binaries/src/fasta34/altlib.h

   1
   2 /* $Name: fa_34_26_5 $ - $Id: altlib.h,v 1.9 2006/02/07 17:52:06 wrp Exp $ */
   3
   4 /* #ifdef UNIX */
   5 /* ncbi blast 1.3 format */
   6 /*
   7 #define NCBIBL13 11
   8 extern int ncbl_getliba();
   9 extern void ncbl_ranlib();
  10 void ncbl_closelib();
  11 */
  12 #define NCBIBL20 12
  13 /* #endif */
  14
  15 #ifdef MYSQL_DB
  16 #define MYSQL_LIB 16
  17 #define LASTLIB MYSQL_LIB+1
  18 #endif
  19
  20 #ifdef PGSQL_DB
  21 #define PGSQL_LIB 17
  22 #define LASTLIB PGSQL_LIB+1
  23 #endif
  24
  25 #if !defined (LASTLIB) && defined(NCBIBL20)
  26 #define LASTLIB NCBIBL20+1
  27 #endif
  28 #if !defined (LASTLIB)
  29 #define LASTLIB 10
  30 #endif
  31
  32 #define FASTA_F 0
  33 #define DEFAULT 0
  34 #define FULLGB 1
  35 #define UNIXPIR 2
  36 #define EMBLSWISS 3
  37 #define INTELLIG 4
  38 #define VMSPIR 5
  39 #define GCGBIN 6
  40 #define LASTTXT 6
  41
  42 int agetlib(); void aranlib();  /* pearson fasta format */
  43 int lgetlib(); void lranlib();  /* full uncompressed GB FULLGB*/
  44 int pgetlib(); void pranlib();  /* PIR UNIX protein UNIXPIR */
  45 int egetlib(); void eranlib();  /* EMBL/SWISS-PROT EMBLSWISS */
  46 int igetlib(); void iranlib();  /* Intelligenetics INTELLIG */
  47 int vgetlib(); void vranlib();  /* PIR VMS format */
  48 int gcg_getlib(); void gcg_ranlib();    /* GCG 2bit format */
  49
  50 #ifdef NCBIBL20
  51 extern int ncbl2_getliba(); /* ncbi blast 2.0 format */
  52 extern void ncbl2_ranlib();
  53 void ncbl2_closelib();
  54 #endif
  55
  56 #ifdef MYSQL_DB
  57 extern int mysql_getlib();
  58 extern void mysql_ranlib();
  59 int mysql_closelib();
  60 #endif
  61
  62 int (*getliba[LASTLIB])()={
  63   agetlib,lgetlib,pgetlib,egetlib,
  64   igetlib,vgetlib,gcg_getlib,agetlib,
  65   agetlib,agetlib
  66 #ifdef UNIX
  67   ,agetlib
  68 #ifdef NCBIBL13
  69   ,ncbl_getliba
  70 #else
  71   ,ncbl2_getliba
  72 #endif
  73 #ifdef NCBIBL20
  74   ,ncbl2_getliba
  75 #endif
  76 #ifdef MYSQL_DB
  77   ,agetlib
  78   ,agetlib
  79   ,agetlib
  80   ,mysql_getlib
  81 #endif
  82 #endif
  83 };
  84
  85 void (*ranliba[LASTLIB])()={
  86   aranlib,lranlib,pranlib,eranlib,
  87   iranlib,vranlib,gcg_ranlib,aranlib,
  88   aranlib,aranlib
  89 #ifdef UNIX
  90   ,aranlib
  91 #ifdef NCBIBL13
  92   ,ncbl_ranlib
  93 #else
  94   ,ncbl2_ranlib
  95 #endif
  96 #ifdef NCBIBL20
  97   ,ncbl2_ranlib
  98 #endif
  99 #ifdef MYSQL_DB
 100   ,aranlib
 101   ,aranlib
 102   ,aranlib
 103   ,mysql_ranlib
 104 #endif
 105 #endif
 106 };
 107
 108
 109 /* mmap()ed functions */
 110 #ifdef USE_MMAP
 111 int agetlibm(); void aranlibm();
 112 int lgetlibm(); void lranlibm();
 113 void vranlibm();
 114 int gcg_getlibm();
 115
 116 int (*getlibam[])()={
 117   agetlibm,lgetlibm, NULL, NULL,NULL,agetlibm,gcg_getlibm
 118 };
 119
 120 void (*ranlibam[])()={
 121   aranlibm,lranlibm,NULL,NULL,NULL,vranlibm,vranlibm
 122 };
 123 #endif