datamodel/compbio/data/sequence/Range.java

   1 /* Copyright (c) 2011 Peter Troshin\r
   2  *  \r
   3  *  JAva Bioinformatics Analysis Web Services (JABAWS) @version: 2.0     \r
   4  * \r
   5  *  This library is free software; you can redistribute it and/or modify it under the terms of the\r
   6  *  Apache License version 2 as published by the Apache Software Foundation\r
   7  * \r
   8  *  This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without\r
   9  *  even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the Apache \r
  10  *  License for more details.\r
  11  * \r
  12  *  A copy of the license is in apache_license.txt. It is also available here:\r
  13  * @see: http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0.txt\r
  14  * \r
  15  * Any republication or derived work distributed in source code form\r
  16  * must include this copyright and license notice.\r
  17  */\r
  18 package compbio.data.sequence;\r
  19 \r
  20 public class Range implements Comparable<Range> {\r
  21 \r
  22         public final int from;\r
  23         public final int to;\r
  24 \r
  25         private Range() {\r
  26                 // JAXB default constructor should not be used\r
  27                 from = 0;\r
  28                 to = from;\r
  29         }\r
  30 \r
  31         public Range(int from, int to) {\r
  32                 this.from = from;\r
  33                 this.to = to;\r
  34         }\r
  35 \r
  36         public Range(String[] twoElementAr) {\r
  37                 if (twoElementAr == null || twoElementAr.length != 2) {\r
  38                         throw new IllegalArgumentException();\r
  39                 }\r
  40                 this.from = Integer.parseInt(twoElementAr[0].trim());\r
  41                 this.to = Integer.parseInt(twoElementAr[1].trim());\r
  42         }\r
  43         \r
  44         @Override\r
  45         public String toString() {\r
  46                 return from + "-" + to;\r
  47         }\r
  48         \r
  49 \r
  50         @Override\r
  51         public int hashCode() {\r
  52                 final int prime = 31;\r
  53                 int result = 1;\r
  54                 result = prime * result + from;\r
  55                 result = prime * result + to;\r
  56                 return result;\r
  57         }\r
  58         @Override\r
  59         public boolean equals(Object obj) {\r
  60                 if (this == obj)\r
  61                         return true;\r
  62                 if (obj == null)\r
  63                         return false;\r
  64                 if (getClass() != obj.getClass())\r
  65                         return false;\r
  66                 Range other = (Range) obj;\r
  67                 if (from != other.from)\r
  68                         return false;\r
  69                 if (to != other.to)\r
  70                         return false;\r
  71                 return true;\r
  72         }\r
  73 \r
  74         /*\r
  75          *  Daniel messed with this method.\r
  76          *  It now compares Ranges based on \r
  77          */\r
  78         \r
  79 //      @Override\r
  80 //      public int compareTo(Range o) {\r
  81 //              if (o == null)\r
  82 //                      return 1;\r
  83 //              return new Integer(this.from).compareTo(new Integer(o.from));\r
  84 //      }\r
  85         \r
  86         @Override\r
  87         public int compareTo(Range o) {\r
  88                 if (o == null)\r
  89                         return 1;\r
  90                 if (new Integer(this.from).compareTo(new Integer(o.from)) != 0) {\r
  91                         return new Integer(this.from).compareTo(new Integer(o.from));\r
  92                 }\r
  93                 else {\r
  94                         return new Integer(this.to).compareTo(new Integer(o.to));\r
  95                 }\r
  96         }\r
  97 \r
  98 }\r