACLOCAL_M4):  $(am__aclocal_m4_deps)
 371         cd $(top_builddir) && $(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) am--refresh
 372 $(am__aclocal_m4_deps):
 373 install-libLIBRARIES: $(lib_LIBRARIES)
 374         @$(NORMAL_INSTALL)
 375         @list='$(lib_LIBRARIES)'; test -n "$(libdir)" || list=; \
 376         list2=; for p in $$list; do \
 377           if test -f $$p; then \
 378             list2="$$list2 $$p"; \
 379           else :; fi; \
 380         done; \
 381         test -z "$$list2" || { \
 382           echo " $(MKDIR_P) '$(DESTDIR)$(libdir)'"; \
 383           $(MKDIR_P) "$(DESTDIR)$(libdir)" || exit 1; \
 384           echo " $(INSTALL_DATA) $$list2 '$(DESTDIR)$(libdir)'"; \
 385           $(INSTALL_DATA) $$list2 "$(DESTDIR)$(libdir)" || exit $$?; }
 386         @$(POST_INSTALL)
 387         @list='$(lib_LIBRARIES)'; test -n "$(libdir)" || list=; \
 388         for p in $$list; do \
 389           if test -f $$p; then \
 390             $(am__strip_dir) \
 391             echo " ( cd '$(DESTDIR)$(libdir)' && $(RANLIB) $$f )"; \
 392             ( cd "$(DESTDIR)$(libdir)" && $(RANLIB) $$f ) || exit $$?; \
 393           else :; fi; \
 394         done
 395
 396 uninstall-libLIBRARIES:
 397         @$(NORMAL_UNINSTALL)
 398         @list='$(lib_LIBRARIES)'; test -n "$(libdir)" || list=; \
 399         files=`for p in $$list; do echo $$p; done | sed -e 's|^.*/||'`; \
 400         dir='$(DESTDIR)$(libdir)'; $(am__uninstall_files_from_dir)
 401
 402 clean-libLIBRARIES:
 403         -test -z "$(lib_LIBRARIES)" || rm -f $(lib_LIBRARIES)
 404 libRNA.a: $(libRNA_a_OBJECTS) $(libRNA_a_DEPENDENCIES) $(EXTRA_libRNA_a_DEPENDENCIES)
 405         $(AM_V_at)-rm -f libRNA.a
 406         $(AM_V_AR)$(libRNA_a_AR) libRNA.a $(libRNA_a_OBJECTS) $(libRNA_a_LIBADD)
 407         $(AM_V_at)$(RANLIB) libRNA.a
 408
 409 mostlyclean-compile:
 410         -rm -f *.$(OBJEXT)
 411
 412 distclean-compile:
 413         -rm -f *.tab.c
 414
 415 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-2Dfold.Po@am__quote@
 416 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-2Dpfold.Po@am__quote@
 417 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-LPfold.Po@am__quote@
 418 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-Lfold.Po@am__quote@
 419 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-MEA.Po@am__quote@
 420 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-PS_dot.Po@am__quote@
 421 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileAln.Po@am__quote@
 422 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileDist.Po@am__quote@
 423 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-RNAstruct.Po@am__quote@
 424 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-aliLfold.Po@am__quote@
 425 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-ali_plex.Po@am__quote@
 426 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-alifold.Po@am__quote@
 427 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-alipfold.Po@am__quote@
 428 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-aln_util.Po@am__quote@
 429 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-c_plex.Po@am__quote@
 430 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-cofold.Po@am__quote@
 431 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-convert_epars.Po@am__quote@
 432 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-dist_vars.Po@am__quote@
 433 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-duplex.Po@am__quote@
 434 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-energy_par.Po@am__quote@
 435 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-findpath.Po@am__quote@
 436 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-fold.Po@am__quote@
 437 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-fold_vars.Po@am__quote@
 438 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-gquad.Po@am__quote@
 439 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-inverse.Po@am__quote@
 440 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-list.Po@am__quote@
 441 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-mm.Po@am__quote@
 442 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-move_set.Po@am__quote@
 443 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-naview.Po@am__quote@
 444 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-params.Po@am__quote@
 445 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-part_func.Po@am__quote@
 446 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_co.Po@am__quote@
 447 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_up.Po@am__quote@
 448 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-plex.Po@am__quote@
 449 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-plex_functions.Po@am__quote@
 450 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-plot_layouts.Po@am__quote@
 451 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-read_epars.Po@am__quote@
 452 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-ribo.Po@am__quote@
 453 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-snofold.Po@am__quote@
 454 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-snoop.Po@am__quote@
 455 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-stringdist.Po@am__quote@
 456 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-subopt.Po@am__quote@
 457 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-svm_utils.Po@am__quote@
 458 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-treedist.Po@am__quote@
 459 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/libRNA_a-utils.Po@am__quote@
 460 @AMDEP_TRUE@@am__include@ @am__quote@./$(DEPDIR)/svm.Po@am__quote@
 461
 462 .c.o:
 463 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(COMPILE) -MT $@ -MD -MP -MF $(DEPDIR)/$*.Tpo -c -o $@ $<
 464 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/$*.Tpo $(DEPDIR)/$*.Po
 465 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='$<' object='$@' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 466 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 467 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(COMPILE) -c $<
 468
 469 .c.obj:
 470 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(COMPILE) -MT $@ -MD -MP -MF $(DEPDIR)/$*.Tpo -c -o $@ `$(CYGPATH_W) '$<'`
 471 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/$*.Tpo $(DEPDIR)/$*.Po
 472 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='$<' object='$@' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 473 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 474 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(COMPILE) -c `$(CYGPATH_W) '$<'`
 475
 476 libRNA_a-dist_vars.o: dist_vars.c
 477 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-dist_vars.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-dist_vars.Tpo -c -o libRNA_a-dist_vars.o `test -f 'dist_vars.c' || echo '$(srcdir)/'`dist_vars.c
 478 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-dist_vars.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-dist_vars.Po
 479 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='dist_vars.c' object='libRNA_a-dist_vars.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 480 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 481 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-dist_vars.o `test -f 'dist_vars.c' || echo '$(srcdir)/'`dist_vars.c
 482
 483 libRNA_a-dist_vars.obj: dist_vars.c
 484 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-dist_vars.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-dist_vars.Tpo -c -o libRNA_a-dist_vars.obj `if test -f 'dist_vars.c'; then $(CYGPATH_W) 'dist_vars.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/dist_vars.c'; fi`
 485 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-dist_vars.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-dist_vars.Po
 486 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='dist_vars.c' object='libRNA_a-dist_vars.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 487 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 488 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-dist_vars.obj `if test -f 'dist_vars.c'; then $(CYGPATH_W) 'dist_vars.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/dist_vars.c'; fi`
 489
 490 libRNA_a-fold_vars.o: fold_vars.c
 491 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-fold_vars.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-fold_vars.Tpo -c -o libRNA_a-fold_vars.o `test -f 'fold_vars.c' || echo '$(srcdir)/'`fold_vars.c
 492 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-fold_vars.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-fold_vars.Po
 493 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='fold_vars.c' object='libRNA_a-fold_vars.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 494 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 495 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-fold_vars.o `test -f 'fold_vars.c' || echo '$(srcdir)/'`fold_vars.c
 496
 497 libRNA_a-fold_vars.obj: fold_vars.c
 498 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-fold_vars.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-fold_vars.Tpo -c -o libRNA_a-fold_vars.obj `if test -f 'fold_vars.c'; then $(CYGPATH_W) 'fold_vars.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/fold_vars.c'; fi`
 499 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-fold_vars.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-fold_vars.Po
 500 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='fold_vars.c' object='libRNA_a-fold_vars.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 501 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 502 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-fold_vars.obj `if test -f 'fold_vars.c'; then $(CYGPATH_W) 'fold_vars.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/fold_vars.c'; fi`
 503
 504 libRNA_a-part_func.o: part_func.c
 505 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-part_func.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func.Tpo -c -o libRNA_a-part_func.o `test -f 'part_func.c' || echo '$(srcdir)/'`part_func.c
 506 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func.Po
 507 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='part_func.c' object='libRNA_a-part_func.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 508 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 509 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-part_func.o `test -f 'part_func.c' || echo '$(srcdir)/'`part_func.c
 510
 511 libRNA_a-part_func.obj: part_func.c
 512 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-part_func.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func.Tpo -c -o libRNA_a-part_func.obj `if test -f 'part_func.c'; then $(CYGPATH_W) 'part_func.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/part_func.c'; fi`
 513 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func.Po
