binaries/src/clustalo/src/clustal/hhalign_wrapper.h

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   2  * Clustal Omega - Multiple sequence alignment
   3  *
   4  * Copyright (C) 2010 University College Dublin
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   6  * Clustal-Omega is free software; you can redistribute it and/or
   7  * modify it under the terms of the GNU General Public License as
   8  * published by the Free Software Foundation; either version 2 of the
   9  * License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * This file is part of Clustal-Omega.
  12  *
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  15 /*
  16  *  RCS $Id: hhalign_wrapper.h 241 2011-05-04 14:37:17Z fabian $
  17  */
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  19
  20 extern double
  21 HHalignWrapper(mseq_t *mseq, int *piOrderLR,
  22                double *pdSeqWeights, int iNodeCount,
  23                hmm_light *prHMMList, int iHMMCount,
  24                int iProfProfSeparator, hhalign_para rHhalignPara);