src/jalview/analysis/TreeCalculator.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($Version-Rel$)
   3  * Copyright (C) $Year-Rel$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.analysis;
  22
  23 import jalview.api.analysis.SimilarityParamsI;
  24
  25 /**
  26  * @author kjvanderheide
  27  *
  28  */
  29 public class TreeCalculator
  30 {
  31
  32   /**
  33    *
  34    * @param treeAlgo
  35    * @param substitutionMatrix
  36    * @param params
  37    */
  38   public TreeCalculator(String treeAlgo, String substitutionMatrix,
  39           SimilarityParamsI calculateParams)
  40   {
  41     // TODO Auto-generated constructor stub
  42   }
  43
  44
  45
  46 }