 514 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='part_func.c' object='libRNA_a-part_func.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 515 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 516 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-part_func.obj `if test -f 'part_func.c'; then $(CYGPATH_W) 'part_func.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/part_func.c'; fi`
 517
 518 libRNA_a-read_epars.o: read_epars.c
 519 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-read_epars.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-read_epars.Tpo -c -o libRNA_a-read_epars.o `test -f 'read_epars.c' || echo '$(srcdir)/'`read_epars.c
 520 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-read_epars.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-read_epars.Po
 521 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='read_epars.c' object='libRNA_a-read_epars.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 522 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 523 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-read_epars.o `test -f 'read_epars.c' || echo '$(srcdir)/'`read_epars.c
 524
 525 libRNA_a-read_epars.obj: read_epars.c
 526 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-read_epars.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-read_epars.Tpo -c -o libRNA_a-read_epars.obj `if test -f 'read_epars.c'; then $(CYGPATH_W) 'read_epars.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/read_epars.c'; fi`
 527 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-read_epars.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-read_epars.Po
 528 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='read_epars.c' object='libRNA_a-read_epars.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 529 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 530 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-read_epars.obj `if test -f 'read_epars.c'; then $(CYGPATH_W) 'read_epars.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/read_epars.c'; fi`
 531
 532 libRNA_a-treedist.o: treedist.c
 533 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-treedist.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-treedist.Tpo -c -o libRNA_a-treedist.o `test -f 'treedist.c' || echo '$(srcdir)/'`treedist.c
 534 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-treedist.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-treedist.Po
 535 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='treedist.c' object='libRNA_a-treedist.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 536 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 537 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-treedist.o `test -f 'treedist.c' || echo '$(srcdir)/'`treedist.c
 538
 539 libRNA_a-treedist.obj: treedist.c
 540 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-treedist.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-treedist.Tpo -c -o libRNA_a-treedist.obj `if test -f 'treedist.c'; then $(CYGPATH_W) 'treedist.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/treedist.c'; fi`
 541 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-treedist.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-treedist.Po
 542 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='treedist.c' object='libRNA_a-treedist.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 543 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 544 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-treedist.obj `if test -f 'treedist.c'; then $(CYGPATH_W) 'treedist.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/treedist.c'; fi`
 545
 546 libRNA_a-energy_par.o: energy_par.c
 547 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-energy_par.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-energy_par.Tpo -c -o libRNA_a-energy_par.o `test -f 'energy_par.c' || echo '$(srcdir)/'`energy_par.c
 548 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-energy_par.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-energy_par.Po
 549 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='energy_par.c' object='libRNA_a-energy_par.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 550 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 551 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-energy_par.o `test -f 'energy_par.c' || echo '$(srcdir)/'`energy_par.c
 552
 553 libRNA_a-energy_par.obj: energy_par.c
 554 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-energy_par.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-energy_par.Tpo -c -o libRNA_a-energy_par.obj `if test -f 'energy_par.c'; then $(CYGPATH_W) 'energy_par.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/energy_par.c'; fi`
 555 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-energy_par.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-energy_par.Po
 556 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='energy_par.c' object='libRNA_a-energy_par.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 557 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 558 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-energy_par.obj `if test -f 'energy_par.c'; then $(CYGPATH_W) 'energy_par.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/energy_par.c'; fi`
 559
 560 libRNA_a-inverse.o: inverse.c
 561 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-inverse.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-inverse.Tpo -c -o libRNA_a-inverse.o `test -f 'inverse.c' || echo '$(srcdir)/'`inverse.c
 562 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-inverse.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-inverse.Po
 563 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='inverse.c' object='libRNA_a-inverse.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 564 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 565 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-inverse.o `test -f 'inverse.c' || echo '$(srcdir)/'`inverse.c
 566
 567 libRNA_a-inverse.obj: inverse.c
 568 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-inverse.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-inverse.Tpo -c -o libRNA_a-inverse.obj `if test -f 'inverse.c'; then $(CYGPATH_W) 'inverse.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/inverse.c'; fi`
 569 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-inverse.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-inverse.Po
 570 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='inverse.c' object='libRNA_a-inverse.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 571 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 572 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-inverse.obj `if test -f 'inverse.c'; then $(CYGPATH_W) 'inverse.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/inverse.c'; fi`
 573
 574 libRNA_a-ProfileDist.o: ProfileDist.c
 575 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-ProfileDist.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileDist.Tpo -c -o libRNA_a-ProfileDist.o `test -f 'ProfileDist.c' || echo '$(srcdir)/'`ProfileDist.c
 576 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileDist.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileDist.Po
 577 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='ProfileDist.c' object='libRNA_a-ProfileDist.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 578 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 579 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-ProfileDist.o `test -f 'ProfileDist.c' || echo '$(srcdir)/'`ProfileDist.c
 580
 581 libRNA_a-ProfileDist.obj: ProfileDist.c
 582 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-ProfileDist.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileDist.Tpo -c -o libRNA_a-ProfileDist.obj `if test -f 'ProfileDist.c'; then $(CYGPATH_W) 'ProfileDist.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/ProfileDist.c'; fi`
 583 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileDist.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileDist.Po
 584 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='ProfileDist.c' object='libRNA_a-ProfileDist.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 585 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 586 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-ProfileDist.obj `if test -f 'ProfileDist.c'; then $(CYGPATH_W) 'ProfileDist.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/ProfileDist.c'; fi`
 587
 588 libRNA_a-RNAstruct.o: RNAstruct.c
 589 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-RNAstruct.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-RNAstruct.Tpo -c -o libRNA_a-RNAstruct.o `test -f 'RNAstruct.c' || echo '$(srcdir)/'`RNAstruct.c
 590 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-RNAstruct.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-RNAstruct.Po
 591 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='RNAstruct.c' object='libRNA_a-RNAstruct.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 592 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 593 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-RNAstruct.o `test -f 'RNAstruct.c' || echo '$(srcdir)/'`RNAstruct.c
 594
 595 libRNA_a-RNAstruct.obj: RNAstruct.c
 596 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-RNAstruct.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-RNAstruct.Tpo -c -o libRNA_a-RNAstruct.obj `if test -f 'RNAstruct.c'; then $(CYGPATH_W) 'RNAstruct.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/RNAstruct.c'; fi`
 597 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-RNAstruct.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-RNAstruct.Po
 598 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='RNAstruct.c' object='libRNA_a-RNAstruct.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 599 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 600 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-RNAstruct.obj `if test -f 'RNAstruct.c'; then $(CYGPATH_W) 'RNAstruct.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/RNAstruct.c'; fi`
 601
 602 libRNA_a-utils.o: utils.c
 603 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-utils.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-utils.Tpo -c -o libRNA_a-utils.o `test -f 'utils.c' || echo '$(srcdir)/'`utils.c
 604 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-utils.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-utils.Po
 605 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='utils.c' object='libRNA_a-utils.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 606 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 607 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-utils.o `test -f 'utils.c' || echo '$(srcdir)/'`utils.c
 608
 609 libRNA_a-utils.obj: utils.c
 610 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-utils.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-utils.Tpo -c -o libRNA_a-utils.obj `if test -f 'utils.c'; then $(CYGPATH_W) 'utils.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/utils.c'; fi`
 611 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-utils.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-utils.Po
