website/archive/binaries/mac/src/disembl/Tisean_3.0.1/source_c/av-d2.c

   1 /*
   2  *   This file is part of TISEAN
   3  *
   4  *   Copyright (c) 1998-2007 Rainer Hegger, Holger Kantz, Thomas Schreiber
   5  *
   6  *   TISEAN is free software; you can redistribute it and/or modify
   7  *   it under the terms of the GNU General Public License as published by
   8  *   the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
   9  *   (at your option) any later version.
  10  *
  11  *   TISEAN is distributed in the hope that it will be useful,
  12  *   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  13  *   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  14  *   GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  *   You should have received a copy of the GNU General Public License
  17  *   along with TISEAN; if not, write to the Free Software
  18  *   Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
  19  */
  20 /*Author: Rainer Hegger Last modified: Sep 3, 1999 */
  21 #include <stdio.h>
  22 #include <stdlib.h>
  23 #include <string.h>
  24 #include <math.h>
  25 #include <limits.h>
  26 #include "routines/tsa.h"
  27
  28 #define WID_STR "Smoothes the output of the d2 program"
  29
  30 #define MAXLENGTH 1000
  31
  32 unsigned int maxdim=UINT_MAX,mindim=1;
  33 unsigned int verbosity=0xff;
  34 int aver=1;
  35 char rescaled=0;
  36 char stout=1;
  37 char *outfile=NULL;
  38 char *infile=NULL;
  39
  40 void show_options(char *progname)
  41 {
  42   what_i_do(progname,WID_STR);
  43   fprintf(stderr,"Usage: %s [options]\n",progname);
  44   fprintf(stderr,"Options:\n");
  45   fprintf(stderr,"Everything not being a valid option will be interpreted"
  46           " as a possible datafile.\nStdin does NOT work.\n");
  47   fprintf(stderr,"\t-m dimension to start with [Default: 1]\n");
  48   fprintf(stderr,"\t-M dimension to end with [Default: whole file]\n");
  49   fprintf(stderr,"\t-a n average over (2n+1) values [Default: 1]\n");
  50   fprintf(stderr,"\t-E use rescaled data for the length scales\n\t\t"
  51           "[Default: use units of data]\n");
  52   fprintf(stderr,"\t-o name of output file [Default: stdout,\n\t\t"
  53           "-o without value means 'datafile'.av]\n");
  54   fprintf(stderr,"\t-V verbosity level [Default: 1]\n\t\t"
  55           "0='only panic messages'\n\t\t"
  56           "1='+ input/output messages'\n");
  57   fprintf(stderr,"\t-h show these options\n");
  58   exit(0);
  59 }
  60
  61 void scan_options(int n,char **in)
  62 {
  63   char *out;
  64
  65   if ((out=check_option(in,n,'m','u')) != NULL)
  66     sscanf(out,"%u",&mindim);
  67   if ((out=check_option(in,n,'M','u')) != NULL)
  68     sscanf(out,"%u",&maxdim);
  69   if ((out=check_option(in,n,'a','u')) != NULL)
  70     sscanf(out,"%u",&aver);
  71   if ((out=check_option(in,n,'V','u')) != NULL)
  72     sscanf(out,"%u",&verbosity);
  73   if ((out=check_option(in,n,'E','n')) != NULL)
  74     rescaled=1;
  75   if ((out=check_option(in,n,'o','o')) != NULL) {
  76     stout=0;
  77     if (strlen(out) > 0)
  78       outfile=out;
  79   }
  80 }
  81
  82 int main(int argc,char **argv)
  83 {
  84   char instr[1024];
  85   char *form1="%lf%lf",*form2="%*lf%lf%lf";
  86   char empty=0;
  87   unsigned int howmany,size=1;
  88   int j,k;
  89   long dim;
  90   double *eps,*y;
  91   double avy,aveps,norm;
  92   FILE *file,*fout=NULL;
  93
  94   if ((argc < 2) || scan_help(argc,argv))
  95     show_options(argv[0]);
  96
  97   scan_options(argc,argv);
  98 #ifndef OMIT_WHAT_I_DO
  99   if (verbosity&VER_INPUT)
 100     what_i_do(argv[0],WID_STR);
 101 #endif
 102
 103   infile=search_datafile(argc,argv,0L,verbosity);
 104   if (infile == NULL) {
 105     fprintf(stderr,"You have to give a datafile. Exiting!\n");
 106     exit(127);
 107   }
 108   if (outfile == NULL) {
 109     check_alloc(outfile=(char*)calloc(strlen(infile)+4,(size_t)1));
 110     sprintf(outfile,"%s.av",infile);
 111   }
 112
 113   check_alloc(eps=(double*)malloc(sizeof(double)*MAXLENGTH));
 114   check_alloc(y=(double*)malloc(sizeof(double)*MAXLENGTH));
 115
 116   file=fopen(infile,"r");
 117
 118   if (!stout) {
 119     test_outfile(outfile);
 120     fout=fopen(outfile,"w");
 121     if (verbosity&VER_INPUT)
 122       fprintf(stderr,"Opened %s for writing\n",outfile);
 123   }
 124   else {
 125     if (verbosity&VER_INPUT)
 126       fprintf(stderr,"Writing to stdout\n");
 127   }
 128
 129   if (mindim > maxdim)
 130     mindim=maxdim;
 131   norm=2.0*aver+1.0;
 132
 133   while (fgets(instr,1024,file) != NULL) {
 134     if (strlen(instr) != 1) {
 135       if (instr[0] == '#') {
 136         if (strstr(instr,"m= ") != NULL) {
 137           sscanf(instr,"%*s %ld",&dim);
 138           if ((dim >= mindim) && (dim <= maxdim)) {
 139             howmany=0;
 140             empty=0;
 141             do {
 142               if (fgets(instr,1024,file) == NULL)
 143                 exit(127);
 144               if (strlen(instr) == 1)
 145                 empty=1;
 146               if (!empty && (instr[0] != '#')) {
 147                 if (!rescaled)
 148                   sscanf(instr,form1,&eps[howmany],&y[howmany]);
 149                 else
 150                   sscanf(instr,form2,&y[howmany],&eps[howmany]);
 151                 howmany++;
 152                 if (!(howmany%MAXLENGTH)) {
 153                   check_alloc(realloc(eps,size*MAXLENGTH*sizeof(double)));
 154                   check_alloc(realloc(y,size*MAXLENGTH*sizeof(double)));
 155                   size++;
 156                 }
 157               }
 158             } while (!empty);
 159             for (k=aver;k<howmany-aver;k++) {
 160               avy=aveps=0.0;
 161               for (j= -aver;j<=aver;j++) {
 162                 avy += y[k+j];
 163                 aveps += eps[k+j];
 164               }
 165               if (!stout)
 166                 fprintf(fout,"%e %e\n",aveps/norm,avy/norm);
 167               else
 168                 fprintf(stdout,"%e %e\n",aveps/norm,avy/norm);
 169             }
 170             if (!stout)
 171               fprintf(fout,"\n");
 172             else
 173               fprintf(stdout,"\n");
 174           }
 175         }
 176       }
 177     }
 178   }
 179
 180   if (outfile != NULL)
 181     free(outfile);
 182   if (infile != NULL)
 183     free(infile);
 184   free(eps);
 185   free(y);
 186
 187   return 0;
 188 }