src/jalview/datamodel/CigarSimple.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.datamodel;\r
  20 \r
  21 /**\r
  22  * <p>Title: </p>\r
  23  *\r
  24  * <p>Description: </p>\r
  25  *\r
  26  * <p>Copyright: Copyright (c) 2004</p>\r
  27  *\r
  28  * <p>Company: Dundee University</p>\r
  29  *\r
  30  * @author not attributable\r
  31  * @version 1.0\r
  32  */\r
  33 public abstract class CigarSimple\r
  34     extends CigarBase\r
  35 {\r
  36   /**\r
  37    * Return a symbol sequence with edits (gaps, insertions and deletions) applied\r
  38    * @param GapChar char\r
  39    * @return String\r
  40    */\r
  41   public abstract String getSequenceString(char GapChar);\r
  42 \r
  43 }\r