 612 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='utils.c' object='libRNA_a-utils.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 613 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 614 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-utils.obj `if test -f 'utils.c'; then $(CYGPATH_W) 'utils.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/utils.c'; fi`
 615
 616 libRNA_a-fold.o: fold.c
 617 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-fold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-fold.Tpo -c -o libRNA_a-fold.o `test -f 'fold.c' || echo '$(srcdir)/'`fold.c
 618 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-fold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-fold.Po
 619 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='fold.c' object='libRNA_a-fold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 620 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 621 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-fold.o `test -f 'fold.c' || echo '$(srcdir)/'`fold.c
 622
 623 libRNA_a-fold.obj: fold.c
 624 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-fold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-fold.Tpo -c -o libRNA_a-fold.obj `if test -f 'fold.c'; then $(CYGPATH_W) 'fold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/fold.c'; fi`
 625 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-fold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-fold.Po
 626 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='fold.c' object='libRNA_a-fold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 627 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 628 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-fold.obj `if test -f 'fold.c'; then $(CYGPATH_W) 'fold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/fold.c'; fi`
 629
 630 libRNA_a-naview.o: naview.c
 631 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-naview.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-naview.Tpo -c -o libRNA_a-naview.o `test -f 'naview.c' || echo '$(srcdir)/'`naview.c
 632 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-naview.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-naview.Po
 633 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='naview.c' object='libRNA_a-naview.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 634 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 635 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-naview.o `test -f 'naview.c' || echo '$(srcdir)/'`naview.c
 636
 637 libRNA_a-naview.obj: naview.c
 638 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-naview.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-naview.Tpo -c -o libRNA_a-naview.obj `if test -f 'naview.c'; then $(CYGPATH_W) 'naview.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/naview.c'; fi`
 639 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-naview.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-naview.Po
 640 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='naview.c' object='libRNA_a-naview.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 641 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 642 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-naview.obj `if test -f 'naview.c'; then $(CYGPATH_W) 'naview.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/naview.c'; fi`
 643
 644 libRNA_a-PS_dot.o: PS_dot.c
 645 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-PS_dot.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-PS_dot.Tpo -c -o libRNA_a-PS_dot.o `test -f 'PS_dot.c' || echo '$(srcdir)/'`PS_dot.c
 646 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-PS_dot.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-PS_dot.Po
 647 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='PS_dot.c' object='libRNA_a-PS_dot.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 648 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 649 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-PS_dot.o `test -f 'PS_dot.c' || echo '$(srcdir)/'`PS_dot.c
 650
 651 libRNA_a-PS_dot.obj: PS_dot.c
 652 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-PS_dot.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-PS_dot.Tpo -c -o libRNA_a-PS_dot.obj `if test -f 'PS_dot.c'; then $(CYGPATH_W) 'PS_dot.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/PS_dot.c'; fi`
 653 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-PS_dot.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-PS_dot.Po
 654 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='PS_dot.c' object='libRNA_a-PS_dot.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 655 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 656 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-PS_dot.obj `if test -f 'PS_dot.c'; then $(CYGPATH_W) 'PS_dot.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/PS_dot.c'; fi`
 657
 658 libRNA_a-stringdist.o: stringdist.c
 659 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-stringdist.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-stringdist.Tpo -c -o libRNA_a-stringdist.o `test -f 'stringdist.c' || echo '$(srcdir)/'`stringdist.c
 660 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-stringdist.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-stringdist.Po
 661 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='stringdist.c' object='libRNA_a-stringdist.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 662 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 663 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-stringdist.o `test -f 'stringdist.c' || echo '$(srcdir)/'`stringdist.c
 664
 665 libRNA_a-stringdist.obj: stringdist.c
 666 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-stringdist.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-stringdist.Tpo -c -o libRNA_a-stringdist.obj `if test -f 'stringdist.c'; then $(CYGPATH_W) 'stringdist.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/stringdist.c'; fi`
 667 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-stringdist.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-stringdist.Po
 668 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='stringdist.c' object='libRNA_a-stringdist.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 669 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 670 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-stringdist.obj `if test -f 'stringdist.c'; then $(CYGPATH_W) 'stringdist.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/stringdist.c'; fi`
 671
 672 libRNA_a-params.o: params.c
 673 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-params.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-params.Tpo -c -o libRNA_a-params.o `test -f 'params.c' || echo '$(srcdir)/'`params.c
 674 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-params.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-params.Po
 675 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='params.c' object='libRNA_a-params.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 676 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 677 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-params.o `test -f 'params.c' || echo '$(srcdir)/'`params.c
 678
 679 libRNA_a-params.obj: params.c
 680 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-params.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-params.Tpo -c -o libRNA_a-params.obj `if test -f 'params.c'; then $(CYGPATH_W) 'params.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/params.c'; fi`
 681 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-params.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-params.Po
 682 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='params.c' object='libRNA_a-params.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 683 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 684 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-params.obj `if test -f 'params.c'; then $(CYGPATH_W) 'params.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/params.c'; fi`
 685
 686 libRNA_a-subopt.o: subopt.c
 687 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-subopt.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-subopt.Tpo -c -o libRNA_a-subopt.o `test -f 'subopt.c' || echo '$(srcdir)/'`subopt.c
 688 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-subopt.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-subopt.Po
 689 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='subopt.c' object='libRNA_a-subopt.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 690 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 691 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-subopt.o `test -f 'subopt.c' || echo '$(srcdir)/'`subopt.c
 692
 693 libRNA_a-subopt.obj: subopt.c
 694 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-subopt.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-subopt.Tpo -c -o libRNA_a-subopt.obj `if test -f 'subopt.c'; then $(CYGPATH_W) 'subopt.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/subopt.c'; fi`
 695 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-subopt.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-subopt.Po
 696 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='subopt.c' object='libRNA_a-subopt.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 697 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 698 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-subopt.obj `if test -f 'subopt.c'; then $(CYGPATH_W) 'subopt.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/subopt.c'; fi`
 699
 700 libRNA_a-list.o: list.c
 701 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-list.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-list.Tpo -c -o libRNA_a-list.o `test -f 'list.c' || echo '$(srcdir)/'`list.c
 702 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-list.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-list.Po
 703 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='list.c' object='libRNA_a-list.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 704 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 705 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-list.o `test -f 'list.c' || echo '$(srcdir)/'`list.c
 706
 707 libRNA_a-list.obj: list.c
 708 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-list.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-list.Tpo -c -o libRNA_a-list.obj `if test -f 'list.c'; then $(CYGPATH_W) 'list.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/list.c'; fi`
 709 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-list.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-list.Po
 710 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='list.c' object='libRNA_a-list.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 711 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 712 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-list.obj `if test -f 'list.c'; then $(CYGPATH_W) 'list.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/list.c'; fi`
