src/org/vamsas/objects/core/AlignmentSequenceAnnotationDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.9M2</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package org.vamsas.objects.core;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import org.exolab.castor.mapping.AccessMode;\r
  15 import org.exolab.castor.xml.TypeValidator;\r
  16 import org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor;\r
  17 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
  18 \r
  19 /**\r
  20  * Class AlignmentSequenceAnnotationDescriptor.\r
  21  * \r
  22  * @version $Revision$ $Date$\r
  23  */\r
  24 public class AlignmentSequenceAnnotationDescriptor extends org.vamsas.objects.core.RangeAnnotationDescriptor {\r
  25 \r
  26 \r
  27       //--------------------------/\r
  28      //- Class/Member Variables -/\r
  29     //--------------------------/\r
  30 \r
  31     /**\r
  32      * Field nsPrefix\r
  33      */\r
  34     private java.lang.String nsPrefix;\r
  35 \r
  36     /**\r
  37      * Field nsURI\r
  38      */\r
  39     private java.lang.String nsURI;\r
  40 \r
  41     /**\r
  42      * Field xmlName\r
  43      */\r
  44     private java.lang.String xmlName;\r
  45 \r
  46     /**\r
  47      * Field identity\r
  48      */\r
  49     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
  50 \r
  51 \r
  52       //----------------/\r
  53      //- Constructors -/\r
  54     //----------------/\r
  55 \r
  56     public AlignmentSequenceAnnotationDescriptor() \r
  57      {\r
  58         super();\r
  59         setExtendsWithoutFlatten(new org.vamsas.objects.core.RangeAnnotationDescriptor());\r
  60         nsURI = "http://www.vamsas.org";\r
  61         xmlName = "AlignmentSequenceAnnotation";\r
  62         \r
  63         //-- set grouping compositor\r
  64         setCompositorAsSequence();\r
  65         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  66         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  67         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  68         //-- initialize attribute descriptors\r
  69         \r
  70         desc = (org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl) getFieldDescriptor("id", nsURI, org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  71         //-- validation code for: _id\r
  72         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
  73         { //-- local scope\r
  74         }\r
  75         desc.setValidator(fieldValidator);\r
  76         //-- _graph\r
  77         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_graph", "graph", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  78         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  79             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  80                 throws IllegalStateException\r
  81             {\r
  82                 AlignmentSequenceAnnotation target = (AlignmentSequenceAnnotation) object;\r
  83                 if(!target.hasGraph())\r
  84                     return null;\r
  85                 return (target.getGraph() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
  86             }\r
  87             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  88                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  89             {\r
  90                 try {\r
  91                     AlignmentSequenceAnnotation target = (AlignmentSequenceAnnotation) object;\r
  92                     // ignore null values for non optional primitives\r
  93                     if (value == null) return;\r
  94                     \r
  95                     target.setGraph( ((java.lang.Boolean)value).booleanValue());\r
  96                 }\r
  97                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
  98                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  99                 }\r
 100             }\r
 101             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 102                 return null;\r
 103             }\r
 104         };\r
 105         desc.setHandler(handler);\r
 106         desc.setRequired(true);\r
 107         desc.setMultivalued(false);\r
 108         addFieldDescriptor(desc);\r
 109         \r
 110         //-- validation code for: _graph\r
 111         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 112         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 113         { //-- local scope\r
 114             BooleanValidator typeValidator = new BooleanValidator();\r
 115             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 116         }\r
 117         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 118         //-- initialize element descriptors\r
 119         \r
 120         //-- _provenance\r
 121         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(org.vamsas.objects.core.Provenance.class, "_provenance", "Provenance", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 122         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 123             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 124                 throws IllegalStateException\r
 125             {\r
 126                 AlignmentSequenceAnnotation target = (AlignmentSequenceAnnotation) object;\r
 127                 return target.getProvenance();\r
 128             }\r
 129             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 130                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 131             {\r
 132                 try {\r
 133                     AlignmentSequenceAnnotation target = (AlignmentSequenceAnnotation) object;\r
 134                     target.setProvenance( (org.vamsas.objects.core.Provenance) value);\r
 135                 }\r
 136                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 137                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 138                 }\r
 139             }\r
 140             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 141                 return new org.vamsas.objects.core.Provenance();\r
 142             }\r
 143         };\r
 144         desc.setHandler(handler);\r
 145         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
 146         desc.setRequired(true);\r
 147         desc.setMultivalued(false);\r
 148         addFieldDescriptor(desc);\r
 149         \r
 150         //-- validation code for: _provenance\r
 151         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 152         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 153         { //-- local scope\r
 154         }\r
 155         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 156     } //-- org.vamsas.objects.core.AlignmentSequenceAnnotationDescriptor()\r
 157 \r
 158 \r
 159       //-----------/\r
 160      //- Methods -/\r
 161     //-----------/\r
 162 \r
 163     /**\r
 164      * Method getAccessMode\r
 165      * \r
 166      * \r
 167      * \r
 168      * @return AccessMode\r
 169      */\r
 170     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 171     {\r
 172         return null;\r
 173     } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode() \r
 174 \r
 175     /**\r
 176      * Method getExtends\r
 177      * \r
 178      * \r
 179      * \r
 180      * @return ClassDescriptor\r
 181      */\r
 182     public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 183     {\r
 184         return super.getExtends();\r
 185     } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends() \r
 186 \r
 187     /**\r
 188      * Method getIdentity\r
 189      * \r
 190      * \r
 191      * \r
 192      * @return FieldDescriptor\r
 193      */\r
 194     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 195     {\r
 196         if (identity == null)\r
 197             return super.getIdentity();\r
 198         return identity;\r
 199     } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity() \r
 200 \r
 201     /**\r
 202      * Method getJavaClass\r
 203      * \r
 204      * \r
 205      * \r
 206      * @return Class\r
 207      */\r
 208     public java.lang.Class getJavaClass()\r
 209     {\r
 210         return org.vamsas.objects.core.AlignmentSequenceAnnotation.class;\r
 211     } //-- java.lang.Class getJavaClass() \r
 212 \r
 213     /**\r
 214      * Method getNameSpacePrefix\r
 215      * \r
 216      * \r
 217      * \r
 218      * @return String\r
 219      */\r
 220     public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 221     {\r
 222         return nsPrefix;\r
 223     } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix() \r
 224 \r
 225     /**\r
 226      * Method getNameSpaceURI\r
 227      * \r
 228      * \r
 229      * \r
 230      * @return String\r
 231      */\r
 232     public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 233     {\r
 234         return nsURI;\r
 235     } //-- java.lang.String getNameSpaceURI() \r
 236 \r
 237     /**\r
 238      * Method getValidator\r
 239      * \r
 240      * \r
 241      * \r
 242      * @return TypeValidator\r
 243      */\r
 244     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 245     {\r
 246         return this;\r
 247     } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator() \r
 248 \r
 249     /**\r
 250      * Method getXMLName\r
 251      * \r
 252      * \r
 253      * \r
 254      * @return String\r
 255      */\r
 256     public java.lang.String getXMLName()\r
 257     {\r
 258         return xmlName;\r
 259     } //-- java.lang.String getXMLName() \r
 260 \r
 261 }\r