src/jalview/ws2/operations/AbstractOperation.java

   1 package jalview.ws2.operations;
   2
   3 import jalview.ws.params.ParamDatastoreI;
   4 import jalview.ws2.WebServiceI;
   5
   6 /**
   7  * Common base for all operation classes which provides boilerplate
   8  * implementation for common {@link Operation} methods.
   9  *
  10  * @author mmwarowny
  11  *
  12  */
  13 public abstract class AbstractOperation implements Operation
  14 {
  15
  16   protected final WebServiceI service;
  17
  18   protected final String typeName;
  19
  20   protected boolean interactive = false;
  21
  22   protected boolean protOperation = true;
  23
  24   protected boolean nucOperation = true;
  25
  26   protected boolean alignmentAnalysis = false;
  27
  28   AbstractOperation(WebServiceI service, String typeName)
  29   {
  30     this.service = service;
  31     this.typeName = typeName;
  32   }
  33
  34   @Override
  35   public WebServiceI getWebService()
  36   {
  37     return service;
  38   }
  39
  40   @Override
  41   public String getName()
  42   {
  43     return service.getName();
  44   }
  45
  46   @Override
  47   public String getDescription()
  48   {
  49     return service.getDescription();
  50   }
  51
  52   @Override
  53   public String getTypeName()
  54   {
  55     return typeName;
  56   }
  57
  58   @Override
  59   public String getHostName()
  60   {
  61     return service.getHostName();
  62   }
  63
  64   @Override
  65   public boolean hasParameters()
  66   {
  67     return service.hasParameters();
  68   }
  69
  70   @Override
  71   public ParamDatastoreI getParamStore()
  72   {
  73     return service.getParamStore();
  74   }
  75
  76   @Override
  77   public int getMinSequences()
  78   {
  79     return 1;
  80   }
  81
  82   @Override
  83   public int getMaxSequences()
  84   {
  85     return Integer.MAX_VALUE;
  86   }
  87
  88   @Override
  89   public boolean canSubmitGaps()
  90   {
  91     return false;
  92   }
  93
  94   @Override
  95   public boolean isProteinOperation()
  96   {
  97     return protOperation;
  98   }
  99
 100   public void setProteinOperation(boolean value)
 101   {
 102     protOperation = value;
 103   }
 104
 105   @Override
 106   public boolean isNucleotideOperation()
 107   {
 108     return nucOperation;
 109   }
 110
 111   public void setNucleotideOperation(boolean value)
 112   {
 113     nucOperation = value;
 114   }
 115
 116   @Override
 117   public boolean isInteractive()
 118   {
 119     return interactive;
 120   }
 121
 122   public void setInteractive(boolean value)
 123   {
 124     interactive = value;
 125   }
 126
 127   @Override
 128   public boolean isAlignmentAnalysis()
 129   {
 130     return alignmentAnalysis;
 131   }
 132
 133   public void setAlignmentAnalysis(boolean value)
 134   {
 135     alignmentAnalysis = value;
 136   }
 137
 138   @Override
 139   public boolean getFilterNonStandardSymbols()
 140   {
 141     return false;
 142   }
 143
 144   @Override
 145   public boolean getNeedsAlignedSequences()
 146   {
 147     return false;
 148   }
 149
 150 }