 713
 714 libRNA_a-Lfold.o: Lfold.c
 715 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-Lfold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-Lfold.Tpo -c -o libRNA_a-Lfold.o `test -f 'Lfold.c' || echo '$(srcdir)/'`Lfold.c
 716 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-Lfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-Lfold.Po
 717 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='Lfold.c' object='libRNA_a-Lfold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 718 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 719 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-Lfold.o `test -f 'Lfold.c' || echo '$(srcdir)/'`Lfold.c
 720
 721 libRNA_a-Lfold.obj: Lfold.c
 722 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-Lfold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-Lfold.Tpo -c -o libRNA_a-Lfold.obj `if test -f 'Lfold.c'; then $(CYGPATH_W) 'Lfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/Lfold.c'; fi`
 723 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-Lfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-Lfold.Po
 724 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='Lfold.c' object='libRNA_a-Lfold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 725 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 726 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-Lfold.obj `if test -f 'Lfold.c'; then $(CYGPATH_W) 'Lfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/Lfold.c'; fi`
 727
 728 libRNA_a-cofold.o: cofold.c
 729 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-cofold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-cofold.Tpo -c -o libRNA_a-cofold.o `test -f 'cofold.c' || echo '$(srcdir)/'`cofold.c
 730 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-cofold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-cofold.Po
 731 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='cofold.c' object='libRNA_a-cofold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 732 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 733 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-cofold.o `test -f 'cofold.c' || echo '$(srcdir)/'`cofold.c
 734
 735 libRNA_a-cofold.obj: cofold.c
 736 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-cofold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-cofold.Tpo -c -o libRNA_a-cofold.obj `if test -f 'cofold.c'; then $(CYGPATH_W) 'cofold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/cofold.c'; fi`
 737 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-cofold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-cofold.Po
 738 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='cofold.c' object='libRNA_a-cofold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 739 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 740 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-cofold.obj `if test -f 'cofold.c'; then $(CYGPATH_W) 'cofold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/cofold.c'; fi`
 741
 742 libRNA_a-part_func_co.o: part_func_co.c
 743 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-part_func_co.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_co.Tpo -c -o libRNA_a-part_func_co.o `test -f 'part_func_co.c' || echo '$(srcdir)/'`part_func_co.c
 744 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_co.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_co.Po
 745 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='part_func_co.c' object='libRNA_a-part_func_co.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 746 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 747 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-part_func_co.o `test -f 'part_func_co.c' || echo '$(srcdir)/'`part_func_co.c
 748
 749 libRNA_a-part_func_co.obj: part_func_co.c
 750 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-part_func_co.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_co.Tpo -c -o libRNA_a-part_func_co.obj `if test -f 'part_func_co.c'; then $(CYGPATH_W) 'part_func_co.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/part_func_co.c'; fi`
 751 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_co.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_co.Po
 752 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='part_func_co.c' object='libRNA_a-part_func_co.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 753 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 754 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-part_func_co.obj `if test -f 'part_func_co.c'; then $(CYGPATH_W) 'part_func_co.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/part_func_co.c'; fi`
 755
 756 libRNA_a-ProfileAln.o: ProfileAln.c
 757 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-ProfileAln.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileAln.Tpo -c -o libRNA_a-ProfileAln.o `test -f 'ProfileAln.c' || echo '$(srcdir)/'`ProfileAln.c
 758 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileAln.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileAln.Po
 759 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='ProfileAln.c' object='libRNA_a-ProfileAln.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 760 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 761 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-ProfileAln.o `test -f 'ProfileAln.c' || echo '$(srcdir)/'`ProfileAln.c
 762
 763 libRNA_a-ProfileAln.obj: ProfileAln.c
 764 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-ProfileAln.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileAln.Tpo -c -o libRNA_a-ProfileAln.obj `if test -f 'ProfileAln.c'; then $(CYGPATH_W) 'ProfileAln.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/ProfileAln.c'; fi`
 765 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileAln.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-ProfileAln.Po
 766 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='ProfileAln.c' object='libRNA_a-ProfileAln.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 767 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 768 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-ProfileAln.obj `if test -f 'ProfileAln.c'; then $(CYGPATH_W) 'ProfileAln.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/ProfileAln.c'; fi`
 769
 770 libRNA_a-duplex.o: duplex.c
 771 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-duplex.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-duplex.Tpo -c -o libRNA_a-duplex.o `test -f 'duplex.c' || echo '$(srcdir)/'`duplex.c
 772 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-duplex.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-duplex.Po
 773 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='duplex.c' object='libRNA_a-duplex.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 774 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 775 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-duplex.o `test -f 'duplex.c' || echo '$(srcdir)/'`duplex.c
 776
 777 libRNA_a-duplex.obj: duplex.c
 778 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-duplex.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-duplex.Tpo -c -o libRNA_a-duplex.obj `if test -f 'duplex.c'; then $(CYGPATH_W) 'duplex.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/duplex.c'; fi`
 779 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-duplex.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-duplex.Po
 780 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='duplex.c' object='libRNA_a-duplex.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 781 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 782 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-duplex.obj `if test -f 'duplex.c'; then $(CYGPATH_W) 'duplex.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/duplex.c'; fi`
 783
 784 libRNA_a-alifold.o: alifold.c
 785 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-alifold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-alifold.Tpo -c -o libRNA_a-alifold.o `test -f 'alifold.c' || echo '$(srcdir)/'`alifold.c
 786 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-alifold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-alifold.Po
 787 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='alifold.c' object='libRNA_a-alifold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 788 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 789 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-alifold.o `test -f 'alifold.c' || echo '$(srcdir)/'`alifold.c
 790
 791 libRNA_a-alifold.obj: alifold.c
 792 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-alifold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-alifold.Tpo -c -o libRNA_a-alifold.obj `if test -f 'alifold.c'; then $(CYGPATH_W) 'alifold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/alifold.c'; fi`
 793 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-alifold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-alifold.Po
 794 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='alifold.c' object='libRNA_a-alifold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 795 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 796 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-alifold.obj `if test -f 'alifold.c'; then $(CYGPATH_W) 'alifold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/alifold.c'; fi`
 797
 798 libRNA_a-alipfold.o: alipfold.c
 799 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-alipfold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-alipfold.Tpo -c -o libRNA_a-alipfold.o `test -f 'alipfold.c' || echo '$(srcdir)/'`alipfold.c
 800 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-alipfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-alipfold.Po
 801 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='alipfold.c' object='libRNA_a-alipfold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 802 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 803 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-alipfold.o `test -f 'alipfold.c' || echo '$(srcdir)/'`alipfold.c
 804
 805 libRNA_a-alipfold.obj: alipfold.c
 806 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-alipfold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-alipfold.Tpo -c -o libRNA_a-alipfold.obj `if test -f 'alipfold.c'; then $(CYGPATH_W) 'alipfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/alipfold.c'; fi`
 807 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-alipfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-alipfold.Po
 808 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='alipfold.c' object='libRNA_a-alipfold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 809 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 810 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-alipfold.obj `if test -f 'alipfold.c'; then $(CYGPATH_W) 'alipfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/alipfold.c'; fi`
 811
 812 libRNA_a-aln_util.o: aln_util.c
