Replace Progs/RNAalifold with x64 binary and add all other programs
[jabaws.git] / binaries / src / ViennaRNA / lib / intl11dH.h
1 PUBLIC int int11_dH[NBPAIRS+1][NBPAIRS+1][5][5] =
2 {{{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
3   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
4   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
5   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
6   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
7   }
8  ,{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
9   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
10   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
11   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
12   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
13   }
14  ,{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
15   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
16   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
17   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
18   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
19   }
20  ,{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
21   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
22   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
23   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
24   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
25   }
26  ,{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
27   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
28   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
29   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
30   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
31   }
32  ,{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
33   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
34   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
35   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
36   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
37   }
38  ,{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
39   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
40   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
41   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
42   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
43   }
44  ,{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
45   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
46   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
47   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
48   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
49   }
50  }
51 ,{{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
52   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
53   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
54   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
55   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
56   }
57  ,{{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
58   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
59   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
60   ,{ -1050, -1050, -1050, -1840, -1050}
61   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
62   }
63  ,{{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
64   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
65   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
66   ,{ -1050, -1050, -1050, -1840, -1050}
67   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1390}
68   }
69  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
70   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
71   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
72   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
73   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
74   }
75  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
76   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
77   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
78   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
79   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
80   }
81  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
82   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
83   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
84   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
85   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
86   }
87  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
88   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
89   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
90   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
91   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
92   }
93  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
94   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
95   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
96   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
97   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
98   }
99  }
100 ,{{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
101   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
102   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
103   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
104   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
105   }
106  ,{{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
107   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
108   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
109   ,{ -1050, -1050, -1050, -1840, -1050}
110   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1390}
111   }
112  ,{{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
113   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
114   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1050}
115   ,{ -1050, -1050, -1050, -1840, -1050}
116   ,{ -1050, -1050, -1050, -1050, -1730}
117   }
118  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
119   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
120   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
121   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
122   ,{  -550,  -550,  -550,  -550, -1230}
123   }
124  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
125   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
126   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
127   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
128   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
129   }
130  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
131   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
132   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
133   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
134   ,{  -550,  -550,  -550,  -550, -1230}
135   }
136  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
137   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
138   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
139   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
140   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
141   }
142  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
143   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
144   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
145   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
146   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
147   }
148  }
149 ,{{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
150   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
151   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
152   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
153   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
154   }
155  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
156   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
157   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
158   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
159   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
160   }
161  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
162   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
163   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
164   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
165   ,{  -550,  -550,  -550,  -550, -1230}
166   }
167  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
168   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
169   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
170   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
171   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -730}
172   }
173  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
174   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
175   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
176   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
177   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
178   }
179  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
180   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
181   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
182   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
183   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -730}
184   }
185  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
186   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
187   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
188   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
189   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
190   }
191  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
192   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
193   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
194   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
195   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
196   }
197  }
198 ,{{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
199   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
200   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
201   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
202   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
203   }
204  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
205   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
206   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
207   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
208   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
209   }
210  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
211   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
212   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
213   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
214   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
215   }
216  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
217   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
218   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
219   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
220   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
221   }
222  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
223   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
224   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
225   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
226   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
227   }
228  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
229   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
230   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
231   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
232   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
233   }
234  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
235   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
236   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
237   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
238   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
239   }
240  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
241   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
242   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
243   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
244   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
245   }
246  }
247 ,{{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
248   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
249   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
250   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
251   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
252   }
253  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
254   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
255   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
256   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
257   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
258   }
259  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
260   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
261   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
262   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
263   ,{  -550,  -550,  -550,  -550, -1230}
264   }
265  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
266   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
267   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
268   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
269   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -730}
270   }
271  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
272   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
273   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
274   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
275   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
276   }
277  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
278   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
279   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
280   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
281   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -730}
282   }
283  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
284   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
285   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
286   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
287   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
288   }
289  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
290   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
291   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
292   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
293   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
294   }
295  }
296 ,{{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
297   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
298   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
299   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
300   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
301   }
302  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
303   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
304   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
305   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
306   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
307   }
308  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
309   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
310   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
311   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
312   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
313   }
314  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
315   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
316   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
317   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
318   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
319   }
320  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
321   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
322   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
323   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
324   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
325   }
326  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
327   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
328   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
329   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
330   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
331   }
332  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
333   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
334   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
335   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
336   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
337   }
338  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
339   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
340   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
341   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
342   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
343   }
344  }
345 ,{{{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
346   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
347   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
348   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
349   ,{   INF,   INF,   INF,   INF,   INF}
350   }
351  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
352   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
353   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
354   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
355   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
356   }
357  ,{{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
358   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
359   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -550}
360   ,{  -550,  -550,  -550, -1340,  -550}
361   ,{  -550,  -550,  -550,  -550,  -890}
362   }
363  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
364   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
365   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
366   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
367   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
368   }
369  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
370   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
371   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
372   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
373   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
374   }
375  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
376   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
377   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
378   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
379   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,  -390}
380   }
381  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
382   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
383   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
384   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
385   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
386   }
387  ,{{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
388   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
389   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
390   ,{   -50,   -50,   -50,  -830,   -50}
391   ,{   -50,   -50,   -50,   -50,   -50}
392   }
393  }};