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  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
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Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 48 | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | |
Predicted Secondary structure |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | A | S | Y | K | V | K | L | I | T | P | D | G | . | P | I | E | F | D | C | P | D | N | V | Y | I | L | D | Q | A | E | E | A | G | H | D | L | P | Y | S | C | R | A | G | S | C | S | S | C | A | G | K | I | A | G | G | A | V | D | Q | T |
Template Sequence |   | S | N | H | Q | V | A | L | Q | F | E | D | G | V | T | R | F | I | C | I | A | Q | G | E | T | L | S | D | A | A | Y | R | Q | Q | I | N | I | P | M | D | C | R | E | G | E | C | G | T | C | R | A | F | C | E | S | G | N | Y | D | M | P |
Template Known Secondary structure |   | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 2 | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . |
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  |   | 107 | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | D | . | . | . | . | G | N | F | L | D | D | D | Q | L | E | E | G | W | V | L | T | C | V | A | Y | P | Q | S | D | V | T | I | E | T | H | K | E | A | E | L | ||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | E | D | N | Y | I | E | D | A | L | T | P | E | E | A | Q | Q | G | Y | V | L | A | C | Q | C | R | P | T | S | D | A | V | F | Q | I | Q | A | S | S | E | V | ||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 62 | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | ||||||||||||||||||||
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Kelley LA et al. Nature Protocols 10, 845-858 (2015) [paper] [Citation link] | |||||||||
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