 813 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-aln_util.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-aln_util.Tpo -c -o libRNA_a-aln_util.o `test -f 'aln_util.c' || echo '$(srcdir)/'`aln_util.c
 814 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-aln_util.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-aln_util.Po
 815 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='aln_util.c' object='libRNA_a-aln_util.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 816 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 817 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-aln_util.o `test -f 'aln_util.c' || echo '$(srcdir)/'`aln_util.c
 818
 819 libRNA_a-aln_util.obj: aln_util.c
 820 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-aln_util.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-aln_util.Tpo -c -o libRNA_a-aln_util.obj `if test -f 'aln_util.c'; then $(CYGPATH_W) 'aln_util.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/aln_util.c'; fi`
 821 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-aln_util.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-aln_util.Po
 822 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='aln_util.c' object='libRNA_a-aln_util.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 823 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 824 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-aln_util.obj `if test -f 'aln_util.c'; then $(CYGPATH_W) 'aln_util.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/aln_util.c'; fi`
 825
 826 libRNA_a-LPfold.o: LPfold.c
 827 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-LPfold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-LPfold.Tpo -c -o libRNA_a-LPfold.o `test -f 'LPfold.c' || echo '$(srcdir)/'`LPfold.c
 828 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-LPfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-LPfold.Po
 829 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='LPfold.c' object='libRNA_a-LPfold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 830 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 831 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-LPfold.o `test -f 'LPfold.c' || echo '$(srcdir)/'`LPfold.c
 832
 833 libRNA_a-LPfold.obj: LPfold.c
 834 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-LPfold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-LPfold.Tpo -c -o libRNA_a-LPfold.obj `if test -f 'LPfold.c'; then $(CYGPATH_W) 'LPfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/LPfold.c'; fi`
 835 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-LPfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-LPfold.Po
 836 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='LPfold.c' object='libRNA_a-LPfold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 837 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 838 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-LPfold.obj `if test -f 'LPfold.c'; then $(CYGPATH_W) 'LPfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/LPfold.c'; fi`
 839
 840 libRNA_a-part_func_up.o: part_func_up.c
 841 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-part_func_up.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_up.Tpo -c -o libRNA_a-part_func_up.o `test -f 'part_func_up.c' || echo '$(srcdir)/'`part_func_up.c
 842 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_up.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_up.Po
 843 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='part_func_up.c' object='libRNA_a-part_func_up.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 844 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 845 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-part_func_up.o `test -f 'part_func_up.c' || echo '$(srcdir)/'`part_func_up.c
 846
 847 libRNA_a-part_func_up.obj: part_func_up.c
 848 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-part_func_up.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_up.Tpo -c -o libRNA_a-part_func_up.obj `if test -f 'part_func_up.c'; then $(CYGPATH_W) 'part_func_up.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/part_func_up.c'; fi`
 849 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_up.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-part_func_up.Po
 850 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='part_func_up.c' object='libRNA_a-part_func_up.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 851 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 852 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-part_func_up.obj `if test -f 'part_func_up.c'; then $(CYGPATH_W) 'part_func_up.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/part_func_up.c'; fi`
 853
 854 libRNA_a-ribo.o: ribo.c
 855 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-ribo.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-ribo.Tpo -c -o libRNA_a-ribo.o `test -f 'ribo.c' || echo '$(srcdir)/'`ribo.c
 856 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-ribo.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-ribo.Po
 857 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='ribo.c' object='libRNA_a-ribo.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 858 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 859 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-ribo.o `test -f 'ribo.c' || echo '$(srcdir)/'`ribo.c
 860
 861 libRNA_a-ribo.obj: ribo.c
 862 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-ribo.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-ribo.Tpo -c -o libRNA_a-ribo.obj `if test -f 'ribo.c'; then $(CYGPATH_W) 'ribo.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/ribo.c'; fi`
 863 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-ribo.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-ribo.Po
 864 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='ribo.c' object='libRNA_a-ribo.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 865 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 866 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-ribo.obj `if test -f 'ribo.c'; then $(CYGPATH_W) 'ribo.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/ribo.c'; fi`
 867
 868 libRNA_a-findpath.o: findpath.c
 869 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-findpath.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-findpath.Tpo -c -o libRNA_a-findpath.o `test -f 'findpath.c' || echo '$(srcdir)/'`findpath.c
 870 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-findpath.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-findpath.Po
 871 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='findpath.c' object='libRNA_a-findpath.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 872 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 873 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-findpath.o `test -f 'findpath.c' || echo '$(srcdir)/'`findpath.c
 874
 875 libRNA_a-findpath.obj: findpath.c
 876 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-findpath.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-findpath.Tpo -c -o libRNA_a-findpath.obj `if test -f 'findpath.c'; then $(CYGPATH_W) 'findpath.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/findpath.c'; fi`
 877 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-findpath.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-findpath.Po
 878 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='findpath.c' object='libRNA_a-findpath.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 879 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 880 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-findpath.obj `if test -f 'findpath.c'; then $(CYGPATH_W) 'findpath.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/findpath.c'; fi`
 881
 882 libRNA_a-convert_epars.o: convert_epars.c
 883 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-convert_epars.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-convert_epars.Tpo -c -o libRNA_a-convert_epars.o `test -f 'convert_epars.c' || echo '$(srcdir)/'`convert_epars.c
 884 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-convert_epars.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-convert_epars.Po
 885 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='convert_epars.c' object='libRNA_a-convert_epars.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 886 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 887 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-convert_epars.o `test -f 'convert_epars.c' || echo '$(srcdir)/'`convert_epars.c
 888
 889 libRNA_a-convert_epars.obj: convert_epars.c
 890 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-convert_epars.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-convert_epars.Tpo -c -o libRNA_a-convert_epars.obj `if test -f 'convert_epars.c'; then $(CYGPATH_W) 'convert_epars.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/convert_epars.c'; fi`
 891 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-convert_epars.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-convert_epars.Po
 892 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='convert_epars.c' object='libRNA_a-convert_epars.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 893 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 894 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-convert_epars.obj `if test -f 'convert_epars.c'; then $(CYGPATH_W) 'convert_epars.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/convert_epars.c'; fi`
 895
 896 libRNA_a-MEA.o: MEA.c
 897 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-MEA.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-MEA.Tpo -c -o libRNA_a-MEA.o `test -f 'MEA.c' || echo '$(srcdir)/'`MEA.c
 898 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-MEA.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-MEA.Po
 899 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='MEA.c' object='libRNA_a-MEA.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 900 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 901 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-MEA.o `test -f 'MEA.c' || echo '$(srcdir)/'`MEA.c
 902
 903 libRNA_a-MEA.obj: MEA.c
 904 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-MEA.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-MEA.Tpo -c -o libRNA_a-MEA.obj `if test -f 'MEA.c'; then $(CYGPATH_W) 'MEA.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/MEA.c'; fi`
 905 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-MEA.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-MEA.Po
 906 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='MEA.c' object='libRNA_a-MEA.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 907 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 908 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-MEA.obj `if test -f 'MEA.c'; then $(CYGPATH_W) 'MEA.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/MEA.c'; fi`
 909
 910 libRNA_a-aliLfold.o: aliLfold.c
 911 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-aliLfold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-aliLfold.Tpo -c -o libRNA_a-aliLfold.o `test -f 'aliLfold.c' || echo '$(srcdir)/'`aliLfold.c
