Wrapper for Clustal Omega.
[jabaws.git] / binaries / src / clustalo / src / clustal / list.h
1 /*********************************************************************
2  * Clustal Omega - Multiple sequence alignment
3  *
4  * Copyright (C) 2010 University College Dublin
5  *
6  * Clustal-Omega is free software; you can redistribute it and/or
7  * modify it under the terms of the GNU General Public License as
8  * published by the Free Software Foundation; either version 2 of the
9  * License, or (at your option) any later version.
10  *
11  * This file is part of Clustal-Omega.
12  *
13  ********************************************************************/
14
15 /*
16  * RCS $Id: list.h 193 2011-02-07 15:45:21Z andreas $
17  *
18  * Generic single linked list storing pointers to data
19  *
20  */
21
22 #ifndef CLUSTALO_LIST_H
23 #define CLUSTALO_LIST_H
24
25 #include <stdlib.h>
26
27 typedef struct list_elem_s {
28     void  *data;
29     struct list_elem_s *next;
30 } list_elem_t;
31
32 typedef struct {
33     /* size of list */
34     int size;
35     /* user defined function for freeing data */
36     void (*destroy)(void *data);
37     list_elem_t *head;
38     list_elem_t *tail;
39 } list_t;
40
41 void ListInit(list_t *prList, void (*destroy)(void *data));
42
43 void ListDestroy(list_t *prList);
44
45 int ListInsertNext(list_t *prList, list_elem_t *prElement, const void *data);
46
47 #define LIST_APPEND(prList, data)  ListInsertNext((prList), LIST_TAIL(prList), (data))
48
49 #define LIST_PREPEND(prList, data)  ListInsertNext((prList), CLUSTALO_LIST_HEAD(prList), (data))
50
51 int ListRemoveNext(list_t *prList, list_elem_t *prElement, void **data);
52
53 #define LIST_SIZE(prList) ((prList)->size)
54
55 #define CLUSTALO_LIST_HEAD(prList) ((prList)->head)
56
57 #define LIST_TAIL(prList) ((prList)->tail)
58
59 #define LIST_IS_HEAD(prList, prElement) ((prElement) == (prList)->head ? 1 : 0)
60
61 #define LIST_IS_TAIL(prElement) ((prElement)->next == NULL ? 1 : 0)
62
63 #define LIST_DATA(prElement) ((prElement)->data)
64
65 #define LIST_NEXT(prElement) ((prElement)->next)
66
67
68
69
70
71 /* special int list: stores ints by copying them (instead of storing
72  * pointers as generic list)
73  *
74  */
75
76 typedef list_t int_list_t;
77
78 #define INT_LIST_INIT(prList)  ListInit((prList), free)
79
80 #define INT_LIST_DESTROY(prList) ListDestroy((prList));
81
82 int IntListInsertNext(list_t *prList, list_elem_t *prElement, const int data);
83
84 #define INT_LIST_APPEND(prList, data) IntListInsertNext((prList), LIST_TAIL(prList), (data))
85
86 #define INT_LIST_PREPEND(prList, data) IntListInsertNext((prList), CLUSTALO_LIST_HEAD(prList), (data))
87
88 int IntListRemoveNext(list_t *prList, list_elem_t *prElement, int *data);
89
90 #define INT_LIST_SIZE(prList)   LIST_SIZE(prList)
91
92 #define INT_CLUSTALO_LIST_HEAD(prList) CLUSTALO_LIST_HEAD_INT((prList))
93
94 #define INT_LIST_TAIL(prList)  LIST_TAIL_INT((prList) )
95
96 #define INT_LIST_IS_HEAD(prList, prElement) LIST_IS_HEAD(prList, prElement) 
97
98 #define INT_LIST_IS_TAIL(prElement) LIST_IS_TAIL((prElement))
99
100 #define INT_LIST_DATA(prElement) LIST_DATA((prElement))
101
102 #define INT_LIST_NEXT(prElement) LIST_NEXT((prElement))
103
104
105 #endif