--open=./examples/test_fab41.result/sample.a2m --colour=clustal --structure=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_1_model_3.pdb --paematrix=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_1_model_3_scores.json --structure=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_2_model_4.pdb --paematrix=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_2_model_4_scores.json --structure=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_3_model_2.pdb --paematrix=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_3_model_2_scores.json --structure=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_4_model_5.pdb --paematrix=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_4_model_5_scores.json --structure=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_5_model_1.pdb --paematrix=./examples/test_fab41.result/test_fab41_unrelaxed_rank_5_model_1_scores.json --image=output1.html --close