 912 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-aliLfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-aliLfold.Po
 913 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='aliLfold.c' object='libRNA_a-aliLfold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 914 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 915 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-aliLfold.o `test -f 'aliLfold.c' || echo '$(srcdir)/'`aliLfold.c
 916
 917 libRNA_a-aliLfold.obj: aliLfold.c
 918 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-aliLfold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-aliLfold.Tpo -c -o libRNA_a-aliLfold.obj `if test -f 'aliLfold.c'; then $(CYGPATH_W) 'aliLfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/aliLfold.c'; fi`
 919 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-aliLfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-aliLfold.Po
 920 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='aliLfold.c' object='libRNA_a-aliLfold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 921 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 922 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-aliLfold.obj `if test -f 'aliLfold.c'; then $(CYGPATH_W) 'aliLfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/aliLfold.c'; fi`
 923
 924 libRNA_a-mm.o: mm.c
 925 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-mm.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-mm.Tpo -c -o libRNA_a-mm.o `test -f 'mm.c' || echo '$(srcdir)/'`mm.c
 926 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-mm.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-mm.Po
 927 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='mm.c' object='libRNA_a-mm.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 928 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 929 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-mm.o `test -f 'mm.c' || echo '$(srcdir)/'`mm.c
 930
 931 libRNA_a-mm.obj: mm.c
 932 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-mm.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-mm.Tpo -c -o libRNA_a-mm.obj `if test -f 'mm.c'; then $(CYGPATH_W) 'mm.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/mm.c'; fi`
 933 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-mm.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-mm.Po
 934 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='mm.c' object='libRNA_a-mm.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 935 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 936 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-mm.obj `if test -f 'mm.c'; then $(CYGPATH_W) 'mm.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/mm.c'; fi`
 937
 938 libRNA_a-2Dfold.o: 2Dfold.c
 939 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-2Dfold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dfold.Tpo -c -o libRNA_a-2Dfold.o `test -f '2Dfold.c' || echo '$(srcdir)/'`2Dfold.c
 940 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dfold.Po
 941 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='2Dfold.c' object='libRNA_a-2Dfold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 942 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 943 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-2Dfold.o `test -f '2Dfold.c' || echo '$(srcdir)/'`2Dfold.c
 944
 945 libRNA_a-2Dfold.obj: 2Dfold.c
 946 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-2Dfold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dfold.Tpo -c -o libRNA_a-2Dfold.obj `if test -f '2Dfold.c'; then $(CYGPATH_W) '2Dfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/2Dfold.c'; fi`
 947 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dfold.Po
 948 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='2Dfold.c' object='libRNA_a-2Dfold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 949 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 950 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-2Dfold.obj `if test -f '2Dfold.c'; then $(CYGPATH_W) '2Dfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/2Dfold.c'; fi`
 951
 952 libRNA_a-2Dpfold.o: 2Dpfold.c
 953 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-2Dpfold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dpfold.Tpo -c -o libRNA_a-2Dpfold.o `test -f '2Dpfold.c' || echo '$(srcdir)/'`2Dpfold.c
 954 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dpfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dpfold.Po
 955 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='2Dpfold.c' object='libRNA_a-2Dpfold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 956 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 957 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-2Dpfold.o `test -f '2Dpfold.c' || echo '$(srcdir)/'`2Dpfold.c
 958
 959 libRNA_a-2Dpfold.obj: 2Dpfold.c
 960 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-2Dpfold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dpfold.Tpo -c -o libRNA_a-2Dpfold.obj `if test -f '2Dpfold.c'; then $(CYGPATH_W) '2Dpfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/2Dpfold.c'; fi`
 961 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dpfold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-2Dpfold.Po
 962 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='2Dpfold.c' object='libRNA_a-2Dpfold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 963 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 964 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-2Dpfold.obj `if test -f '2Dpfold.c'; then $(CYGPATH_W) '2Dpfold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/2Dpfold.c'; fi`
 965
 966 libRNA_a-plex_functions.o: plex_functions.c
 967 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-plex_functions.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-plex_functions.Tpo -c -o libRNA_a-plex_functions.o `test -f 'plex_functions.c' || echo '$(srcdir)/'`plex_functions.c
 968 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-plex_functions.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-plex_functions.Po
 969 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='plex_functions.c' object='libRNA_a-plex_functions.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 970 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 971 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-plex_functions.o `test -f 'plex_functions.c' || echo '$(srcdir)/'`plex_functions.c
 972
 973 libRNA_a-plex_functions.obj: plex_functions.c
 974 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-plex_functions.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-plex_functions.Tpo -c -o libRNA_a-plex_functions.obj `if test -f 'plex_functions.c'; then $(CYGPATH_W) 'plex_functions.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/plex_functions.c'; fi`
 975 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-plex_functions.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-plex_functions.Po
 976 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='plex_functions.c' object='libRNA_a-plex_functions.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 977 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 978 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-plex_functions.obj `if test -f 'plex_functions.c'; then $(CYGPATH_W) 'plex_functions.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/plex_functions.c'; fi`
 979
 980 libRNA_a-plot_layouts.o: plot_layouts.c
 981 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-plot_layouts.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-plot_layouts.Tpo -c -o libRNA_a-plot_layouts.o `test -f 'plot_layouts.c' || echo '$(srcdir)/'`plot_layouts.c
 982 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-plot_layouts.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-plot_layouts.Po
 983 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='plot_layouts.c' object='libRNA_a-plot_layouts.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 984 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 985 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-plot_layouts.o `test -f 'plot_layouts.c' || echo '$(srcdir)/'`plot_layouts.c
 986
 987 libRNA_a-plot_layouts.obj: plot_layouts.c
 988 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-plot_layouts.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-plot_layouts.Tpo -c -o libRNA_a-plot_layouts.obj `if test -f 'plot_layouts.c'; then $(CYGPATH_W) 'plot_layouts.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/plot_layouts.c'; fi`
 989 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-plot_layouts.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-plot_layouts.Po
 990 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='plot_layouts.c' object='libRNA_a-plot_layouts.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 991 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 992 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-plot_layouts.obj `if test -f 'plot_layouts.c'; then $(CYGPATH_W) 'plot_layouts.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/plot_layouts.c'; fi`
 993
 994 libRNA_a-ali_plex.o: ali_plex.c
 995 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-ali_plex.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-ali_plex.Tpo -c -o libRNA_a-ali_plex.o `test -f 'ali_plex.c' || echo '$(srcdir)/'`ali_plex.c
 996 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-ali_plex.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-ali_plex.Po
 997 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='ali_plex.c' object='libRNA_a-ali_plex.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
 998 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
 999 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-ali_plex.o `test -f 'ali_plex.c' || echo '$(srcdir)/'`ali_plex.c
1000
1001 libRNA_a-ali_plex.obj: ali_plex.c
1002 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-ali_plex.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-ali_plex.Tpo -c -o libRNA_a-ali_plex.obj `if test -f 'ali_plex.c'; then $(CYGPATH_W) 'ali_plex.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/ali_plex.c'; fi`
1003 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-ali_plex.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-ali_plex.Po
1004 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='ali_plex.c' object='libRNA_a-ali_plex.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1005 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1006 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-ali_plex.obj `if test -f 'ali_plex.c'; then $(CYGPATH_W) 'ali_plex.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/ali_plex.c'; fi`
1007
1008 libRNA_a-c_plex.o: c_plex.c
1009 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-c_plex.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-c_plex.Tpo -c -o libRNA_a-c_plex.o `test -f 'c_plex.c' || echo '$(srcdir)/'`c_plex.c
