src/org/vamsas/test/simpleclient/ArchiveReader.java

   1 package org.vamsas.test.simpleclient;
   2
   3 import java.io.BufferedInputStream;
   4 import java.io.File;
   5 import java.io.InputStream;
   6 import java.io.InputStreamReader;
   7
   8 import org.vamsas.client.simpleclient.VamsasArchiveReader;
   9 import org.vamsas.objects.core.VAMSAS;
  10 import org.vamsas.objects.core.VamsasDocument;
  11
  12 public class ArchiveReader {
  13   public static void main(String args[]) {
  14
  15     try {
  16       File av = new File(args[0]);
  17       VamsasArchiveReader var = new VamsasArchiveReader(av);
  18       VAMSAS roots[]=null;
  19       if (var.isValid()) {
  20         InputStreamReader vdoc = new InputStreamReader(var.getVamsasDocumentStream());
  21         VamsasDocument doc = VamsasDocument.unmarshal(vdoc);
  22         if (ArchiveReports.reportDocument(doc, var)) {
  23           roots = doc.getVAMSAS();
  24         }
  25       } else {
  26         InputStream vxmlis = var.getVamsasXmlStream();
  27
  28         if (vxmlis!=null) { // Might be an old vamsas file.
  29           BufferedInputStream ixml = new BufferedInputStream(var.getVamsasXmlStream());
  30           InputStreamReader vxml = new InputStreamReader(ixml);
  31           VAMSAS root;
  32           // unmarshal seems to always close the stream (should check this)
  33           if ((root = VAMSAS.unmarshal(vxml))!=null) {
  34             System.out.println("Read a root.");
  35             roots = new VAMSAS[1];
  36             roots[0] = root;
  37           }
  38         }
  39       }
  40       if (!ArchiveReports.rootReport(roots))
  41         System.err.print(args[0]+" is not a valid vamsas archive.");
  42     } catch (Exception e) {
  43       e.printStackTrace(System.err);
  44     }
  45   }
  46 }