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  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
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Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 49 | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | ||
Predicted Secondary structure |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | S | Y | K | V | K | L | I | T | P | D | G | P | I | E | F | D | C | P | D | N | V | Y | I | L | D | Q | A | E | E | A | G | H | D | L | P | Y | S | C | R | A | G | S | C | S | S | C | A | G | K | I | A | G | G | A | V | D | Q | T | . | . |
Template Sequence |   | S | F | N | I | Q | S | . | . | D | D | L | L | H | H | F | E | A | D | S | N | D | T | L | L | S | A | A | L | R | A | E | L | V | F | P | Y | E | C | N | S | G | G | C | G | A | C | K | I | E | L | L | E | G | E | V | S | N | L | W | P |
Template Known Secondary structure |   | . | . | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||
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  |   | 107 | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | D | G | N | F | L | D | D | D | Q | L | E | E | G | W | V | L | T | C | V | A | Y | P | Q | S | D | V | T | I | E | T | H | K | E | A | E | L | V | G | ||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | D | A | P | G | L | A | A | R | E | L | R | K | N | R | F | L | A | C | Q | C | K | P | L | S | D | L | K | I | K | V | I | N | R | A | E | G | R | A | ||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | T | T | T | S | T | T | G | G | G | S | S | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 59 | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
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Kelley LA et al. Nature Protocols 10, 845-858 (2015) [paper] [Citation link] | |||||||||
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