1010 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-c_plex.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-c_plex.Po
1011 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='c_plex.c' object='libRNA_a-c_plex.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1012 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1013 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-c_plex.o `test -f 'c_plex.c' || echo '$(srcdir)/'`c_plex.c
1014
1015 libRNA_a-c_plex.obj: c_plex.c
1016 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-c_plex.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-c_plex.Tpo -c -o libRNA_a-c_plex.obj `if test -f 'c_plex.c'; then $(CYGPATH_W) 'c_plex.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/c_plex.c'; fi`
1017 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-c_plex.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-c_plex.Po
1018 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='c_plex.c' object='libRNA_a-c_plex.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1019 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1020 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-c_plex.obj `if test -f 'c_plex.c'; then $(CYGPATH_W) 'c_plex.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/c_plex.c'; fi`
1021
1022 libRNA_a-plex.o: plex.c
1023 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-plex.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-plex.Tpo -c -o libRNA_a-plex.o `test -f 'plex.c' || echo '$(srcdir)/'`plex.c
1024 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-plex.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-plex.Po
1025 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='plex.c' object='libRNA_a-plex.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1026 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1027 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-plex.o `test -f 'plex.c' || echo '$(srcdir)/'`plex.c
1028
1029 libRNA_a-plex.obj: plex.c
1030 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-plex.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-plex.Tpo -c -o libRNA_a-plex.obj `if test -f 'plex.c'; then $(CYGPATH_W) 'plex.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/plex.c'; fi`
1031 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-plex.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-plex.Po
1032 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='plex.c' object='libRNA_a-plex.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1033 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1034 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-plex.obj `if test -f 'plex.c'; then $(CYGPATH_W) 'plex.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/plex.c'; fi`
1035
1036 libRNA_a-snofold.o: snofold.c
1037 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-snofold.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-snofold.Tpo -c -o libRNA_a-snofold.o `test -f 'snofold.c' || echo '$(srcdir)/'`snofold.c
1038 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-snofold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-snofold.Po
1039 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='snofold.c' object='libRNA_a-snofold.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1040 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1041 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-snofold.o `test -f 'snofold.c' || echo '$(srcdir)/'`snofold.c
1042
1043 libRNA_a-snofold.obj: snofold.c
1044 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-snofold.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-snofold.Tpo -c -o libRNA_a-snofold.obj `if test -f 'snofold.c'; then $(CYGPATH_W) 'snofold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/snofold.c'; fi`
1045 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-snofold.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-snofold.Po
1046 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='snofold.c' object='libRNA_a-snofold.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1047 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1048 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-snofold.obj `if test -f 'snofold.c'; then $(CYGPATH_W) 'snofold.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/snofold.c'; fi`
1049
1050 libRNA_a-snoop.o: snoop.c
1051 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-snoop.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-snoop.Tpo -c -o libRNA_a-snoop.o `test -f 'snoop.c' || echo '$(srcdir)/'`snoop.c
1052 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-snoop.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-snoop.Po
1053 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='snoop.c' object='libRNA_a-snoop.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1054 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1055 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-snoop.o `test -f 'snoop.c' || echo '$(srcdir)/'`snoop.c
1056
1057 libRNA_a-snoop.obj: snoop.c
1058 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-snoop.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-snoop.Tpo -c -o libRNA_a-snoop.obj `if test -f 'snoop.c'; then $(CYGPATH_W) 'snoop.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/snoop.c'; fi`
1059 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-snoop.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-snoop.Po
1060 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='snoop.c' object='libRNA_a-snoop.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1061 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1062 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-snoop.obj `if test -f 'snoop.c'; then $(CYGPATH_W) 'snoop.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/snoop.c'; fi`
1063
1064 libRNA_a-move_set.o: move_set.c
1065 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-move_set.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-move_set.Tpo -c -o libRNA_a-move_set.o `test -f 'move_set.c' || echo '$(srcdir)/'`move_set.c
1066 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-move_set.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-move_set.Po
1067 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='move_set.c' object='libRNA_a-move_set.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1068 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1069 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-move_set.o `test -f 'move_set.c' || echo '$(srcdir)/'`move_set.c
1070
1071 libRNA_a-move_set.obj: move_set.c
1072 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-move_set.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-move_set.Tpo -c -o libRNA_a-move_set.obj `if test -f 'move_set.c'; then $(CYGPATH_W) 'move_set.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/move_set.c'; fi`
1073 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-move_set.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-move_set.Po
1074 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='move_set.c' object='libRNA_a-move_set.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1075 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1076 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-move_set.obj `if test -f 'move_set.c'; then $(CYGPATH_W) 'move_set.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/move_set.c'; fi`
1077
1078 libRNA_a-gquad.o: gquad.c
1079 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-gquad.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-gquad.Tpo -c -o libRNA_a-gquad.o `test -f 'gquad.c' || echo '$(srcdir)/'`gquad.c
1080 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-gquad.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-gquad.Po
1081 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='gquad.c' object='libRNA_a-gquad.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1082 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1083 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-gquad.o `test -f 'gquad.c' || echo '$(srcdir)/'`gquad.c
1084
1085 libRNA_a-gquad.obj: gquad.c
1086 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-gquad.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-gquad.Tpo -c -o libRNA_a-gquad.obj `if test -f 'gquad.c'; then $(CYGPATH_W) 'gquad.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/gquad.c'; fi`
1087 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-gquad.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-gquad.Po
1088 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='gquad.c' object='libRNA_a-gquad.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1089 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1090 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-gquad.obj `if test -f 'gquad.c'; then $(CYGPATH_W) 'gquad.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/gquad.c'; fi`
1091
1092 libRNA_a-svm_utils.o: svm_utils.c
1093 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-svm_utils.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-svm_utils.Tpo -c -o libRNA_a-svm_utils.o `test -f 'svm_utils.c' || echo '$(srcdir)/'`svm_utils.c
1094 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-svm_utils.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-svm_utils.Po
1095 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='svm_utils.c' object='libRNA_a-svm_utils.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1096 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1097 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-svm_utils.o `test -f 'svm_utils.c' || echo '$(srcdir)/'`svm_utils.c
1098
1099 libRNA_a-svm_utils.obj: svm_utils.c
1100 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_CC)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -MT libRNA_a-svm_utils.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/libRNA_a-svm_utils.Tpo -c -o libRNA_a-svm_utils.obj `if test -f 'svm_utils.c'; then $(CYGPATH_W) 'svm_utils.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/svm_utils.c'; fi`
1101 @am__fastdepCC_TRUE@    $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/libRNA_a-svm_utils.Tpo $(DEPDIR)/libRNA_a-svm_utils.Po
1102 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       $(AM_V_CC)source='svm_utils.c' object='libRNA_a-svm_utils.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1103 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCC_FALSE@       DEPDIR=$(DEPDIR) $(CCDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1104 @am__fastdepCC_FALSE@   $(AM_V_CC@am__nodep@)$(CC) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(libRNA_a_CFLAGS) $(CFLAGS) -c -o libRNA_a-svm_utils.obj `if test -f 'svm_utils.c'; then $(CYGPATH_W) 'svm_utils.c'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/svm_utils.c'; fi`
1105
1106 .cpp.o:
1107 @am__fastdepCXX_TRUE@   $(AM_V_CXX)$(CXXCOMPILE) -MT $@ -MD -MP -MF $(DEPDIR)/$*.Tpo -c -o $@ $<
1108 @am__fastdepCXX_TRUE@   $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/$*.Tpo $(DEPDIR)/$*.Po
1109 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCXX_FALSE@      $(AM_V_CXX)source='$<' object='$@' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1110 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCXX_FALSE@      DEPDIR=$(DEPDIR) $(CXXDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1111 @am__fastdepCXX_FALSE@  $(AM_V_CXX@am__nodep@)$(CXXCOMPILE) -c -o $@ $<
1112
1113 .cpp.obj:
1114 @am__fastdepCXX_TRUE@   $(AM_V_CXX)$(CXXCOMPILE) -MT $@ -MD -MP -MF $(DEPDIR)/$*.Tpo -c -o $@ `$(CYGPATH_W) '$<'`
1115 @am__fastdepCXX_TRUE@   $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/$*.Tpo $(DEPDIR)/$*.Po
1116 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCXX_FALSE@      $(AM_V_CXX)source='$<' object='$@' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1117 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCXX_FALSE@      DEPDIR=$(DEPDIR) $(CXXDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1118 @am__fastdepCXX_FALSE@  $(AM_V_CXX@am__nodep@)$(CXXCOMPILE) -c -o $@ `$(CYGPATH_W) '$<'`
1119
1120 svm.o: ../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp
1121 @am__fastdepCXX_TRUE@   $(AM_V_CXX)$(CXX) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(AM_CXXFLAGS) $(CXXFLAGS) -MT svm.o -MD -MP -MF $(DEPDIR)/svm.Tpo -c -o svm.o `test -f '../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp' || echo '$(srcdir)/'`../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp
1122 @am__fastdepCXX_TRUE@   $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/svm.Tpo $(DEPDIR)/svm.Po
1123 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCXX_FALSE@      $(AM_V_CXX)source='../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp' object='svm.o' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1124 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCXX_FALSE@      DEPDIR=$(DEPDIR) $(CXXDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1125 @am__fastdepCXX_FALSE@  $(AM_V_CXX@am__nodep@)$(CXX) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(AM_CXXFLAGS) $(CXXFLAGS) -c -o svm.o `test -f '../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp' || echo '$(srcdir)/'`../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp
1126
1127 svm.obj: ../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp
1128 @am__fastdepCXX_TRUE@   $(AM_V_CXX)$(CXX) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(AM_CXXFLAGS) $(CXXFLAGS) -MT svm.obj -MD -MP -MF $(DEPDIR)/svm.Tpo -c -o svm.obj `if test -f '../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp'; then $(CYGPATH_W) '../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp'; fi`
1129 @am__fastdepCXX_TRUE@   $(AM_V_at)$(am__mv) $(DEPDIR)/svm.Tpo $(DEPDIR)/svm.Po
1130 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCXX_FALSE@      $(AM_V_CXX)source='../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp' object='svm.obj' libtool=no @AMDEPBACKSLASH@
1131 @AMDEP_TRUE@@am__fastdepCXX_FALSE@      DEPDIR=$(DEPDIR) $(CXXDEPMODE) $(depcomp) @AMDEPBACKSLASH@
1132 @am__fastdepCXX_FALSE@  $(AM_V_CXX@am__nodep@)$(CXX) $(DEFS) $(DEFAULT_INCLUDES) $(INCLUDES) $(AM_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(AM_CXXFLAGS) $(CXXFLAGS) -c -o svm.obj `if test -f '../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp'; then $(CYGPATH_W) '../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp'; else $(CYGPATH_W) '$(srcdir)/../@LIBSVM_DIR@/svm.cpp'; fi`
1133
1134 ID: $(HEADERS) $(SOURCES) $(LISP) $(TAGS_FILES)
1135         list='$(SOURCES) $(HEADERS) $(LISP) $(TAGS_FILES)'; \
1136         unique=`for i in $$list; do \
1137             if test -f "$$i"; then echo $$i; else echo $(srcdir)/$$i; fi; \
1138           done | \
1139           $(AWK) '{ files[$$0] = 1; nonempty = 1; } \
1140               END { if (nonempty) { for (i in files) print i; }; }'`; \
1141         mkid -fID $$unique
1142 tags: TAGS
1143
1144 TAGS:  $(HEADERS) $(SOURCES)  $(TAGS_DEPENDENCIES) \
1145                 $(TAGS_FILES) $(LISP)
1146         set x; \
1147         here=`pwd`; \
1148         list='$(SOURCES) $(HEADERS)  $(LISP) $(TAGS_FILES)'; \
1149         unique=`for i in $$list; do \
1150             if test -f "$$i"; then echo $$i; else echo $(srcdir)/$$i; fi; \
1151           done | \
1152           $(AWK) '{ files[$$0] = 1; nonempty = 1; } \
1153               END { if (nonempty) { for (i in files) print i; }; }'`; \
1154         shift; \
1155         if test -z "$(ETAGS_ARGS)$$*$$unique"; then :; else \
1156           test -n "$$unique" || unique=$$empty_fix; \
1157           if test $$# -gt 0; then \
1158             $(ETAGS) $(ETAGSFLAGS) $(AM_ETAGSFLAGS) $(ETAGS_ARGS) \
1159               "$$@" $$unique; \
1160           else \
1161             $(ETAGS) $(ETAGSFLAGS) $(AM_ETAGSFLAGS) $(ETAGS_ARGS) \
1162               $$unique; \
1163           fi; \
1164         fi
1165 ctags: CTAGS
1166 CTAGS:  $(HEADERS) $(SOURCES)  $(TAGS_DEPENDENCIES) \
1167                 $(TAGS_FILES) $(LISP)
1168         list='$(SOURCES) $(HEADERS)  $(LISP) $(TAGS_FILES)'; \
1169         unique=`for i in $$list; do \
1170             if test -f "$$i"; then echo $$i; else echo $(srcdir)/$$i; fi; \
1171           done | \
1172           $(AWK) '{ files[$$0] = 1; nonempty = 1; } \
1173               END { if (nonempty) { for (i in files) print i; }; }'`; \
1174         test -z "$(CTAGS_ARGS)$$unique" \
1175           || $(CTAGS) $(CTAGSFLAGS) $(AM_CTAGSFLAGS) $(CTAGS_ARGS) \
1176              $$unique
1177
1178 GTAGS:
1179         here=`$(am__cd) $(top_builddir) && pwd` \
1180           && $(am__cd) $(top_srcdir) \
1181           && gtags -i $(GTAGS_ARGS) "$$here"
1182
1183 distclean-tags:
1184         -rm -f TAGS ID GTAGS GRTAGS GSYMS GPATH tags
1185
1186 distdir: $(DISTFILES)
1187         @srcdirstrip=`echo "$(srcdir)" | sed 's/[].[^$$\\*]/\\\\&/g'`; \
1188         topsrcdirstrip=`echo "$(top_srcdir)" | sed 's/[].[^$$\\*]/\\\\&/g'`; \
1189         list='$(DISTFILES)'; \
1190           dist_files=`for file in $$list; do echo $$file; done | \
1191           sed -e "s|^$$srcdirstrip/||;t" \
1192               -e "s|^$$topsrcdirstrip/|$(top_builddir)/|;t"`; \
1193         case $$dist_files in \
1194           */*) $(MKDIR_P) `echo "$$dist_files" | \
1195                            sed '/\//!d;s|^|$(distdir)/|;s,/[^/]*$$,,' | \
1196                            sort -u` ;; \
1197         esac; \
1198         for file in $$dist_files; do \
1199           if test -f $$file || test -d $$file; then d=.; else d=$(srcdir); fi; \
1200           if test -d $$d/$$file; then \
1201             dir=`echo "/$$file" | sed -e 's,/[^/]*$$,,'`; \
1202             if test -d "$(distdir)/$$file"; then \
1203               find "$(distdir)/$$file" -type d ! -perm -700 -exec chmod u+rwx {} \;; \
1204             fi; \
1205             if test -d $(srcdir)/$$file && test $$d != $(srcdir); then \
1206               cp -fpR $(srcdir)/$$file "$(distdir)$$dir" || exit 1; \
1207               find "$(distdir)/$$file" -type d ! -perm -700 -exec chmod u+rwx {} \;; \
1208             fi; \
1209             cp -fpR $$d/$$file "$(distdir)$$dir" || exit 1; \
1210           else \
1211             test -f "$(distdir)/$$file" \
1212             || cp -p $$d/$$file "$(distdir)/$$file" \
1213             || exit 1; \
1214           fi; \
1215         done
1216 check-am: all-am
1217 check: check-am
1218 all-am: Makefile $(LIBRARIES) $(HEADERS)
1219 installdirs:
1220         for dir in "$(DESTDIR)$(libdir)"; do \
1221           test -z "$$dir" || $(MKDIR_P) "$$dir"; \
1222         done
1223 install: install-am
1224 install-exec: install-exec-am
1225 install-data: install-data-am
1226 uninstall: uninstall-am
1227
1228 install-am: all-am
1229         @$(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) install-exec-am install-data-am
1230
1231 installcheck: installcheck-am
1232 install-strip:
1233         if test -z '$(STRIP)'; then \
1234           $(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) INSTALL_PROGRAM="$(INSTALL_STRIP_PROGRAM)" \
1235             install_sh_PROGRAM="$(INSTALL_STRIP_PROGRAM)" INSTALL_STRIP_FLAG=-s \
1236               install; \
1237         else \
1238           $(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) INSTALL_PROGRAM="$(INSTALL_STRIP_PROGRAM)" \
1239             install_sh_PROGRAM="$(INSTALL_STRIP_PROGRAM)" INSTALL_STRIP_FLAG=-s \
1240             "INSTALL_PROGRAM_ENV=STRIPPROG='$(STRIP)'" install; \
1241         fi
1242 mostlyclean-generic:
1243
1244 clean-generic:
1245
1246 distclean-generic:
1247         -test -z "$(CONFIG_CLEAN_FILES)" || rm -f $(CONFIG_CLEAN_FILES)
1248         -test . = "$(srcdir)" || test -z "$(CONFIG_CLEAN_VPATH_FILES)" || rm -f $(CONFIG_CLEAN_VPATH_FILES)
1249
1250 maintainer-clean-generic:
1251         @echo "This command is intended for maintainers to use"
1252         @echo "it deletes files that may require special tools to rebuild."
1253 clean: clean-am
1254
1255 clean-am: clean-generic clean-libLIBRARIES mostlyclean-am
1256
1257 distclean: distclean-am
1258         -rm -rf ./$(DEPDIR)
1259         -rm -f Makefile
1260 distclean-am: clean-am distclean-compile distclean-generic \
1261         distclean-tags
1262
1263 dvi: dvi-am
1264
1265 dvi-am:
1266
1267 html: html-am
1268
1269 html-am:
1270
1271 info: info-am
1272
1273 info-am:
1274
1275 install-data-am:
1276
1277 install-dvi: install-dvi-am
1278
1279 install-dvi-am:
1280
1281 install-exec-am: install-libLIBRARIES
1282
1283 install-html: install-html-am
1284
1285 install-html-am:
1286
1287 install-info: install-info-am
1288
1289 install-info-am:
1290
1291 install-man:
1292
1293 install-pdf: install-pdf-am
1294
1295 install-pdf-am:
1296
1297 install-ps: install-ps-am
1298
1299 install-ps-am:
1300
1301 installcheck-am:
1302
1303 maintainer-clean: maintainer-clean-am
1304         -rm -rf ./$(DEPDIR)
1305         -rm -f Makefile
1306 maintainer-clean-am: distclean-am maintainer-clean-generic
1307
1308 mostlyclean: mostlyclean-am
1309
1310 mostlyclean-am: mostlyclean-compile mostlyclean-generic
1311
1312 pdf: pdf-am
1313
1314 pdf-am:
1315
1316 ps: ps-am
1317
1318 ps-am:
1319
1320 uninstall-am: uninstall-libLIBRARIES
1321
1322 .MAKE: install-am install-strip
1323
1324 .PHONY: CTAGS GTAGS all all-am check check-am clean clean-generic \
1325         clean-libLIBRARIES ctags distclean distclean-compile \
1326         distclean-generic distclean-tags distdir dvi dvi-am html \
1327         html-am info info-am install install-am install-data \
1328         install-data-am install-dvi install-dvi-am install-exec \
1329         install-exec-am install-html install-html-am install-info \
1330         install-info-am install-libLIBRARIES install-man install-pdf \
1331         install-pdf-am install-ps install-ps-am install-strip \
1332         installcheck installcheck-am installdirs maintainer-clean \
1333         maintainer-clean-generic mostlyclean mostlyclean-compile \
1334         mostlyclean-generic pdf pdf-am ps ps-am tags uninstall \
1335         uninstall-am uninstall-libLIBRARIES
1336
1337
1338 # Tell versions [3.59,3.63) of GNU make to not export all variables.
1339 # Otherwise a system limit (for SysV at least) may be exceeded.
1340 .NOEXPORT: